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杨林

作品数：22 被引量：54H指数：4
供职机构：中国医学科学院北京协和医学院医学信息研究所更多>>
发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家社会科学基金北京市自然科学基金更多>>
相关领域：医药卫生自动化与计算机技术文化科学更多>>

合作作者

文献类型

  • 17篇期刊文章
  • 3篇专利
  • 2篇会议论文

领域

  • 15篇医药卫生
  • 6篇自动化与计算...
  • 5篇文化科学

主题

  • 5篇科学数据
  • 3篇生物医学
  • 3篇数据共享
  • 3篇数据管理
  • 3篇大数据
  • 2篇队列
  • 2篇医学教育
  • 2篇语义
  • 2篇生命周期
  • 2篇生命周期模型
  • 2篇数据挖掘
  • 2篇教育
  • 2篇共享
  • 2篇表型
  • 2篇表型分析
  • 1篇电子病历
  • 1篇电子设备
  • 1篇对齐
  • 1篇多模态
  • 1篇信息抽取

机构

  • 22篇中国医学科学...
  • 1篇首都医科大学...
  • 1篇北京协和医院
  • 1篇北京市大兴区...

作者

  • 22篇杨林
  • 17篇李姣
  • 7篇钱庆
  • 6篇吴思竹
  • 4篇侯丽
  • 2篇洪娜
  • 2篇马良坤
  • 2篇郑思
  • 2篇徐晓巍
  • 1篇范云满
  • 1篇杨啸林
  • 1篇高劲松
  • 1篇李子孝
  • 1篇郑慧霞
  • 1篇刘俊涛
  • 1篇方安
  • 1篇王军辉
  • 1篇刘燕
  • 1篇王序文
  • 1篇陈松景

传媒

  • 6篇中华医学图书...
  • 2篇医学信息学杂...
  • 2篇数据分析与知...
  • 1篇中国医院管理
  • 1篇图书情报工作
  • 1篇中国医学教育...
  • 1篇现代图书情报...
  • 1篇中国生物医学...
  • 1篇数字图书馆论...
  • 1篇中华健康管理...
  • 1篇中华医学会第...

年份

  • 2篇2024
  • 1篇2023
  • 3篇2022
  • 2篇2021
  • 3篇2020
  • 4篇2017
  • 2篇2016
  • 2篇2015
  • 3篇2014
共 22 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
NIH生物医学数据共享仓储分析
2017年
目的:对美国国立卫生研究院(NIH)的共享仓储进行分析,为生物医学科学数据领域相关研究和我国医学科学数据共享仓储建设提供参考和借鉴。方法:对UniProt、Protein Data Bank、GenBank等10个典型的数据共享仓储进行对比分析,总结其在数据获取方式、数据管理及共享模式、服务方式等方面的经验。结果:各仓储根据自身特性,设计了符合自身特点的数据管理链条及流程规范。结论:我国可借鉴美国国立卫生研究院生物医学数据共享仓储的建设经验,设计数据服务工具、开展半人工半自动模式的数据审核,收集尽可能详尽的元数据,并制定符合自身仓储特点的引用规范等。
马鹤桐吴思竹杨林郑慧霞
关键词：科学数据数据管理数据共享
数据驱动的科学工作流及其在生物医学中的应用实践
2014年
E—science关注数字环境下的科研活动，然而随着生物医学大数据的爆发，数据密集型科学研究为e·Science~来了新的挑战。科学工作流通过形式化科学计算的流程，支持在一个专门的程序环境下自动协调多任务多步骤的处理，从而减少科研投入，提高科研效率。文章首先归纳筑总结了科学工作流的相关定义，然后分析了当前主流的科学工作流系统，提出科学工作流处理如何应对密集的生物医学数据，并基于Taverna开展了生物医学领域的科学工作流实验。最后总结了科学工作流当前的研究现状和存在的一些问题。
洪娜钱庆方安吴思竹杨林
关键词：科学工作流
中国、美国、英国精准医学计划比较研究被引量：15
2017年
选取具有国际影响力的中国、美国和英国三国的精准医学计划,简述计划主要目标和主要任务,从计划组织实施和数据管理共享方面进行比较分析,并总结获得的部分启示,以期为我国开展精准医学研究重点专项提供有益参考和借鉴。
吴思竹钱庆杨林
关键词：基因组数据管理
基于BERT-TextCNN的临床试验疾病亚型识别研究被引量：3
2022年
【目的】面向复杂疾病临床试验招募的需求,提出一种基于BERT-TextCNN的临床试验疾病亚型识别方法,辅助识别复杂疾病特定亚型的受试人群。【方法】将临床试验疾病亚型识别问题转化为单标签分类问题,应用基于BERT-TextCNN的单标签分类模型进行分类,以卒中为例在临床试验数据集(ClinicalTrials.gov)上开展实验验证。【结果】基于LP法的BERT-TextCNN模型性能最佳,加权宏平均F1值为0.9053,可以有效判定一项卒中临床试验可纳入卒中亚型受试者情况。【局限】缺乏在其他单病种上的可行性研究,以及在外部数据集上的有效性验证。【结论】本文方法可以有效解决从纳入标准中准确识别复杂疾病亚型的问题。
杨林黄晓硕王嘉阳丁玲玲李子孝李姣
关键词：文本分类卒中
应用于专病临床试验的队列识别方法及装置
本发明公开了一种应用于专病临床试验的队列识别方法及装置，基于预创建的专病临床试验入排标准的知识体系，生成专病临床试验入排标准的查询信息；获取电子病历数据，并对电子病历数据进行信息分析，得到专病表型分析信息；基于专病表型分...
杨林李姣黄晓硕
文献传递
跨领域数据审编(Curation)流程研究——以环境健康数据为例被引量：2
2015年
【目的】顺应环境健康跨领域科学数据管理需求,探索跨领域数据的审编工作流程,为推进相关领域数据管理工作提供可行性方案。【方法】基于环境健康领域研究,在DCC审编生命周期模型指导下,构建环境健康数据审编工作流程,明确各审编模块的内容以及人工审编、自动化审编的边界。【结果】应用构建的工作流审编气象环境数据与医院就诊数据,可支撑医药卫生知识服务系统中环境健康数据部分的审编工作,结果显示环境健康数据审编工作流程具有一定的可操作性。【局限】由于需求的多样性,流程在实际操作时需要在数据模型、数据规范化等方面进一步细化。【结论】环境健康数据审编流程能够有效地组织不同专业背景的审编人员,兼顾数据质量和数据规模两方面的考量,在解决跨领域数据审编方面具有一定的可操作性。
杨林李姣侯丽钱庆
关键词：环境健康
人机交互技术在解剖学教育中的应用被引量：2
2021年
阐述人机交互技术在解剖学教育中的应用,介绍人机交互技术相关教学工具,对比传统教学工具与人机交互教学工具在解剖学教学中的优劣势,促进教育工作者采用新型教学技术。
马鹤桐杨林李姣
关键词：人机交互智能技术
基于语义对齐的临床量表信息提取方法及其临床试验队列识别的应用研究被引量：2
2020年
【目的】面向真实世界数据驱动的临床研究需求,提出一种基于语义对齐的临床量表信息提取方法,辅助识别潜在受试人群。【方法】选取卒中量表NIHSS,分析量表信息在临床试验和真实世界电子病历中的特征,构建基于语义对齐的量表信息提取方法,应用临床试验数据集(ClinicalTrials.gov)和开放电子病历数据集MIMIC-Ⅲ开展实验验证。【结果】从患者出院小结中抽取NIHSS总评分、检查项评分的F1值分别为0.9535和0.9267;围绕两项匹配NIHSS纳排标准的测试任务,可以有效地识别出潜在受试人群。【局限】缺乏在其他量表上的可行性研究,以及在真实临床试验环境中的有效性和可靠性验证。【结论】本方法可以有效地解决临床量表信息在临床研究与电子病历数据的语义一致性问题。
杨林黄晓硕王嘉阳李姣
基于USGS生命周期模型的肿瘤流行病学数据管理研究被引量：1
2017年
随着科研数据的增长,对海量数据进行有效的管理和利用成为科学数据共享的研究重点之一。基于USGS数据生命周期模型,以国际癌症研究中心(IARC)发布的肿瘤流行病学发病数据和相应的人口数据为分析对象,介绍了数据的整合与管理方法,为科研人员提供整合和管理科学数据的具体案例和可行性方法,为制定宏观政策提供基础数据和知识支撑。通过使用USGS数据生命周期模型,实现了对不同类型数据的对比分析,验证了数据生命周期模型在数据管理方面的有效性。
刘燕杨林侯丽李姣
关键词：科学数据流行病学肿瘤
一种食谱确定方法、系统、存储介质及电子设备
本发明实施例提供了一种食谱确定方法、系统、存储介质及电子设备。其中，该方法包括：基于目标用户的用户信息生成目标用户画像特征；基于所述目标用户画像特征与候选特征的相似度计算结果，生成第一食谱集合；基于所述用户信息和营养素摄...
李姣徐子犊杨林
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