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利用基因组数据分析水稻基因顺式作用元件被引量：1: 2006年; 为了研究籼粳亚种基因调控序列的总体特性,我们利用籼粳稻以及拟南芥基因组和全长mRNA序列获取了大量高可信度的调控序列,通过这些序列,分析了水稻基因调控序列顺式作用元件(信号)的数量、分布以及与GC含量的关系等．研究结果表明:一些信号在水稻基因调控序列中发生显著的数量变化,同时一些信号数量在水稻与拟南芥基因间存在明显差异, 这说明这两种单双子叶植物间信号的使用上存在偏好,同时水稻不同类型基因以及特有与非特有基因间在信号的使用上也存在差异．这些差异信号的分布直接导致了调控序列GC含量的波动．本研究没有发现水稻籼粳两个亚种间在调控序列方面(顺式调节因子和GC含量等)存在明显差异．; 张扬徐国华徐飞樊龙江; 关键词：水稻基因组顺式作用元件籼粳亚种拟南芥 GC含量

JAK-STAT信号通路研究进展被引量：15: 2003年; AK(Janus激酶 ) -STAT(信号转导子和转录激活子 )信号通路是与细胞生长、增殖和分化关系十分密切的一条细胞信号通路 ,近年来发展迅速 .本文对通路中细胞表面受体、JAK、STAT等几个关键环节的分子结构、相互作用及调控因素进行了总结 .; 陈晓萍徐飞; 关键词：JAK 信号通路 JANUS激酶信号转导子转录激活子细胞表面受体

家蚕基因组中SnoRNA(Box C/D)的生物信息学分析与研究: 2007年; 【目的】探索生物信息方法在家蚕基因组snoRNA预测中的应用,了解snoRNA在家蚕基因组的分布和结构特征。【方法】利用已有和自行设计的生物信息工具对家蚕基因组中BoxC/DsnoRNA进行预测和手工校正。【结果】获到家蚕基因组中的70个snoRNA和56个推测的甲基化位点。结构分析发现D′box和末端茎环结构的不保守性;分析snoRNA在基因组上的分布,未发现普遍的成簇分布的现象,且内含子和基因间隔区的snoRNA数目接近;预测得到的家蚕BoxC/DsnoRNA与已报道果蝇BoxC/DsnoRNA进行相似性分析,表明两个物种的BoxC/DsnoRNAs在一级结构上存在较大的差异。【结论】基于结构特征预测的方法有利于逐步揭示家蚕基因组中存在的snoRNA信息;但与家蚕同源关系较近的物种,其snoRNA在序列上可能有较大变化,故可能不适合以序列同源来对其进行预测。; 余东亮汪旭升徐飞傅衍; 关键词：BOX SNORNA 甲基化非编码RNA

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徐飞