采用表型性状和SSR分子标记2种聚类方法对中国分布的3组12份野生蕉进行多样性分析，表型聚类以芭蕉属种质资源25核心表型性状为依据．将供试材料分为两大类，其中染色体数为10对的红花蕉组分为一组．染色体数为11对的真蕉组和观赏蕉组分为一组。除胍60400分到观赏蕉组外，其他的材料因形态特征的明显差异分为真蕉组和观赏蕉组两个亚类。SSR分子标记采用12对多态性较好的SSR引物，共产生51个多态性条带．供试的12个材料相似系数范围为0．60～0．96，供试材料分为3类，供试的真蕉组材料和M.paracoccinea, M. yunnanensis聚为一组，观赏蕉组的材料聚为一组，红花蕉组的M．coccinea聚为一组。研究结果表明．我同野生蕉种质资源丰富．对其分类需将形态特征与分子标记相结合进行综合分析。
利用PCR和PCR产物直接序列分析技术,获得了芭蕉属42份材料ccb256线粒体DNA片段的序列。采用MEGA4软件构建了芭蕉属植物的MP树。结果表明,Australimusa组和Callimusa组聚到一起,真蕉组的AA、其它种和观赏蕉组聚到一起,无法明显区分。真蕉组的BB单独聚到一起,且位于MP的基部,揭示了其在芭蕉属植物进化中占据着最原始的地位。另外,栽培蕉Ice cream(ABB)与M.balbisiana聚到一起,可能是由M.balbisiana为父本提供B型供体杂交而来,而除Improved lady finger(AAB)外,其它的栽培蕉均与M.acuminata的亚(变)种聚到一起,推测由M.acuminata为父本提供A型供体杂交而来。被认为是所有栽培蕉最原始亲本的M.acuminata.ssp.banksii与大量的栽培蕉聚到了一组,证明其与栽培蕉具有较近的亲缘关系。结果还表明ccb256序列进化速率适中,能用于研究芭蕉属内种间及亚种间的系统进化关系。
