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国家自然科学基金(30670361)

作品数:12 被引量:33H指数:4
相关作者:任竹梅马恩波段立柱李继变钟扬更多>>
相关机构:山西大学复旦大学上海生物信息技术研究中心更多>>
发文基金:山西省自然科学基金国家自然科学基金中国博士后科学基金更多>>
相关领域:生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 6篇中文期刊文章

领域

  • 5篇生物学
  • 1篇农业科学

主题

  • 3篇角倍
  • 3篇角倍蚜
  • 3篇倍蚜
  • 2篇资源昆虫
  • 2篇昆虫
  • 2篇MTDNA
  • 2篇AFLP技术
  • 1篇亚科
  • 1篇盐肤木
  • 1篇遗传分化
  • 1篇种群
  • 1篇蛱蝶
  • 1篇蛱蝶科
  • 1篇系统发育
  • 1篇系统发育分析
  • 1篇环境因子
  • 1篇基因
  • 1篇基因组DNA...
  • 1篇发育分析
  • 1篇分歧

机构

  • 5篇山西大学
  • 3篇复旦大学
  • 1篇山西省农业科...
  • 1篇上海生物信息...

作者

  • 5篇任竹梅
  • 2篇马恩波
  • 2篇段立柱
  • 2篇钟扬
  • 1篇吕姝媛
  • 1篇曹天文
  • 1篇李继变
  • 1篇郭亚平
  • 1篇施婧
  • 1篇金科
  • 1篇张敏
  • 1篇庞雅文

传媒

  • 1篇昆虫学报
  • 1篇科学通报
  • 1篇复旦学报(自...
  • 1篇广西植物
  • 1篇生态学杂志
  • 1篇Agricu...

年份

  • 1篇2011
  • 1篇2010
  • 1篇2009
  • 3篇2008
12 条 记 录,以下是 1-6
排序方式:
资源昆虫角倍蚜遗传多样性及遗传分化的AFLP分析被引量:4
2010年
本研究采用AFLP分子标记技术对资源昆虫角倍蚜Schlechtendalia chinensis6个种群共102个个体的样本进行遗传多样性分析,探讨角倍蚜主要分布区不同种群之间的遗传分化及其变异程度,为合理利用和保护该经济昆虫提供分子方面的证据。结果表明:经过摸索实验筛选出的4对选择性扩增引物共扩增条带126条,多态性条带比例为100%,种群多态性位点比例介于23.81%~66.67%之间;Nei’s基因多样性指数介于0.0942~0.1980之间;Shannon’s多样性数介于0.1381~0.3027之间;AMOVA分析显示57.99%的变异来源于种群内,42.41%的变异来源于种群间(P<0.01);总群体的Fst值为0.4242;NJ聚类树显示角倍蚜6个种群共形成两个大的聚类簇,阳雀、丹寨和汉中种群聚为一支,安县、竹山和龙胜3个种群聚为另一支。总体上,角倍蚜种内的遗传多样性较低,而种群间的遗传分化较大,遗传距离与地理距离之间没有显著的相关关系(P>0.05)。
吕姝媛段立柱马恩波任竹梅
关键词:角倍蚜AFLP技术
Molecular Phylogenetic Analysis of the Main Lineages of Nymphalinae(Nymphalidae: Lepidoptera) Based on the Partial Mitochondrial COI Gene
2008年
The phylogenetic relationships of the subfamily Nymphalinae (sensu Chou 1994) were analyzed based on 1 488 bp of mtDNA cytochrome oxidase subunit I (COI) gene sequence data obtained from 24 individuals, along with those of eight species obtained from GenBank. The base compositions of this COI fragment varied among the individuals as follows: T 39.9%, C 14.6%, A 32.2%, and G 13.4%, with a strong AT bias (72.1%), as usually found in insect mitochondrial genomes. The A +T contents of the third, second, and first codon positions of the COI fragments in this study was 92.4, 62.2, and 61.4%, respectively. The phylogenetic trees were reconstructed by neighbor-joining (NJ), maximum likelihood (ML), and Bayesian methods by using Byblia anvatara as outgroup. Phylogenetic analyses based on the COI gene sequence data created very similar topologies, which were producing trees with two main clades A and B, and five subclades. The data indicated that the tribes Nymphalini and Hypolimni (sensu Chou 1994) are not monophyletic groups, and the genus Junonia should be removed from Nymphalini to Hypolimni (=Junoniini). On the basis of the data, the Symbrenthia and Araschnia had a relative distant relationship with the rest of Nymphalini. The relationships of species in the Nymphalini were confirmed via the NJ, ML, and Bayesian methods, namely ((((Nymphalis + Kaniska) + Polygonia) +Aglais) + Vanessa) + (Symbrenthia +Araschnia). This investigation provides a little novel information for Chinese researches of butterflies.
ZHANG MinCAO Tian-wenZHONG YangREN Zhu-meiGUO Ya-pingMA En-bo
关键词:MTDNA
蛱蝶科亚科间的分歧时间估计被引量:3
2008年
基于自行测定的以及GenBank收录的线粒体COI基因和核EF-la仅基因序列,应用最大似然法、贝叶斯推断法及马尔可夫链蒙特卡罗方法探讨了世界蝶类最大科——蛱蝶科亚科间的系统发育关系,并对该科分子系统发育树各分支间的进化速率进行了差异显著性检验.结合眼蝶亚科、蛱蝶亚科和瑟蛱蝶亚科的化石资料,获得了蛱蝶科所有12个亚科间首次分歧时间的平均估计值,为44.2-87.1Ma.研究结果有助于人们深入了解该科的起源与进化以及估计蝶类和其他复杂类群的分歧时间.
张敏曹天文金科任竹梅郭亚平施婧钟扬马恩波
关键词:蛱蝶科系统发育分析分歧时间COI
角倍蚜mtDNA Cyt b基因遗传多样性分析被引量:10
2009年
测定了中国1 0个不同地域角倍蚜(Schlechtendalia chinensis)1 3 2个个体的mtDNA Cyt b基因部分序列、比较其同源性、计算核苷酸组成及其变异指数、分析其种群遗传变异及遗传结构、并构建不同单倍型之间的网络和聚类图.在测得的4 3 2 bp Cyt b基因序列中有4 1个核苷酸位点存在变异(占所测核苷酸序列的9.5%),T、C、A、G 4种核苷酸的组成分别为4 5.5%、1 4.4%、3 1.5%和8.6%,具有较高的A+T含量(7 7.0%);1 3 2个角倍蚜个体共产生3 1个单倍型,其中单倍型M1M4为主体单倍型,各单倍型在种群间分布不平衡,单倍型多样度平均为0.8 2 5±0.0 2 2.角倍蚜种群内各序列平均核苷酸差异数为2.2 2 7,核苷酸多样度为0.0 0 5 2±0.0 0 0 6,遗传多态性不高.AMOVA分析显示角倍蚜种群内的遗传变异(7 6.5 0%)高于种群间的遗传变异(2 3.5 0%),FST统计结果表明我国角倍蚜种群间存在一定程度的遗传分化.基于单倍型的系统树和网络关系图显示,除个别单倍型外,所有各种群的单倍型在系统聚类.树中基本表现出一种平行式的分布格局,即单倍型并没有按地理分布形成明显的簇群,M1M4可能为原始单倍型.
李继变任竹梅
关键词:角倍蚜MTDNACYTB基因DNA序列
贵州省八个种群角倍蚜ISSR遗传多样性被引量:10
2008年
基于ISSR分子标记技术对采自贵州省8个种群共139个角倍蚜样本进行遗传多样性及其与环境因子的相关性分析。筛选的12条引物共扩增出多态性条带133条,没有种群特异带出现,平均每个引物扩增的多态带数为11条,Popgene软件分析显示,总群体多态性条带比率为100%,尽管不是特意选择变异高的引物。种群间遗传相似系数变异范围介于0.899~0.955,遗传距离介于0.046~0.106,说明角倍蚜不同种群之间的遗传分化不大。聚类分析显示,8个种群共形成2个大的聚类簇,各种群之间没有明显的地域性分布规律,但遗传多样性与3月温度和3月降水量呈负相关。
王定江杨汉远钟扬任竹梅
关键词:角倍蚜资源昆虫ISSR环境因子
盐肤木基因组DNA提取方法改进及AFLP体系的建立被引量:2
2011年
经过反复试验,摸索出一种提取高质量植物基因组DNA的方法:改良的4×CTAB法。以盐肤木叶片为实验材料,提取到高质量的基因组DNA,建立了酶切、连接、预扩增、选择性扩增的AFLP反应体系。通过两种引物组合"E+3/M+3"和"E+2/M+3"策略筛选出8对条带分辨率高、多态性好的引物组合,优化了盐肤木的AFLP银染反应体系,得到了清晰的AFLP指纹图谱,为盐肤木种群遗传多样性研究奠定了基础。
庞雅文段立柱宋德应任竹梅
关键词:盐肤木DNA提取AFLP技术
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