江苏省自然科学基金(BK2010298)
- 作品数：4 被引量：6H指数：2
- 相关作者：苏一军张学余屠云洁李国辉殷建玫更多>>
- 相关机构：中国农业科学院家禽研究所更多>>
- 发文基金：江苏省自然科学基金江苏省农业科技支撑计划项目国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 几个地方鸡种MHCB-G座位克隆与生物信息学分析被引量：1
- 2012年
- 本研究利用PCR和克隆测序方法,克隆新狼山鸡和仙居鸡MHC B-G基因全序列,分析序列的多态性并预测其蛋白质的结构与功能,为更好地保护地方鸡种提供基础资料。结果表明:分别获得新狼山鸡和仙居鸡MHCB-G基因6 183 bp和6 415 bp全序列,与红色原鸡同源性达98%,3鸡种存在148个变异位点,为3个单倍型,单倍型多样度为0.07407,仙居鸡在4413-4661位置缺失249 bp;利用生物信息学预测新狼山鸡和仙居鸡MHCB-G蛋白,该蛋白具有丰富的B细胞抗原位点;新狼山鸡和仙居鸡有明显的跨膜螺旋结构,分别含有138个和98个磷酸化位点;MHC B-G基因具有丰富的遗传多样性,该MHC B-G蛋白可能是抗原位点的富集区,对其进化、抗原递呈作用以及疾病和生产性能的相关性发生重要影响。
- 屠云洁苏一军张学余李国辉
- 关键词：MHC克隆生物信息学
- 江西2个地方鸡品种MHC B-G座位多态性及生物信息学分析被引量：3
- 2013年
- 利用PCR和测序技术获得江西安义瓦灰鸡和东乡绿壳蛋鸡MHC B-G基因全序列,分析其序列多态性,并预测其蛋白质结构与功能。结果表明:瓦灰鸡和东乡绿壳蛋鸡MHC B-G基因全序列大小分别为6 427和6 107bp,2个鸡品种存在216个变异位点,均为单一多态位点,共缺失624bp。核苷酸多样度(Pi)为0.037 2,平均核苷酸差异(K)为216。2个鸡品种MHC B-G蛋白的二级结构以无规则卷曲和延伸链为主,且具有明显的跨膜螺旋结构,疏水性、柔韧性、表面可能性及抗原性预测结果显示,该蛋白具有丰富的B细胞抗原位点,分别含有108和85个磷酸化位点。MHC B-G蛋白在2个鸡品种中功能类似,但存在一定差异,2个鸡品种MHC B-G蛋白均在运输与合成功能方面可能性均最大。此外,瓦灰鸡MHC B-G蛋白主要承担生物合成辅因子的功能,在转录方面发挥重要作用;而MHC B-G蛋白在东乡绿壳蛋鸡中主要承担阳离子通道的作用。
- 屠云洁苏一军李国辉张学余殷建玫
- 关键词：MHC基因多样性生物信息学
- 9个地方鸡种MHC B-G座位多态性及其分子系统进化分析被引量：2
- 2012年
- 以我国9个地方鸡为研究对象,对其MHC B-G座位全基因序列进行测序,以揭示这9个地方鸡种MHC B-G基因的遗传多样性,并构建其系统进化树.结果表明,9个地方鸡种MHC B-G基因序列具有较高的遗传多样性,在9个地方鸡种中共存在666个突变位点,其中单一位点突变554个,简约信息112个,共缺失782 bp.核苷酸多样度(Pi)为0.030 79±0.004 39,平均核苷酸差异(K)为182.639.9个地方鸡品种为9个单倍型,单倍型多样度为1.00±0.052.9个鸡种MHC B-G基因Kiumura双参数遗传距离范围为0.010～0.070,鹿苑鸡与新狼山鸡的遗传距离最小,为0.010;茶花鸡与东乡绿壳蛋鸡遗传距离最大,为0.070.根据9个鸡品种MHC B-G基因全序列构建的NJ树和ME树,茶花鸡单独聚为1类,其他8个品种被聚为2大类.Tajima's D值为-1.554 6,且差异不显著(0.10>P>0.05),说明MHC B-G基因为负向选择,不遵循中性进化理论,MHC B-G基因多态性不是遗传漂变的结果,而是自然选择和人工选择的结果.
- 屠云洁苏一军王克华张学余李国辉殷建玫
- 关键词：多样性MHC进化
- 雏鹅冷应激反应中HPA、HPT轴应激激素相关基因表达调控规律被引量：1
- 2011年
- 以7日龄皖西白鹅为试验对象,研究于（12±1）℃条件下进行急性冷应激处理时对HPA、HPT轴的影响。利用荧光定量逆转录PCR（FQ-RT-PCR）技术动态研究冷应激反应中应激激素相关基因TRH、TSH、CRH、ACTH基因mRNA的变化规律。研究结果表明,下丘脑TRH基因mRNA转录量在冷应激0.5 h3、h、6 h9、h1、8 h与应激结束后1 h6、h和12 h显著升高,其他时间内均下降到室温时的转录水平。垂体TSH基因mRNA转录量在冷应激1.5 h到12 h期间显著升高,应激12 h时转录水平达到最高点,而其他应激时间均降低到应激前的水平,应激结束后1 h到6 h期间垂体TSH基因mRNA转录水平也被显著升高,冷处理结束后9~24 h已恢复到应激前的正常水平。下丘脑CRH基因mRNA转录量在冷应激3h、9 h1、8 h时与应激结束后0.5 h、1 h和9 h显著升高,其他时间点降到应激前的正常水平。肾上腺ACTH基因mRNA转录水平在冷应激1.5~9 h、18 h时显著升高,其他时间点均迅速下降到应激前水平;冷处理结束后0.5 h和3 h,由于又突然受到热的室温应激,ACTH基因mRNA转录量又显著升高,其他时间点降到应激前的正常水平。下丘脑TRH基因mRNA表达呈现波动性变化趋势,但表达量均不超过1.5,说明下丘脑TRH基因是负调控的。下丘脑CRH、垂体TSH和肾上腺ACTH基因mRNA的表达量分别在2.27~7.76、1.75~6.17、5.5~14.83范围内,总体呈上升趋势,说明TSH、CRH和ACTH基因均是冷应激反应时的正调控基因。
- 屠云洁苏一军张学余李国辉
- 关键词：冷应激HPA轴
