吕超
- 作品数：5 被引量：19H指数：3
- 供职机构：中国疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项中国全球基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- HIV-1早期感染婴儿病毒亚型及env区V3环氨基酸特征分析
- 2013年
- 目的分析中国I型艾滋病病毒(HIV-1)感染婴儿基因亚型的分布情况,以及env区V3环氨基酸序列特征。方法利用巢式聚合酶链反应(nPCR)扩增HIV-1前病毒脱氧核糖核酸(DNA)env区和pol区的基因序列,使用ChromasPro、MEGA 4.0、BioEdit软件进行HIV-1基因分型以及env区V3环氨基酸序列的特征分析。结果对65名HIV-1感染婴儿的100份干血斑样本(DBS)分别进行HIV-1 env区和pol区扩增,最终扩增成功的样本为63份和84份;其中45名感染婴儿的59份DBS两基因区均扩增成功。依据两基因区域均扩增成功的45名感染婴儿样本进行基因分型,结果为:CRF_BC亚型占73.3%(33/45,包括CRF_07-BC 21份,CRF_BC-08 11份),CRF01-AE亚型占20.0%(9/45),B′亚型占4.4%(2/45),G亚型占2.2%(1/45)。对env区扩增成功的63份样本的V3环顶端四肽特征序列进行分析,结果显示存在5种类型,分别为GPGQ、GPGR、GPGS、GLGR和GQGR,以GPGQ为主。53份样本可能使用CCR5作为辅助受体,3份样本可能使用CXCR4作为辅助受体,7份样本不能做出预测。结论婴儿感染的HIV-1亚型呈现多样性分布;HIV-1V3环顶端氨基酸序列以GPGQ为主;大部分婴儿样本可能使用CCR5作为辅助受体。
- 汪静蒋岩吕超李晶姚均
- 关键词：婴儿氨基酸
- 《动物研究:体内实验报告》即ARRIVE 2.0指南的解释与阐述(三)被引量：2
- 2023年
- 提高生物医学研究结果的可重复性是一项重大挑战,研究人员透明且准确地报告其研究过程有利于读者对该研究结果的可靠性进行评估,进而重复该实验或在该成果的基础上进一步探索。ARRIVE 2.0指南是英国国家3Rs中心(NC3Rs)于2019年组织发布的一份适用于任何与活体动物研究报告相关的指导性清单,用以提高动物体内实验设计、实验实施和实验报告的规范性,以及动物实验结果的可靠性、可重复性和临床转化率。ARRIVE 2.0指南的使用不仅可以丰富动物实验研究报告的细节,确保动物实验结果信息被充分评估和利用,还可以使读者准确且清晰地了解作者所表述的内容,促进基础研究评审过程的透明化和完整性。目前,ARRIVE 2.0指南已经被国际生物医学期刊广泛采纳。本文是在国际期刊遵循ARRIVE 2.0指南的最佳实践基础上,对2020年发表于PLoS Biology期刊上的ARRIVE 2.0指南完整解读版(原文请见https://arriveguidelines.org)进行中文编译(第三部分包括“关键10条”里的第8~10条:“实验动物”、“实验步骤”和“结果”部分),以期促进国内研究人员充分理解并使用ARRIVE 2.0指南,提高实验动物研究及报告的规范性,助推我国实验动物科技与比较医学研究的高质量发展。
- 刘晓宇卢选成师晓萌张雨舟吕超陈国元卢晓白玉高静李垚刘永刚陶雨风庞万勇
- 关键词：动物实验实验动物
- 四川凉山静脉吸毒人群HIV感染者中HLA-B*5701阳性率的研究被引量：4
- 2011年
- 目的了解四川凉山彝族自治州静脉吸毒人群(IDUs)艾滋病病毒(HIV)感染者中,人白细胞抗原I类基因B座位5701等位基因(HLA-B*5701)的阳性率,并与国内外其他民族的研究数据进行比较。方法采用序列特异性引物(SSP)对基因组DNA进行聚合酶链式(PCR)扩增,通过琼脂糖凝胶电泳读取结果,电泳条带呈HLA-B*5701阳性的再通过测序进行HLA-B分型验证。结果 1 043名HIV阳性感染者中,5人携带HLA-B*5701等位基因,阳性率为0.479%。其中汉族人口230人,3例携带HLA-B*5701等位基因(阳性率1.30%);彝族人口813人,2例携带HLA-B*5701等位基因(阳性率0.246%)。结论凉山IDUs人群HIV感染者中HLA-B*5701的阳性率较低,低于国外对黑种人及白种人的研究数据,汉族人群与彝族人群相比较差异无统计学意义。
- 李星美姚均马名驹卫大英吕超张传刚蒋岩
- 关键词：静脉吸毒人群艾滋病病毒
- 三种HIV-1基因型耐药检测方法的一致性评价被引量：5
- 2013年
- 目的 比较In-house HIV-1基因型耐药检测方法与TRUGENETM、ViroSeqTM两种商品化耐药检测方法结果的一致性.方法 选取25份2009-2013年来自美国Rush大学的HIV-1基因型耐药检测血浆国际考核样本,分别使用In-house、TRUGENETM和ViroSeqTMHIV-1基因型耐药检测方法,对其耐药相关突变位点及17种药物的耐药性进行检测 另取15份来自中国CDC性病艾滋病预防控制中心的待检血浆样本用In-house和TRUGENETM两种方法补充证实所得结论.对三种方法所得检测结果进行一致性评价.结果 耐药相关突变位点检测结果的一致性评价：25份国际考核样品中,三种方法对耐药相关突变位点检测结果的一致率为99.42％（2933/2950）,两两间比较一致性均为极强（Kappa值均＞0.81,P值均＜0.01）；耐药报告检测结果的一致性评价：三种方法两两间比较的不一致结果主要集中在核苷类逆转录酶抑制剂的齐多夫定（zidovudine,AZT）、去羟肌苷（didanosine,ddl）、司他夫定（stavudine,d4T）、阿巴卡韦（abacavir,ABC）4种药物,且主要为轻微不一致.其中In-house与 ViroSeqTM方法结果的轻微不一致率分别为28％ （7/25） 、28％ （7/25）、16％（4/25）、20％ （5/25）；In-house与TRUGENETM方法分别为44％（11/25）、28％（7/25）、36％（9/25）、28％ （7/25）；TRUGENETM与ViroSeqTM方法分别为24％（6/25）、8％（2/25）、28％（7/25）、8％（2/25）.In-house与ViroSeqTM比较时药物AZT,In-house与TRUGENETM比较时药物ddI、d4T、ABC、替诺福韦（tenofovir,TDF）为中度一致（加权Kappa系数分别为0.54,0.44,0.52,0.42,0.59,P值均＜0.01）,其余的比较结果均为高度一致（加权Kappa系数为0.61 ～ 0.80）或一致性极强（加权Kappa系数＞0.80）.15份待检样本的耐药相关突变位点的一致性为99.55％（1762/1770）,17种药物耐药结果的不一致也主要集中在AZT、ddI、d4T、ABC四种药物.结论 In-house HIV-1基因型耐药
- 李晶蒋岩吕超汪静姚均
- 关键词：获得性免疫缺陷综合征HIV-1基因型耐药性
- 四川省MSM人群HIV-1原发耐药性分析被引量：8
- 2011年
- 目的分析四川省男男同性恋(MSM)人群中未经抗病毒治疗的人类免疫缺陷病毒I型(HIV-1)感染者的耐药突变的流行情况。方法采集成都、绵阳和达州3个地区MSM中未经治疗的HIV-1感染者血样,进行核酸提取、PCR及基因测序,对所得结果登录美国斯坦福大学HIV耐药数据库进行在线分析确定耐药突变情况。结果 77例样本中,11例存在蛋白酶抑制剂次要相关突变,4例存在核苷类逆转录酶抑制剂相关突变,5例存在非核苷类逆转录酶抑制剂相关突变,其中1例潜在耐药。结论四川省MSM中未经治疗的HIV-1感染者少数存在原发耐药相关基因变异,未发现新耐药毒株,原发耐药株仍处于较低流行状态,感染者在抗病毒治疗开始前应定期检测耐药基因突变情况以指导用药。
- 袁丹秦光明肖林吕超牛安民魏东兵冯燎刘红露
- 关键词：人类免疫缺陷病毒I型原发耐药耐药突变男男同性恋
