汪静
- 作品数:4 被引量:7H指数:2
- 供职机构:中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- HIV-1早期感染婴儿病毒亚型及env区V3环氨基酸特征分析
- 2013年
- 目的分析中国I型艾滋病病毒(HIV-1)感染婴儿基因亚型的分布情况,以及env区V3环氨基酸序列特征。方法利用巢式聚合酶链反应(nPCR)扩增HIV-1前病毒脱氧核糖核酸(DNA)env区和pol区的基因序列,使用ChromasPro、MEGA 4.0、BioEdit软件进行HIV-1基因分型以及env区V3环氨基酸序列的特征分析。结果对65名HIV-1感染婴儿的100份干血斑样本(DBS)分别进行HIV-1 env区和pol区扩增,最终扩增成功的样本为63份和84份;其中45名感染婴儿的59份DBS两基因区均扩增成功。依据两基因区域均扩增成功的45名感染婴儿样本进行基因分型,结果为:CRF_BC亚型占73.3%(33/45,包括CRF_07-BC 21份,CRF_BC-08 11份),CRF01-AE亚型占20.0%(9/45),B′亚型占4.4%(2/45),G亚型占2.2%(1/45)。对env区扩增成功的63份样本的V3环顶端四肽特征序列进行分析,结果显示存在5种类型,分别为GPGQ、GPGR、GPGS、GLGR和GQGR,以GPGQ为主。53份样本可能使用CCR5作为辅助受体,3份样本可能使用CXCR4作为辅助受体,7份样本不能做出预测。结论婴儿感染的HIV-1亚型呈现多样性分布;HIV-1V3环顶端氨基酸序列以GPGQ为主;大部分婴儿样本可能使用CCR5作为辅助受体。
- 汪静蒋岩吕超李晶姚均
- 关键词:婴儿氨基酸
- 不同类型样本用于HIV基因型耐药检测研究进展被引量:2
- 2012年
- 随着艾滋病(AIDS)抗病毒治疗的推广,艾滋病死亡人数大幅度减少。然而抗病毒药物的压力促使病毒基因发生耐药性的突变,艾滋病病毒(HIV)耐药的检测已经成为HIV预防和治疗的一个重要方面。目前,用于基因型耐药检测的样本类型主要包括液体样本和滤纸片载体样本。液体样本包括全血、血浆、血清,滤纸片载体样本包括干血斑(DBS)、干浆斑(DPS)、干血清斑(DSS)。文章通过对以上样本类型用于检测的特点进行总结,比较它们之间的优缺点,综述各样本类型的使用范围及应用前景。
- 汪静姚均
- 关键词:艾滋病基因型耐药
- 三种HIV-1基因型耐药检测方法的一致性评价被引量:5
- 2013年
- 目的 比较In-house HIV-1基因型耐药检测方法与TRUGENETM、ViroSeqTM两种商品化耐药检测方法结果的一致性.方法 选取25份2009-2013年来自美国Rush大学的HIV-1基因型耐药检测血浆国际考核样本,分别使用In-house、TRUGENETM和ViroSeqTMHIV-1基因型耐药检测方法,对其耐药相关突变位点及17种药物的耐药性进行检测 另取15份来自中国CDC性病艾滋病预防控制中心的待检血浆样本用In-house和TRUGENETM两种方法补充证实所得结论.对三种方法所得检测结果进行一致性评价.结果 耐药相关突变位点检测结果的一致性评价:25份国际考核样品中,三种方法对耐药相关突变位点检测结果的一致率为99.42%(2933/2950),两两间比较一致性均为极强(Kappa值均>0.81,P值均<0.01);耐药报告检测结果的一致性评价:三种方法两两间比较的不一致结果主要集中在核苷类逆转录酶抑制剂的齐多夫定(zidovudine,AZT)、去羟肌苷(didanosine,ddl)、司他夫定(stavudine,d4T)、阿巴卡韦(abacavir,ABC)4种药物,且主要为轻微不一致.其中In-house与 ViroSeqTM方法结果的轻微不一致率分别为28% (7/25) 、28% (7/25)、16%(4/25)、20% (5/25);In-house与TRUGENETM方法分别为44%(11/25)、28%(7/25)、36%(9/25)、28% (7/25);TRUGENETM与ViroSeqTM方法分别为24%(6/25)、8%(2/25)、28%(7/25)、8%(2/25).In-house与ViroSeqTM比较时药物AZT,In-house与TRUGENETM比较时药物ddI、d4T、ABC、替诺福韦(tenofovir,TDF)为中度一致(加权Kappa系数分别为0.54,0.44,0.52,0.42,0.59,P值均<0.01),其余的比较结果均为高度一致(加权Kappa系数为0.61 ~ 0.80)或一致性极强(加权Kappa系数>0.80).15份待检样本的耐药相关突变位点的一致性为99.55%(1762/1770),17种药物耐药结果的不一致也主要集中在AZT、ddI、d4T、ABC四种药物.结论 In-house HIV-1基因型耐药
- 李晶蒋岩吕超汪静姚均
- 关键词:获得性免疫缺陷综合征HIV-1基因型耐药性
- 中国部分地区HIV-1感染婴儿基因型耐药及亚型研究
- 研究背景及目的 在中国随着艾滋病疫情由高危人群向一般人群扩散,性传播已经逐渐成为HIV(Human Immunodeficiency Virus)主要传播途径,女性感染者比例增加,从而使预防艾滋病母婴传播(MTCT, M...
- 汪静
- 关键词:HIV-1婴儿干血斑基因型耐药
- 文献传递