李兰芝
- 作品数：18 被引量：40H指数：4
- 供职机构：湖南农业大学更多>>
- 发文基金：湖南省自然科学基金湖南省教育厅科研基金湖南省大学生研究性学习与创新性实验计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学文化科学生物学更多>>
- 临沂基地不同食药用菌中6种金属元素的ICP-MS检测被引量：1
- 2021年
- 为探究同一基地不同食药用菌子实体及同一食药用菌不同部位的金属元素富集情况,以为食药用菌栽培品种选择、安全性评价及富硒(锌)产品开发提供科学依据,采用电感耦合等离子体质谱分析结合微波消解法,检测临沂某基地的包括灵芝、茯苓、蛹虫草在内的10种食药用菌新鲜子实体及其栽培基质中6种金属元素含量及富集系数。As、Cd、Pb、Cu 4种限量重金属的综合污染指数结果显示,该基地存在一定重金属污染的品种有香菇、凤尾菇、姬松茸和蛹虫草;10个品种中,对As富集系数最高值出现在凤尾菇组(BCF=33.7652),姬松茸则表现出对Cd有较强富集能力(BCF=10.0312),蛹虫草对Pb的BCF值达11.9324,而姬松茸对Cu的BCF值为6.0090。子实体中Zn含量最高值出现在蛹虫草组(145.722±2.574 mg/kg),而Se最高值出现在猴头菇组(0.420±0.021 mg/kg);猴头菇组对Zn的BCF值最高,为3.6535,而对Se富集能力最强的是蛹虫草。灵芝中3种限量重金属含量分布规律均为菌柄>菌盖皮>菌肉层(As除外,菌肉层>菌柄>菌盖皮),茯苓皮中4种限量重金属含量均显著高于茯苓块(P<0.05),凤尾菇中5种重金属含量分布规律均为菌盖>菌柄。表明不同种类或同一子实体不同部位中,金属含量和富集系数都存在较大差异。
- 谢玲马湘豫高楚倩李兰芝李兰芝
- 关键词：食药用菌综合污染指数
- 一种基于全基因组SNP高效精准鉴定水稻品种的方法
- 一种基于全基因组SNP标记精准鉴定水稻品种的方法，其利用“随机”和“优中选优”的策略从全基因组SNP标记中高效快速地选择尽可能少的功能型标记，构成指纹码，区分所有水稻品种样本。利用此方法可快速地对水稻品种资源进行分子标记...
- 李兰芝李梓榕袁雄
- 文献传递
- 杂交水稻品质性状的配合力及遗传力研究被引量：5
- 2017年
- 为了给杂交水稻主要品质性状的选育提供依据,本研究以三系野败型杂交水稻的恢复系和微核心种质构成的112份优异品种为父本,以四个两系不育系和一个三系不育系为母本,按照不完全双列杂交设计配制了560个组合,分析各组合及其亲本的12个品质性状的配合力与遗传力。结果显示考查的12个品质性状的一般配合力(general combining ability,GCA)和特殊配合力(specific combining ability,SCA)均存在极显著差异,说明各性状受基因加性效应和非加性效应的共同作用,其中在直链淀粉含量、粒长宽比、粒长、粒宽、垩白粒率及垩白度等性状上基因的加性效应占主导地位;在蛋白质含量、糙米率、精米率、整精米率、透明度及碱消值级等性状上则以基因的非加性效应为主。同一组合在不同性状间及同一亲本所配的不同组合的SCA差异较大,最高或最低SCA的组合可来自不同GCA的亲本组合类型,表明亲本GCA与SCA没有固定联系。母本的GCA方差贡献率为0.76%~26.21%,父本的GCA方差贡献率为17.47%~81.94%,在各性状上母本GCA方差贡献率均比父本GCA方差贡献率小,说明各性状受母本(不育系)的影响均较小。直链淀粉含量、粒长宽比、粒长、粒宽、垩白粒率及垩白度的狭义遗传力较高,均在50%以上,可在低世代进行选择。
- 张雪丽张征胡中立郑兴飞李兰芝
- 关键词：杂交水稻品质性状配合力遗传力
- 基于支持向量机的算法创新及生物信息数据挖掘
- 袁哲明周玮李兰芝张红燕
- 数据不等于知识，信息时代特别是大数据时代，课题组并不缺少数据，缺乏的是对数 据深入分析、挖掘、获取知识的能力。人类复杂疾病和动植物诸多重要性状皆为数量性状，数据呈现高度的复杂性，传统的统计分析方法已无能为力。支持向量机（...
- 关键词：
- 关键词：支持向量机
- 基于全基因组SNP高效鉴定水稻种质资源并构建指纹图谱被引量：11
- 2020年
- 为加强水稻种质资源的管理及保护,针对SNP鉴定费用昂贵的缺陷,本研究发展了一种快速筛选单核苷酸多态性(SNP)标记构建DNA指纹图谱的方法。本研究首先采用"分而治之"和"贪婪"的组合策略从全基因组SNP标记中筛选出可鉴定全部参试材料的SNP组合,再通过程序循环精简其中的SNP标记,用少量的SNP标记构建指纹图谱。利用该方法对117个水稻种质SNP标记进行筛选,最少用12个SNP标记可完全鉴定该套种质。为提高种质鉴定的容错能力,进一步采用由39个核心SNP标记组成的SNP并集组合构建指纹图谱。本研究为精简SNP构建指纹图谱提供了新的有效途径,构建的种质指纹图谱结果亦可为水稻种质资源鉴定提供一定参考。
- 李梓榕袁雄陈叶郑兴飞胡中立李兰芝
- 关键词：水稻单核苷酸多态性DNA指纹图谱
- 一种适用于PCR的环境友好型植物DNA提取方法(英文)被引量：3
- 2010年
- 改进DNA提取方法,利用含2%CTAB、1%SDS、2%PVP、100mmol/LTris-Cl(pH8.0)、20mmol/LEDTA(pH8.0)和1.4mol/LNaCl的DNA提取缓冲液,提取了不同种属12种植物的DNA,并对其进行了PCR检测.结果显示,所提取的DNA符合PCR试验要求,用真核生物ITS4/ITS5通用引物均能扩增出清晰的条带.该方法无需酚仿抽提,简单、高效、环保,特别适合大规模植物DNA的提取.
- 周倩李兰芝朱宏建高必达
- 关键词：DNA提取方法环境友好型聚合酶链式反应
- 基于多平台基因表达数据的水稻干旱和盐胁迫相关基因预测被引量：4
- 2021年
- 基于多平台基因表达数据挖掘水稻胁迫相关基因,可增加关键基因预测的可靠性,获得更具普适意义的结果。本研究从NCBI数据库中收集了与水稻非生物胁迫相关的94份affymetrix基因芯片数据和42份RNA-seq转录组数据。首先对同一类型同一胁迫相关的多个数据集以数据转换法融合,得到干旱胁迫相关的affymetrix数据集D_affy和RNA-seq数据集D_rnaseq,盐胁迫相关的affymetrix数据集S_affy和RNA-seq数据集S_rnaseq;接着对4个数据集分别基于Pearson线性相关系数的经典WGCNA法和基于MIC非线性相关系数的改进WGCNA法进行基因共表达网络分析,共获取胁迫相关的8个Hub基因集;进一步,对同一胁迫相关的Hub基因进行整合分析,得到最终的水稻干旱胁迫相关Hub基因1936个、盐胁迫相关的Hub基因1504个。最后,从预测性能、富集分析、文献报道、STRING在线互作分析和Cytoscape可视化分析等多角度解析Hub基因的生物学意义。结果显示:Hub基因整体预测性能较优,且大多富集到了与干旱/盐胁迫相关的通路上,其中有文献已报道的干旱胁迫响应基因31个和盐胁迫响应基因22个。此外,通过对Hub基因的互作分析,预测得到11个干旱胁迫候选基因和5个盐胁迫候选基因。本研究为“高维度、小样本”的农作物基因测序数据的有效分析提供了新思路,实验结果为抗逆水稻品种研究提供了参考。
- 刘亚文张红燕曹丹李兰芝
- 关键词：水稻多平台干旱胁迫盐胁迫
- 苦荞14-3-3基因家族生物信息学分析被引量：1
- 2021年
- 14-3-3蛋白是普遍存在于真核细胞中的蛋白质,在植物的生长发育、信号传导、抵御胁迫等方面发挥着重要的作用,编码14-3-3蛋白的基因以基因家族的形式存在。本试验利用BLASTp从苦荞全基因组中查找到19个14-3-3基因家族成员,其编码蛋白中ε类蛋白序列8条,非ε类蛋白序列11条。利用生物信息学软件对14-3-3蛋白的氨基酸序列进行理化性质分析,发现它们的长度介于101~242 aa,等电点范围为4.27~9.59,大部分表现为酸性亲水蛋白,通过亚细胞定位预测其存在于细胞质、叶绿体、胞外、细胞核和细胞骨架中。通过对苦荞14-3-3蛋白的结构分析,发现该蛋白以α-螺旋、延伸链、无规则卷曲为主来维持蛋白质结构的相对稳定性且蛋白质序列高度保守,共含有8个保守基序,分布在7条染色体上。根据苦荞14-3-3蛋白的理化性质、结构、进化等方面的分析对其功能进行了初步的预测,推测苦荞14-3-3蛋白在靶蛋白亚细胞定位、基因转录、物质跨膜运输、非生物胁迫、代谢调控中发挥着重要的作用。本研究为后续苦荞14-3-3蛋白复杂结构和生物学功能等方面的深入研究提供科学依据。
- 时兴伟陈叶李玉兰袁哲明董玉梅李兰芝
- 关键词：生物信息学分析
- “互联网+”新引擎助力农业院校创新创业教育改革——来自湖南农业大学的实践与探索被引量：1
- 2020年
- 随着"双创"的整体、持续推进与乡村振兴战略的全面部署,国家对创新创业高质量发展、乡村振兴及创新人才培养进行了顶层设计与定位,为"互联网+农业"背景下的创新创业教育指明了方向。首先分析了目前创新创业教育改革中存在的壁垒;再基于湖南农业大学的实践与探索,创新地提出"互联网+"新引擎助力多维度的农业院校创新创业教育改革途径:普及"互联网+农业"知识,培养学生创新创业意识;建设"互联网+农业"背景下的个性化创新创业课程体系;培养具有"互联网+农业"思维的创新创业教师队伍;夯实具有"互联网+农业"特色的创新创业实践基地。以农业为特色进行探索,将成为农业院校创新创业教育改革取之不尽的源动力。
- 代志军刘晶曹成周玮李兰芝李晓刚
- 关键词：创新创业教育改革农业院校
- 莲ARF基因家族全基因组鉴定和表达分析被引量：3
- 2020年
- 生长素反应因子(auxin response factor,ARF)是调节生长素表达的转录因子响应基因,与植物生长发育和信号转导等多个过程密切相关。本研究对莲ARF基因家族进行鉴定,从莲的全基因组中共鉴定到30个ARF基因家族成员。分析其理化性质发现它们的氨基酸数介于86aa^988aa,等电点范围为4.61~9.05,大部分表现为酸性且都为亲水蛋白。利用生物信息学软件分析莲的ARF蛋白序列的保守结构域和保守基序,结果显示莲中不是所有的ARF蛋白都含有B3结构域、Auxin_resp结构域、AUX_IAA结构域,但至少具备其中一种结构域,ARF基因家族中预测含有15个保守基序,对莲ARF保守域蛋白序列进行进化树分析,莲中ARF蛋白可以被划分为四组,基因结构进化高度保守。研究结果为后续深入研究莲ARF基因家族的功能奠定了基础。
- 苏静王柯阳董臣周江波李兰芝
- 关键词：基因表达生物信息分析
