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李楠楠
作品数:
1
被引量:8
H指数:1
供职机构:
西北农林科技大学生命科学学院
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发文基金:
国家转基因植物研究与产业化专项
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相关领域:
生物学
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合作作者
郭蔼光
西北农林科技大学生命科学学院
吴方丽
西北农林科技大学生命科学学院
孔栋
西北农林科技大学生命科学学院
金伟波
西北农林科技大学生命科学学院
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1篇
2007
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水稻MicroRNA的预测及实验验证
被引量:8
2007年
根据已报道水稻pre-miRNA的序列与结构信息,利用支持向量机(support vector machine,SVM)方法在miRNA前体上预测成熟区,产生一个模型——mature-SVM.它预测水稻成熟区的敏感性和特异性分别为86.7%和100%;然后,用这个模型对从水稻基因组中筛选出的46501条pre-miRNA进行成熟链预测,此外再根据miRNA的作用原理用blast程序所进一步的筛选,得到了127条pre-miRNA及成熟miRNA;除去其中已知的21条,最后得到106条候选的新的水稻miRNA.从中随机挑取10条进行Northern验证,结果有4条miRNA得到确认.
金伟波
李楠楠
吴方丽
孔栋
郭蔼光
关键词:
水稻
MIRNA
支持向量机
NORTHERN印迹
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