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李楠楠

作品数:1 被引量:8H指数:1
供职机构:西北农林科技大学生命科学学院更多>>
发文基金:国家转基因植物研究与产业化专项更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学

主题

  • 1篇印迹
  • 1篇支持向量
  • 1篇支持向量机
  • 1篇水稻
  • 1篇向量
  • 1篇向量机
  • 1篇NORTHE...
  • 1篇MICROR...
  • 1篇MIRNA

机构

  • 1篇西北农林科技...

作者

  • 1篇李楠楠
  • 1篇金伟波
  • 1篇孔栋
  • 1篇吴方丽
  • 1篇郭蔼光

传媒

  • 1篇中国生物化学...

年份

  • 1篇2007
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
水稻MicroRNA的预测及实验验证被引量:8
2007年
根据已报道水稻pre-miRNA的序列与结构信息,利用支持向量机(support vector machine,SVM)方法在miRNA前体上预测成熟区,产生一个模型——mature-SVM.它预测水稻成熟区的敏感性和特异性分别为86.7%和100%;然后,用这个模型对从水稻基因组中筛选出的46501条pre-miRNA进行成熟链预测,此外再根据miRNA的作用原理用blast程序所进一步的筛选,得到了127条pre-miRNA及成熟miRNA;除去其中已知的21条,最后得到106条候选的新的水稻miRNA.从中随机挑取10条进行Northern验证,结果有4条miRNA得到确认.
金伟波李楠楠吴方丽孔栋郭蔼光
关键词:水稻MIRNA支持向量机NORTHERN印迹
共1页<1>
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