童超波
- 作品数：7 被引量：4H指数：2
- 供职机构：中国科学院水生生物研究所更多>>
- 发文基金：国家杰出青年科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 鉴定SINEs的方法及在鱼类基因组中的研究被引量：1
- 2008年
- 韩亚伟童超波何舜平
- 鲤科鱼类散在重复序列新发现:SINE家族反转座寄生于LINE家族
- 短散在重复序列(SINE)和长散在重复序列(LINE),广泛存在于真核生物中并占据着基因组相当大一部分,它们通过反转座的形式不断插入到基因组染色体的新座位,实现自身数目的增殖。由于其反转座插入的不可逆性和独立性,它们被认...
- 童超波何舜平
- 关键词：SINELINE分子进化反转座子
- 文献传递
- 一种四倍体鲤科鱼Sox基因的克隆和序列分析被引量：2
- 2008年
- 为了研究重要功能基因在多倍体基因组中的演化情况,通过分子克隆的方法从四倍体大鳞结鱼(Tordouronensis)中获得13条Sox基因序列,分别为SoxB,SoxC和SoxE组成员.对大鳞结鱼Sox基因系统进化分析的结果支持鱼类特异的基因组重复的假说,同时表明,基因Sox19可能为真骨鱼特有的Sox基因家族成员.序列分析显示,与其他物种相比大鳞结鱼中Sox基因的碱基替代,绝大多数为同义替代.结果表明,所得到的Sox基因序列均受到净化选择,同时由多倍化所造成的重复基因对Sox4a,Sox9a和Sox9b受到相同的净化选择压力.根据基因Sox9a和Sox9b重复基因对间内含子序列长度和相似性的差异推测大鳞结鱼可能为异源四倍体.
- 郭宝成李俊兵童超波何舜平
- 关键词：SOX基因四倍体
- 磁珠探针复合物捕获基因组上的散在重复序列:年轻的SINE家族反转座寄生于同一基因组中的LINE家族
- 短散在重复序列(SINE)和长散在重复序列(LINE),广泛存在于真核生物中并占据着基因组相当大一部分,它们通过反转座的形式不断插入到基因组染色体的新座位,实现自身数目的增殖。由于其反转座插入的不可逆性和独立性,它们被认...
- 童超波何舜平
- 关键词：SINELINE分子进化反转座子
- 文献传递
- 鲤科鱼类系统进化过程中SINEs的插入事件被引量：2
- 2007年
- 短散在核重复序列(SINEs)是真核生物基因组内的移动元件,已被广泛应用于系统发育研究。文中报道了用SINE的插入事件和细胞色素b基因来研究鲤科鱼类的进化.结果显示:细胞色素b基因和SINEs插入事件在大的鲤科鱼类分类上都支持形态学的分类结果,将整个鲤科鱼类分为雅罗鱼系和鲃系;两种分子标记所获结果的不同之处在于野鲮亚科的进化地位.SINEs插入事件的分析结果显示该亚科的进化地位比较原始,而细胞色素b序列的结果则显示其相对较晚的进化起源.尽管在该研究中分析的物种较少,但为SINEs在鲤科鱼类插入事件的研究提供了基础.
- 韩亚伟童超波何舜平陈宜瑜
- 关键词：细胞色素B基因鲤科鱼类系统进化
- 基于磁珠探针复合物分离短散在重复序列的方法
- 本发明公开了一种磁珠探针复合物分离短散在重复序列的方法，本发明包括如下步骤：(1)基因组片段富集库的制备。酶切基因组，回收合适大小片段，T4连接酶加接头，少量接头PCR循环放大酶切后的基因组片段库；(2)探针磁珠复合物的...
- 童超波何舜平
- 文献传递
- 基于磁珠探针复合物分离短散在重复序列的方法
- 本发明公开了一种磁珠探针复合物分离短散在重复序列的方法，本发明包括如下步骤：(1)基因组片段富集库的制备。酶切基因组，回收合适大小片段，T4连接酶加接头，少量接头PCR循环放大酶切后的基因组片段库；(2)探针磁珠复合物的...
- 童超波何舜平
- 文献传递
