王环宇
- 作品数：154 被引量：819H指数：18
- 供职机构：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家自然科学基金中美新发和再发传染病合作项目更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学环境科学与工程更多>>
- 我国四株狂犬病毒M和P基因序列分析和所编码蛋白的分析被引量：9
- 2007年
- 为了解我国狂犬病毒M、P基因序列和结构特点,用RT-PCR方法获得目的基因片段,测定核苷酸序列后,计算机分析核苷酸和氨基酸序列及其功能区位点结构。结果显示四株病毒M基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为83.9%～99.5%和93.1%～99%,四株狂犬病毒M蛋白上调节病毒RNA转录和复制功能的第58位氨基酸残基均为谷氨酰胺残基(E),与特异性细胞蛋白WW区域作用的PPxY结构序列均为PPEY保守序列;四株病毒P基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为83.6%～99.8%和87.2%～99%,P蛋白与胞浆动力蛋白轻链LC8相互作用的序列位于143～148位氨基酸残基,均为DKSTQT,四株病毒P基因与L蛋白、N蛋白作用位点序列显示未发生影响其生物学功能的变异。研究结果证实了这两种蛋白结构在病毒致病性中起重要作用的推论。
- 张强唐青李浩王环宇梁国栋
- 关键词：狂犬病毒M基因P基因测序分析
- 乙脑病毒的空间播散及迁徙事件研究被引量：5
- 2015年
- 为明确乙脑病毒在空间播散的分布及分化机制,利用PhyML v3.0软件对359株具有详细信息的乙脑病毒(基因1型)E基因序列进行系统进化分析,使用PAUP v4.0软件和MigraPhyla软件包进行迁徙事件推演分析。结果显示乙脑病毒在亚洲的播散存在频繁的迁徙事件,共计发生迁徙事件95次,其中在我国境内发生54次。分析结果还显示泰国以及中国上海、山东、四川和云南等地是乙脑病毒重要的迁徙源泉地区,泰国作为源泉地区主要播散至太平洋地区的澳大利亚、柬埔寨、印度以及中国西藏;上海作为源泉地区乙脑病毒主要播散至亚洲东部沿海地区以及中国云南;山东主要播散至韩国以及中国的浙江、湖北、山西和辽宁等省份;四川主要迁徙至中国内陆省份以及越南和日本;云南作为源泉地区主要迁徙至浙江。本研究首次证实乙脑病毒在亚洲的播散存在频繁的迁徙事件,泰国以及中国上海、山东、四川和云南等省份是乙脑病毒在亚洲播散的重要源泉地区。
- 高晓艳周海卫刘红付士红王环宇郭振洋李晓龙梁国栋
- 关键词：乙脑病毒
- 库蚊黄病毒在中国的分布
- 库蚊黄病毒(Culex flavivirus,CxFV)是属黄病毒科黄病毒属的蚊传虫媒病毒.CxFV能够引起C6/36细胞病变,在其他哺乳动物细胞系,如BHK、Vero均未发现细胞病变,接种乳鼠后不能引起乳鼠死亡.200...
- 梁文凯赫晓霞何英付士红王环宇
- 关键词：系统进化
- 四川省东南部地区蚊、蠓及相关虫媒病毒调查研究被引量：4
- 2018年
- 目的了解四川省的蚊、蠓以及相关虫媒病毒种类及分布。方法在自然界使用灯诱法采集吸血昆虫标本，形态学分类后分装，液氮保存备用。蚊虫、蠓虫研磨上清液接种BHK-21细胞和C6/36细胞进行病毒分离和病毒基因检测。使用BioEdit 7.0.5.3、MEGA 6.0等软件对病毒序列进行分子生物学特征分析。结果2016－2017年在四川省东南部3个县的7个自然村共采集到3属4种蚊虫17 019只，蠓虫12 700只。三带喙库蚊占蚊虫采集总数的79.4%（13 519/17 019），其次为骚扰阿蚊（11.1%，1 897/17 019），致倦库蚊占采集蚊虫标本总数的5.5%（930/17 019）；中华按蚊最少（4.0%，673/17 019）。蚊虫标本接种组织细胞后，在合江县采集的三带喙库蚊标本获得3株可以稳定传代的病毒分离株，经分子生物学实验鉴定为基因Ⅰ型流行性乙型脑炎（乙脑）病毒，在合江县采集的7批蚊虫中检测到乙脑病毒基因阳性。蠓虫标本接种细胞后未获得病毒分离物，在合江县采集的4批蠓虫标本经分子生物学检测，显示阿卡斑病毒基因阳性。结论三带喙库蚊是四川省东南部3县的优势蚊种，四川省东南部存在经蚊虫传播的乙脑病毒及以蠓虫为媒介的阿卡斑病毒。
- 宋颂付士红周兴余张佳珂李伟刘丽珺李劲松汪健林于李晓龙何英雷雯雯王环宇王斌鲁晓睛梁国栋
- 关键词：流行性乙型脑炎病毒
- 我国新分离乙脑病毒02-76株的全基因序列特征被引量：11
- 2006年
- 目的对我国新分离乙脑病毒02-76株进行全基因序列测定和分析，了解乙脑病毒基因组结构及毒力特性。方法设计乙脑病毒全基因组扩增引物，RT-PCR扩增片段，PCR产物直接测序，拼接后获得全基因序列。通过Clustal X（1．8）、DNASTAR、GENEDOC（3．2）等生物学软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析。结果新分离乙脑病毒02．76株全基因组全长10977个核苷酸，从96位到10391位，共10296个核苷酸编码一个开放阅读框，编码3432个氨基酸。与我国1949年分离的Beijing-1株相比较共存在248个核苷酸差异，16个氨基酸差异。与GenBank中选择的29株乙脑病毒全基因序列比较发现，其核苷酸总体差异率为0．6％-15．1％，氨基酸总体差异率为0．2％-4．6％。通过PrM／C区段、E区段、3’NTR区段及全基因序列进行系统进化分析均显示该毒株属于基因3型乙脑病毒。结论新分离的乙脑病毒02-76株属于基因3型，与中国分离株SA-14进化关系最接近。
- 王环宇潘晓玲付士红王雷李铭华Ichiro Kurane梁国栋
- 关键词：脑炎病毒基因种系发生
- 新疆南部地区2012年西尼罗病毒感染的检测与监测被引量：2
- 2019年
- 目的了解在新疆南部地区西尼罗病毒(west nile virus, WNV)感染的情况。方法于2012年在新疆南部地区采集发热患者和鸡血清标本,通过酶联免疫吸附试验(enzyme-linkedimmunosorbent assay, ELISA)及中和试验检测标本中西尼罗病毒特异性抗体。结果在新疆南部地区8个县共采集到门诊和住院患者1712份血清标本,其中WNV IgM抗体阳性和WNV中和抗体阳性标本分别为22份和48份,这其中迦师县标本中WNV IgM抗体和中和抗体阳性标本分别为21份和42份;在新疆南部4个县采集的383份鸡血清标本中仅在迦师县采集的鸡血清标本中检测到28份标本为WNV中和抗体阳性,其余县采集的鸡血清均为阴性。结论新疆南部地区2012年存在人群和家养鸡的WNV感染,迦师县是该病毒感染的主要地区。
- 付士红曹蕾吕志何英雷雯雯李樊王环宇梁国栋
- 关键词：西尼罗病毒
- 中华按蚊分离的版纳病毒全基因组序列测定与分子遗传进化分析被引量：3
- 2018年
- 目的对分离自中华按蚊的版纳病毒进行病毒全基因组核苷酸序列测定和分子遗传学分析。方法使用分子病毒学方法测定病毒全基因组12节段核苷酸序列,以生物信息学软件进行序列比对、同源性和分子遗传进化分析。结果 2012年从云南省中缅边境地区中华按蚊分离的版纳病毒(YN12234病毒株)能在C6/36细胞引起细胞病变并稳定传代,该病毒为12节段RNA病毒。根据病毒VP1蛋白(RdRp)氨基酸序列进行的分子遗传进化分析发现,YN12234病毒属于呼肠孤病毒科东南亚12节段RNA病毒属版纳病毒。对第12节段基因序列的进一步分析显示,YN12234病毒属于A2基因型版纳病毒。系统进化分析结果还显示,从中华按蚊分离的版纳病毒与此前从中华按蚊分离的版纳病毒处在不同进化分支,且不同蚊虫分离的版纳病毒并非聚类在共同的进化分支。结论从中华按蚊分离的YN12234病毒株属于含有12节段的版纳病毒,分子进化分析结果提示包括云南省分离的YN12234病毒在内的目前国内外从蚊虫分离的版纳病毒并不存在病毒与蚊虫种类之间的媒介适应性。
- 程睿付士红范娜何英雷雯雯王环宇王斌鲁晓晴梁国栋
- 关键词：版纳病毒中华按蚊
- 两种基因型流行性乙型脑炎病毒在上海市共同流行被引量：3
- 2012年
- 目的掌握上海市流行性乙型脑炎(乙脑)病毒基因型别特征。方法 2002-2005年在上海市奉贤县养猪场采集蚊虫标本,研磨处理后分离病毒,完成病毒细胞学、动物学、血清学及分子生物学鉴定。测定病毒全基因组序列,应用ATGC、ClustalX(1.83)、MegAlign、GeneDoc3.2和Mega5.0等生物学软件完成序列拼接、比对、核苷酸与氨基酸同源性分析、系统进化分析。结果共采集38347只蚊虫标本,主要是三带喙库蚊。分离到13株乙脑病毒。测定13株乙脑病毒全基因组序列,结合上海市其他年份分离的乙脑病毒及涵盖5个基因型别的其他乙脑病毒全基因组序列,通过系统进化分析发现,上海市2001、2003、2005和2007年分离的乙脑病毒属于基因Ⅰ型,2004年和2006年分离的乙脑病毒属于基因Ⅲ型。结论 2种基因型别乙脑病毒(Ⅰ、Ⅲ型)在上海市共同流行。
- 王环宇付士红何英闵继光潘晓玲梁国栋
- 关键词：流行性乙型脑炎病毒基因型系统进化分析
- 中国乙型脑炎参比实验室网络
- 流行性乙型脑炎（Japaneseencephalitis,JE）简称乙脑,是由于蚊虫叮咬引起的人类严重中枢神经系统急性传染病,其病原体为流行性乙型脑炎病毒（Japanese encephalitis virus, JEV...
- 王环宇李艺星付士红曹玉玺高晓艳何英尹遵栋梁国栋
- 关键词：乙型脑炎网络
- 文献传递
- 基于第12节段基因序列的版纳病毒分子遗传进化分析被引量：3
- 2016年
- 目的 了解自1980-2012年在世界各地分离的版纳病毒分子遗传进化特征。方法 采用多种生物信息学分析方法，对1980-2012年我国及世界各地分离的版纳病毒进行基于第12节段基因序列的系统进化、分子溯源分析。结果 版纳病毒的共同进化祖先出现时间为315（95% HPD：63～619）年前，第12节段的进化速率为2.33×10-3（95% HPD：2.84×10-4～8.52×10-3）碱基替换/位点/年，提示版纳病毒属于新发快速进化的虫媒病毒。结论 版纳病毒属于快速进化的新发虫媒病毒，其地域分布范围进一步扩大且已经分化出新的病毒变种，应加强对该病毒在自然界分布及其致病性的监测。
- 刘红高晓艳付士红李铭华翟友刚孟维珊孙肖红王环宇吕志申辛欣曹玉玺何英梁国栋
- 关键词：版纳病毒虫媒病毒系统进化分析
