王荃
- 作品数：14 被引量：3H指数：2
- 供职机构：南开大学更多>>
- 发文基金：国家杰出青年科学基金国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生农业科学更多>>
- 一种在革兰氏阳性菌中合成的CDP-2-甘油及其制备方法
- 本发明涉及一种在革兰氏阳性菌细菌中利用氧化还原酶合成的甘油化合物(Glycerol)，以及采用甘油和磷酸化酶合成甘油-2-磷酸(glycerol-2-phosphat)中间体，进而进一步合成CDP-2-甘油(CDP-2-...
- 王磊徐艳丽王荃冯露
- 文献传递
- 大肠杆菌O11 O-抗原基因簇序列的破译及特异分子标识的鉴定被引量：3
- 2006年
- 大肠杆菌O11是一种可在人畜间交叉传染的强致病菌,具有潜在流行性爆发的危险。现完成了O11 O-抗原基因簇的破译,筛选和鉴定了多种特异分子标识,并实现了对大肠杆菌O11的快速、灵敏和准确的分子分型检测。利用鸟枪法测定大肠杆菌O11 O-抗原基因簇的序列全长为14180bp,生物信息学方法分析序列结构,共发现12个基因:GDP-L型岩藻糖合成途径基因(gmd,fcl,gmm,manC,manB)、UDP-N乙酰葡萄糖C4异构酶基因(gne)、O-抗原转运酶基因(wzx)、O-抗原聚合酶基因(wzy)和4个糖基转移酶基因;用PCR方法筛选出2个针对大肠杆菌O11的特异基因和4对特异引物,并进行环境样品检测实验鉴定了该PCR检测方法的灵敏度;设计并筛选出8条针对大肠杆菌O11的特异探针。
- 王威彭霞王荃程剑松王磊
- 关键词：O-抗原基因簇分子分型特异基因
- 变形杆菌多种血清型菌株特异性引物及多重PCR检测方法
- 本发明涉及一种用于检测变形杆菌多种血清型致病菌的特异性PCR引物及采用多重PCR快速检测的方法及应用，其中的多重PCR检测体系包括10×PCR反应液、MgCl<Sub>2</Sub>、dNTP、引物、DNA聚合酶，所用引...
- 王磊王荃彭志勇冯露
- 文献传递
- 大肠杆菌O120 O-抗原基因簇的破译及特异分子标识的鉴定
- 2007年
- 目的完成产志贺毒素大肠杆菌O120 O-抗原基因簇的破译,筛选和鉴定检测用特异分子标识。方法利用鸟枪法进行O-抗原基因簇序列的测定,进行生物信息学方法分析发现基因并预测基因功能,利用PCR方法筛选针对大肠杆菌O120特异基因和特异引物,利用基因芯片方法筛选特异探针。结果O-抗原基因簇序列全长12 485 bp,共含有10个基因:dTDP-鼠李糖合成途径基因(rmlB、rmlD、rmlA和rmlC),O-抗原转运酶基因(wzx),O-抗原聚合酶基因(wzy),3个糖基转移酶基因和1个功能未确定的基因。另外筛选和鉴定了2个特异基因、4对特异引物和6条特异探针,在模拟样品的鉴定中得到验证。结论多种特异分子标识可从样品中特异地检测出大肠杆菌O120,具有快速、灵敏和准确进行分子分型的优点。
- 李雅玥王威王荃王磊
- 关键词：O-抗原基因簇特异基因
- 大肠杆菌O23 O-抗原基因簇序列的破译及UDP-N-乙酰葡萄糖-C4异构酶的鉴定被引量：2
- 2006年
- 采用鸟枪法破译大肠杆菌O23标准株的O-抗原基因簇序列,并用生物信息学的方法进行了基因注释和分析;采用基因缺失和互补的方法鉴定了O23的UDP-GlcNAc C4异构酶(Gne);用同源建模的方法构建了O23 Gne的高级结构并对其活性位点进行了分析;分析了不同血清型大肠杆菌O-抗原基因簇中gne基因的多样性;根据O23O-抗原基因簇中的特异基因筛选出了可用于大肠杆菌O23快速检测的特异DNA序列。
- 程剑松王威王荃高春绪王磊彭霞
- 关键词：大肠杆菌O-抗原基因簇基因缺失
- 参见罕见单糖合成的细菌基因的鉴定及其功能研究
- 冯露郭宏杰王颖徐艳丽程剑松王荃齐渊源
- 该课题通过破译两种O抗原基因簇，运用生物信息学的方法预测了三种罕见单糖的合成途径，并将这些罕见单糖合成基因克隆，在大肠杆菌中进行了高效表达和纯化。通过体外反应，运用毛细管电泳，高效液相色谱，质谱分析以及核磁鉴定等方法，对...
- 关键词：
- 一种在革兰氏阳性菌中合成的CDP-2-甘油及其制备方法
- 本发明涉及一种在革兰氏阳性菌细菌中利用氧化还原酶合成的甘油化合物(Glycerol)，以及采用甘油和磷酸化酶合成甘油-2-磷酸(glycerol-2-phosphat)中间体，进而进一步合成CDP-2-甘油(CDP-2-...
- 王磊徐艳丽王荃冯露
- 变形杆菌多种血清型菌株特异性引物及多重PCR检测方法
- 本发明涉及一种用于检测变形杆菌多种血清型致病菌的特异性PCR引物及采用多重PCR快速检测的方法及应用，其中的多重PCR检测体系包括10×PCR反应液、MgCl<Sub>2</Sub>、dNTP、引物、DNA聚合酶，所用引...
- 王磊王荃彭志勇冯露
- 文献传递
- 通过对大肠杆菌O抗原结构及基因簇的解析研究细菌多样性的分子进化机制
- 王荃吴俊丽阮晓娟徐艳丽倪志伟
- 大肠埃希氏菌(Escherichiacoli)俗称大肠杆菌，为埃希氏菌属(Escherichia)的代表菌，在人类或动物的大肠中营共生生活，是肠道的正常菌群，但某些特殊血清型的大肠杆菌是重要致病菌.脂多糖是革兰氏阴性细菌...
- 关键词：
- 关键词：大肠杆菌细菌多样性致病菌
- 大肠杆菌和志贺氏菌O-抗原糖基转移酶与聚合酶的生物信息学研究被引量：1
- 2004年
- 利用生物信息学手段对大肠杆菌和志贺氏菌的 1 1 0个O 抗原糖基转移酶与 39个O 抗原聚合酶的序列进行分析 ,探讨这两种酶的序列和结构特点。统计了其序列一致性 ,密码子使用和 (G +C) %含量的特点 ;讨论了O 抗原糖基转移酶和聚合酶对底物的特异性 ;推测了 6组糖基转移酶的功能 ;通过对蛋白拓扑结构的预测 ,发现O 抗原聚合酶中广泛存在一个位于细胞周质中的亲水环 (Loop) ,是可能的功能区域 ;通过对蛋白高级结构的预测 ,发现O 抗原糖基转移酶属于两个不同的蛋白超家族。
- 陶江刘斌王荃郭宏杰冯露王磊
- 关键词：大肠杆菌志贺氏菌O-抗原糖基转移酶聚合酶生物信息学
