赵小东
- 作品数：12 被引量：41H指数：4
- 供职机构：上海交通大学生物医学工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划博士后科研启动基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学天文地球更多>>
- 雌性生殖干细胞全基因组范围选择性多聚腺苷酸化位点分析
- 2016年
- 目的描绘小鼠雌性生殖干细胞(FGSCs)和胚胎干细胞(ESCs)全基因组范围内选择性多聚腺苷酸化(APA)位点,通过细胞间的比较,分析生殖干细胞特异性的APA位点对其生物学特性的影响。方法利用本实验室之前建立的基于高通量测序的转录本3’末端poly(A)位点捕获方法3T-seq确定并比较两个细胞系中所有APA位点,通过DAVID对具有APA位点差异的基因进行Gene Ontology分析。结果在两种细胞系中共确定16 973个基因的50 243个APA位点,发现FGSCs中相较于ESCs 3’UTR发生长度变化的基因1148个,其中795个(66%)3’UTR变短,353个(34%)基因3’UTR变长,与生殖发育密切相关的基因3’UTR存在显著的缩短现象。结论 FGSCs存在与ESCs不同的APA谱,APA介导的3’UTR变化参与生殖发育相关的生物学过程,揭示了生殖干细胞的基因转录后调控机制。
- 沈挺挺张晓丽张盼康亚妮田静赵小东
- 关键词：小鼠胚胎干细胞
- 激光显微切割分选少量胃癌细胞中PSCA基因的SNP分析被引量：2
- 2012年
- 随着基因组关联分析方法的应用,越来越多与胃癌相关的易感基因被发现.易感基因的多态性检测已逐步进入胃癌临床诊断和研究.然而,利用少量胃粘膜细胞开展单核苷酸多态性(SNP)分析对胃癌进行早期诊断常遇下述困难,一是少量胃癌细胞混杂在多种细胞中,异常信号常易被淹没,二是细胞量极少,因此获得的基因组DNA量微,进行多位点或全基因组分析存在困难.本文利用激光显微切割技术分选少量胃癌细胞,结合全基因组放大技术,进行胃癌相关的前列腺干细胞抗原基因(PSCA)的SNP分析.通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)和克隆测序方法分析,在分选的胃癌细胞中检测到PSCA的rs2976392位点胃癌相关的"A"等位与rs2294008位点胃癌相关的"T"等位.研究结果表明,所采用的全基因组放大方法保真性高,经过分选的胃癌细胞中SNP位点的检测灵敏度和可靠性大为提高.所建立的少量细胞基因多位点检测方法将同样应用于其它肿瘤和组织的少量细胞研究中,全基因组放大产物也可进行高通量的基因芯片和第二代测序研究.
- 杨祎郭妍赵小东刘炳亚邵志峰
- 关键词：胃癌
- 龙须菜的药用价值及其抗肿瘤活性被引量：1
- 2016年
- 大型海藻龙须菜富含活性多糖、藻红蛋白、膳食纤维和营养元素等,具有调节免疫活性、抗肿瘤、抗氧化、抗病毒等多种生物活性、药用价值和保健功效,经常食用可预防肥胖、高胆固醇、高血脂、便秘等代谢疾病。近年来,随着龙须菜抗肿瘤活性成分的筛选与深入分析,越来越多的人开始关注龙须菜的抗肿瘤活性及其在肿瘤防治中的作用与机理。对龙须菜药用价值及其抗肿瘤活性的新进展进行总结有利于指导抗肿瘤新药的研制和开发,从而更好地预防和治疗肿瘤。
- 康亚妮孙雪徐年军赵小东
- 关键词：龙须菜藻红蛋白多糖抗肿瘤药用价值
- 乳腺癌细胞外泌体的分离与鉴定被引量：5
- 2013年
- 目的:从乳腺癌MDA-MB-231细胞中分离外泌体并分析其来源及分子生物学特征。方法:采用多步差速离心的方法从乳腺癌MDA-MB-231细胞中分离外泌体,并在原子力显微镜下观察其形态;采用RT-PCR法检测其特异性的微小RNA(micro RNA,miR)-21的表达;蛋白质印迹法检测其标记物Flotillin-1蛋白的表达。结果:从乳腺癌MDA-MB-231细胞中分离获得外泌体,形态为圆形或椭圆形,大小不一,直径约在30～100nm;RT-PCR检测结果显示,外泌体中有miR-21的表达;蛋白质印迹法检测结果显示,外泌体中有Flotillin-1蛋白的表达。结论:多步差速离心是一种较为简单有效的外泌体提取方法。从形态及分子生物学特征方面证实,本研究中所获得的提取物正是乳腺癌MDA-MB-231细胞释放的外泌体。
- 邢宇洋康亚妮戚颖罗梦麟李小卫Dan Czajkowsky赵小东
- 关键词：乳腺肿瘤外泌体MIR-21
- 基于随机森林回归模型的中药复方金复康对肺癌细胞增殖作用的组方优化被引量：8
- 2017年
- 目的:以治疗肺癌疗效确切的中药复方金复康为研究对象,从抑制肺癌细胞增殖方面对其处方组成进行优化,并为中药复方的处方优化提供新的途径。方法:应用筛选试验设计(Plackett-Burman),然后应用随机森林算法,建立基于设计处方集的预测模型,61个组方设计矩阵为输入,以相应的61个组方的半数抑制浓度(half maximal inhibitory concentration,IC50)的自然对数为输出建立随机森林回归模型。并用5次10折交互验证优化模型参数mtry,最后应用网格化搜索算法得到最优的配伍组,并进行肺癌细胞增殖实验验证,以金复康组成药物的不同组合作用于肺腺癌细胞株A549的IC50为指标,从抑制肺癌细胞增殖方面对金复康的组方配伍进行优化。结果:通过随机森林模型结合网格化搜索算法得到的最优配伍组为黄芪、麦冬、重楼、女贞子和绞股蓝,且经实验验证,在抑制肺癌细胞增殖方面,金复康优化方相对于金复康原方具有更好的抑制细胞增殖效应。结论:基于随机森林模型结合网格化搜索算法能够为复杂性中药复方的组方优化提供方法学参考。
- 郑婷婷杨铭阙祖俊金郁焦丽静赵小东许玲
- 关键词：金复康细胞增殖
- 龙须菜多糖对肺癌细胞增殖能力及形态的影响被引量：2
- 2015年
- 为了探讨龙须菜多糖(PGL)对肺癌细胞增殖能力的抑制作用及其形态学的影响,将不同浓度的PGL分别作用于肺癌A549细胞24、48、72 h,采用CCK-8和台盼兰拒染法检测PGL对细胞增殖能力及生长的抑制作用,计算死亡细胞数及存活率;相差显微镜和DAPI染色观察PGL对肺癌细胞的形态学影响;Annexin V-FITC/PI双染法和流式细胞术检测PGL对细胞凋亡的作用。结果显示,随PGL作用浓度及时间的增加,细胞增殖能力及存活率逐渐降低,抑制率逐渐增加,以50μg/m L作用72 h最为显著。细胞形态发生不规则改变,接触生长状态减少,数量减少,细胞核受到损伤,细胞发生凋亡,72 h后上述改变更为明显。研究表明,PGL能够抑制肺癌细胞增殖能力、降低细胞活力、改变细胞形态、诱导细胞凋亡,且具有时间—浓度的依赖性;龙须菜的抗肺癌活性是多种机制共同作用的结果。
- 康亚妮陆俊徐晓婷孙雪徐年军赵小东
- 关键词：抗肿瘤增殖能力细胞凋亡
- 中药复方“金复康”抑制肺癌细胞生长机制的研究被引量：7
- 2016年
- 目的:本文主要探讨中药复方金复康萃取物对人非小细胞肺癌(Non-Small Cell Lung Cancer,NSCLC)A549细胞增殖和凋亡的影响及其分子机制。方法:本文以人非小细胞肺癌A549细胞为研究对象,应用CCK8试剂盒检测了金复康萃取物对细胞增殖活力的影响,流式细胞技术检测金复康对细胞凋亡诱导作用,实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(Real-time q PCR,RT-q PCR)检测细胞凋亡相关基因的表达。结果:金复康萃取物对A549细胞增殖有较显著抑制作用,并且存在剂量依赖效应。与对照组相比,金复康处理组细胞数量明显减少,伴随着大量细胞间距增大,失去原有形态,DAPI细胞核染色结果显示细胞核受到损伤。流式细胞检测实验显示金复康明显诱导A549细胞凋亡。RT-q PCR检测发现金复康上调凋亡相关基因转录表达水平。结论:金复康通过诱导细胞凋亡抑制A549细胞增殖,这一过程可能与其诱导凋亡相关基因FADD和GADD45a表达上调有关。
- 陈健康亚妮沈挺挺赵小东付艳丽许玲
- 关键词：肺癌金复康细胞凋亡
- 金复康“扶助正气、清透伏毒”预防肺癌转移的细胞学机制研究被引量：16
- 2016年
- 目的观察金复康冻干粉(JFK)对非小细胞肺癌(NSCLC)患者的"伏毒"——循环肿瘤细胞(CTC)的清除作用,并验证金复康干预CTC预防转移的假说。方法从肺癌患者外周血中富集并培养CTC细胞系,然后以金复康干预CTC细胞,采用细胞计数试剂盒-8(CCK-8)法检测细胞增殖,并检测克隆形成,以流式细胞术和激光共聚焦技术检测细胞凋亡与周期。结果金复康能够显著以时间和浓度依赖性抑制CTC细胞增殖(P<0.05);金复康可剂量依赖性显著抑制CTC细胞克隆形成(P<0.05);金复康能够有效诱导CTC细胞发生凋亡(P<0.01);高浓度组的金复康能够显著将CTC细胞增殖阻滞在S期(P<0.05)。结论金复康对NSCLC患者体内CTC具有显著的抑制作用,干预CTC可能是JFK防治NSCLC复发与转移的机制。
- 阙祖俊罗斌周之毅王青金郁赵小东李和根施奇惠田建辉刘嘉湘
- 关键词：金复康口服液伏毒
- 基于问题式学习对提高学生实践能力的研究
- 2015年
- 应用基于问题式学习(PBL)的教学方法来提高学生的实践能力,从PBL方法的过程及主要内容、资料的收集及整理、分析及评价方法、推广及应用价值方面进行了总结。
- 康亚妮赵小东
- 关键词：基于问题式学习创新性思维
- 四色荧光标记二硫键可逆终端的合成及在DNA合成测序中的应用
- 2014年
- 分别以5-碘-2'-脱氧尿苷、5-碘-2'-脱氧胞苷、7-去氮-7-碘-2'-脱氧腺苷及7-去氮-7-碘-2'-脱氧鸟苷为原料,以二硫键为可裂解连接单元,通过多步反应合成了四色荧光标记不同碱基的脱氧核糖核苷酸;研究了该类荧光标记核苷酸作为可逆终端在DNA合成测序中的应用.所得产物结构经1H NMR,31P NMR及HRMS表征,并对其进行了DNA高通量测序的测试.结果表明,该类荧光标记核苷酸作为DNA合成测序的可逆终端能够满足高通量测序的生化反应要求,具有较好的应用前景.
- 汤道年江敏李小卫康亚妮伍新燕龚兵邵志峰赵小东沈玉梅
