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吕林峰

作品数:3 被引量:8H指数:2
供职机构:四川大学生命科学学院更多>>
发文基金:国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
相关领域:生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 2篇生物学
  • 2篇农业科学

主题

  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白纯化
  • 1篇蛋白质
  • 1篇蛋白质功能
  • 1篇蛋白质相互作...
  • 1篇蛋白质相互作...
  • 1篇多克隆
  • 1篇多克隆抗体
  • 1篇油菜
  • 1篇油菜菌核
  • 1篇油菜菌核病
  • 1篇油菜菌核病菌
  • 1篇朴素贝叶斯
  • 1篇朴素贝叶斯模...
  • 1篇青枯
  • 1篇青枯病
  • 1篇系统发生树
  • 1篇相互作用
  • 1篇菌核
  • 1篇菌核病

机构

  • 3篇四川大学

作者

  • 3篇乔代蓉
  • 3篇吕林峰
  • 3篇曹毅
  • 2篇赵锐
  • 1篇王乐
  • 1篇李晶
  • 1篇费忠安
  • 1篇岳建宇
  • 1篇杨舸
  • 1篇姜春雷
  • 1篇宋玲玲

传媒

  • 3篇应用与环境生...

年份

  • 2篇2012
  • 1篇2010
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
茄科雷尔氏菌蛋白质相互作用网络预测及分析被引量:2
2012年
细菌性青枯病是由茄科雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)引起的一种世界范围的细菌性土传病害.该细菌基因组序列的完全测序,使得从蛋白质组角度来分析其蛋白质相互作用网络成为可能.本文通过朴素贝叶斯模型整合系统发生谱法、基因邻近法、基因融合法、操纵子法、同源映射法、微阵列法、域相互作用法等7种方法,并根据约豋指数确定的阙值,预测了可信的茄科雷尔氏菌的蛋白质相互作用网络.对网络中的分泌子网络和信号转导进行了分析,提出可能的药物作用靶点(cyaB、pilD、Fli、Rsp1526、VsrA、VsrB、PilH).对于未注释的蛋白依据蛋白相互作用推测了部分蛋白质的功能.本文也提供了完全免费的在线数据库支持,提供了方便的茄科雷尔氏菌的蛋白相互作用的查询及相互作用数据和推测的蛋白质功能数据的查询和下载(http://www.scbmp.org.cn/rsoppi.php).
姜春雷赵锐吕林峰乔代蓉曹毅
关键词:蛋白质相互作用蛋白质功能青枯病朴素贝叶斯模型
播娘蒿DsCOR蛋白纯化、抗体制备及对冷诱导的响应被引量:3
2010年
为揭示播娘蒿(Descurainia sophia)极强的抗寒特性,在大肠杆菌中重组表达已克隆的播娘蒿抗寒基因DsCOR,比较Ni亲合层析和煮沸-透析袋电洗脱蛋白纯化方法,制备纯化的DsCOR重组蛋白多克隆抗体,Western Blotting检测播娘蒿在寒冷胁迫下DsCOR的表达特性.结果表明,两种纯化技术均能纯化DsCOR蛋白,透析袋电洗脱法纯化蛋白浓度为1.21mg/mL,是Ni亲和层析法纯化蛋白浓度的2倍,且经PEG8000浓缩后的蛋白总量分别为9.075mg和4.256mg;制备的DsCOR抗体效价达1:12800,Western Blotting检测显示只有经过低温冷诱导的播娘蒿DsCOR蛋白才表达,证明了DsCOR基因受低温诱导的规律.
杨舸李晶吕林峰王乐宋玲玲乔代蓉曹毅
关键词:播娘蒿蛋白纯化多克隆抗体抗寒性
油菜菌核病菌(Sclerotinia sclerotiorum)与细菌间的基因水平转移被引量:3
2012年
油菜菌核病(Sclerotinia sclerotiorum)是油菜生产上最重要的病害之一,其致病性可能来源于基因水平转移(Horizontal gene transfer,HGT).为认识其致病原理和寻找新的真菌抑制剂的靶点,首先通过BLASTp发现其基因XM_001585458.1编码蛋白XP_001585508.1与细菌比对结果中出现低E值3.23e-109和高SCORE值436,暗示存在HGT现象;进一步通过系统进化树的建立,发现该蛋白在进化分枝上更接近于细菌中由Streptomyces sp.C的NZ_CM000832.1基因编码的蛋白ZP_07291173;同时核苷酸组成分析也发现该基因与油菜菌核病菌基因组的碱基组成有较大差别,GC含量提高了14.95%.这些结果证明了XM_001585458.1的确存在基因水平转移事件.结构分析和COG蛋白功能分类显示该HGT序列编码蛋白XP_001585508.1具有FA58C_3(Coagulation factors 5/8 type C domain)、Kelch repeat type 1、Galactose-binding domain-like、Galactose oxidase/kelch,beta-propeller等保守结构域,应为一个膜蛋白并参与多糖代谢,推测该水平转移基因与S.sclerotiorum在侵染植物时进行细胞壁水解和致病性有关.
吕林峰岳建宇费忠安赵锐乔代蓉曹毅
关键词:基因水平转移油菜菌核病系统发生树碱基组成
共1页<1>
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