曹源
- 作品数：33 被引量：33H指数：3
- 供职机构：济南军区总医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金山东省自然科学基金中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术理学更多>>
- sTarPicker:a method for efficient prediction of bacterial sRNA targets based on a two-step model for hybridization
- Background Bacterial small RNAs(sRNAs) are a class of small regulatory RNAs involved in regulation of expressi...
- 应晓敏曹源吴佳瑶刘倩查磊李伍举
- 文献传递
- 一种检测甲型H1N1流感病毒的试剂盒及专用引物和靶序列
- 本发明公开了一种属于病原体基因快速诊断领域的检测甲型H1N1流感病毒的专用引物和包括该引物的检测甲型H1N1流感病毒的试剂盒以及该引物所对应的靶序列。本发明的专用引物所对应的靶序列，其碱基序列如SEQ ID No.1所示...
- 徐东刚李伍举蔡欣付文亮曹源邹民吉
- 文献传递
- 单极纺锤体蛋白激酶1(Mps1)与蛋白酶体α7亚基(PSMA7)相互作用研究
- 2015年
- 目的研究单极纺锤体蛋白激酶1(Mps1)与蛋白酶体α7亚基(PSMA7)是否存在蛋白间相互作用。方法以真核表达质粒p CMV-C-Myc-PSMA7为模板,p GEX-4T-1为载体,构建原核表达载体p GEX-4T-1-PSMA7(GSTPSMA7);并通过GST pull-down及免疫共沉淀实验检测Mps1与PSMA7之间是否存在相互作用。结果免疫印迹实验结果证实,构建的原核表达载体p GEX-4T-1-PSMA7(GST-PSMA7)能正确表达;GST pull-down及免疫共沉淀实验表明,Mps1与PSMA7之间存在蛋白质间相互作用。结论成功构建了原核表达载体p GEX-4T-1-PSMA7(GSTPSMA7),并在大肠杆菌中得到了表达;Mps1与PSMA7之间存在相互作用,为进一步研究两者之间的关系及Mps1功能的影响打下基础。
- 张萍萍王鹏皓曹源魏从文何湘曹叶马胜利张艳红钟辉胡成进
- 关键词：蛋白质相互作用
- 不同型号血凝仪检测凝血酶原时间及部分凝血活酶时间的可比性评价被引量：2
- 2015年
- 目的探讨同一实验室内不同型号血凝仪检测凝血酶原时间(prothrombin time,PT)及部分凝血活酶时间(activated partial thromboplastin time,APTT)结果的可比性。方法用卫生行业标准《WS/T407-2012医疗机构内定量检验结果的可比性验证指南》及《WS/T406-2012临床血液学检验常规项目分析质量要求》提出的两种仪器间比对方案,对3台血凝仪(2台Sysmex CA7000和1台CA1500)所检测的PT及APTT进行比对,分析两种比对方案的可行性。结果用WS/T407-2012比对方案,样本1在3台仪器上检测PT和APTT的相对偏差分别为7.10%和5.20%,样本2的相对偏差分别为5.74%和2.46%,均<7.50%的比对要求。用WS/T406-2012比对方案,3台仪器分别检测20份标本,以相对偏差<7.50%、符合率≥80%为标准,CA1500与基准仪器CA7000比较,PT及APTT的符合率分别为85%(17/20份)、80%(16/20份),CA7000-2与基准仪器CA7000比较,PT及APTT的符合率分别为85%(17/20份)、90%(18/20份)。结论按照两种方案提出的比对方法,3个检测系统测定PT和APTT的结果具有可比性,实验室可根据实际情况选择合适的方案进行仪器间比对,以保证不同检测系统间检验结果的可比性。
- 王延群曹源胡成进
- 关键词：卫生标准凝血酶原时间部分凝血活酶时间
- 溶藻弧菌感染小鼠导致的炎性因子变化
- 2016年
- 目的探讨溶藻弧菌感染小鼠后引起的炎性因子水平变化及意义。方法建立溶藻弧菌ATCC17749T腹腔注射感染BALB/c小鼠动物模型,进行血液学和肝功能指标检测以及肝脏病理学检查,采用炎性因子抗体芯片进行炎性因子检测。结果溶藻弧菌ATCC17749T感染BALB/c小鼠的半数致死量为1×109 CFU。感染组小鼠血液白细胞和血小板数目均降低,差异有统计学意义(P<0.05);红细胞和血红蛋白量、丙氨酸氨基转移酶、天门冬氨酸氨基转移酶水平均升高,差异有统计学意义(P<0.05);病理学观察发现,溶藻弧菌感染可引起小鼠肝、肺严重损伤;炎性因子检测筛选出20种显著变化的炎性因子,其中细胞因子信号值大于200,倍数改变大于10的有8种炎性因子,分别为KC、IL-6、RNATES、IL-12、Eotaxin、G-CSF、MIP-1α、Mig。结论该研究所筛选出的溶藻弧菌感染小鼠后变化的炎性因子为溶藻弧菌炎症机制的研究提供了理论依据。
- 武静刘晓斐宗玉龙曹源胡成进
- 关键词：溶藻弧菌动物实验炎性因子
- 基于SVM方法构建细菌sRNA靶标预测模型
- 2008年
- 目的:为实验方法鉴定细菌sRNA靶标和研究sRNA功能提供生物信息学支持。方法:首先以实验证实的132个sRNA与靶标相互作用数据为训练集,其中包含46个阳性数据和86个阴性数据;其次,以实验证实的22个阳性数据和随机生成的1 700个阴性数据为测试集;最后以RNA二级结构谱等特征为变量,运用支持向量机(SVM)方法构建sRNA靶标预测数学模型。结果和结论:构建的模型对训练集的敏感性和特异性均为100%,对测试集的敏感性和特异性分别为72.73%和80.65%。所构建的数学模型为实验发现sRNA靶标提供了生物信息学支持。
- 赵雅琳李华侯妍妍查磊曹源王立贵应晓敏李伍举
- 关键词：SRNA靶标SVM
- 血清多肽组谱图的生物信息学
- 2009年
- 血清多肽组谱图（简称血肽图，serum peptidome profiling）是指通过质谱分析技术获得的血清中多肽组的精确质量数的谱图，是临床蛋白质组学研究领域的一个分支，在生物标志物的发现、疾病早期诊断和个性化治疗等领域有着广阔的应用前景。而且在这些应用中，生物信息学分析是其中一个重要环节。为了给有关的生物医学工作者提供较好的支持，文章就与血肽图相关的生物信息学方法进行综述，内容涉及基线删除、标准化、峰检测、峰比对和模型建立等方面。
- 曹源邵宁生李伍举
- 关键词：生物信息学
- 海洋创伤弧菌致脓毒症诊治建议方案
- 海洋创伤弧菌感染致脓毒症患者病情凶险,死亡率高.该细菌生长环境不同于陆地细菌,目前在国内医院临床常用的微生物培养环境难以生长,不能正确鉴定而漏诊,延误及时诊治致脓毒症死亡,应引起医务人员的广泛高度重视.本文对海洋创伤弧菌...
- 胡成进刘晓斐曹源武静陈英剑公衍文
- 创伤弧菌感染BALB/c小鼠诱导适应性免疫应答的研究被引量：1
- 2015年
- 为探讨创伤弧菌感染BALB/c小鼠后引起的适应性免疫应答类型及规律,我们首先通过半数致死量实验筛选创伤弧菌MO6-24/O腹腔注射感染菌量,随后通过流式细胞术检测创伤弧菌感染后小鼠脾脏Th细胞亚群应答情况,通过ELISA实验检测血清中IFN-γ浓度,采用real-time PCR检测创伤弧菌感染小鼠腹腔巨噬细胞后Th1细胞调控因子的表达。最后,采用流式细胞术动态检测Th1细胞亚群应答规律。结果显示,创伤弧菌MO6-24/O腹腔注射感染小鼠的半数致死量是2.5×105cfu,平均存活时间是16h,我们后续实验选择感染菌量为5×104cfu/只。创伤弧菌感染后能够诱导Th1型细胞应答,并且感染后血清中IFN-γ浓度显著增加(P<0.05),并且创伤弧菌体外感染小鼠腹腔巨噬细胞后能够引起IL-12/IL-23p40、IL-12p35以及IFN-γmRNA表达显著增高(P<0.05)。最后,流式结果显示,创伤弧菌感染后,脾脏Th1细胞的应答逐渐增强,在感染后3天达到高峰,随后逐渐下降到正常水平。因此,Th1型应答是创伤弧菌诱导的获得性免疫应答的主要类型。
- 刘晓斐武静宗玉龙曹源胡成进
- 关键词：创伤弧菌感染TH细胞IFN-Γ
- pBV220载体中外源基因高效表达的自动化设计被引量：2
- 2009年
- pBV220载体是国内科学家构建的原核系统表达载体,目前仍在广泛应用.但是,实现外源基因的高效表达需要综合考虑诸如RNA二级结构等多种因素,极其耗时费力.为此,基于我们提出的pBV220载体中外源基因高效表达数学模型,编写了外源基因高效表达的自动化设计软件,并可定性用于原核系统其它载体中外源基因表达水平分析,最终为加快实验进程提供帮助.
- 查磊应晓敏王立贵曹源骆志刚苑波李伍举
- 关键词：PBV220自动化设计
