杨杞
- 作品数：61 被引量：127H指数：7
- 供职机构：内蒙古农业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家教育部博士点基金内蒙古自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学轻工技术与工程文化科学更多>>
- 甜高粱秸秆纤维素液态能源化高效生物降解菌的筛选及其机理研究
- 李国婧冯福应王瑞刚潘新丛靖宇王萍张子义段开红杨杞樊兆阳丛立双
- 能源短缺和环境污染是全球关注的重大课题.纤维素，特别是秸秆纤维素是自然界中生物量最大、最有潜力的可再生生物质资源.秸秆以往多以焚烧的形式处理，既浪费资源又污染环境.秸秆纤维素的微生物降解菌的研究有望使得这些生物质资源得到...
- 关键词：
- 关键词：甜高粱生物降解菌基因工程
- 中间锦鸡儿诱导型启动子CiNAC071及其应用
- 本发明涉及生物基因工程领域，具体而言，涉及诱导型启动子CiNAC071及其应用，CiNAC071启动子受ABA和GA诱导，在ABA处理下抑制启动子活性，在GA处理下促进启动子活性，可用于转基因表达载体的构建。利用诱导型启...
- 杨杞刘杨李国婧王燕飞柳金华田晓娜李志红牛俊美韩晓东王瑞刚
- 文献传递
- 中间锦鸡儿CiUPF0114克隆与表达及豆科UPF0114基因家族成员分析
- 2019年
- 本研究克隆了中间锦鸡儿一个CiUPF0114基因,该基因编码框长876 bp,编码291个氨基酸的蛋白质,预测等电点9.83,分子量32.13 kD。利用荧光定量PCR检测发现,在干旱、脱水和冷处理后,CiUPF0114基因转录水平的表达量均明显上调。通过全基因组筛选,获得了29个来自于8种豆科植物以及模式植物拟南芥和水稻中的UPF0114基因家族成员,并对其进行了系统进化分析、基因结构和保守基序分析。系统进化分析将UPF0114基因分成A和B两个亚家族,A亚家族又分成A1和A2两个组,本研究中克隆的中间锦鸡儿CiUPF0114属于B亚家族成员。通过对蛋白长度、结构域数量、分子量、等电点、基因结构和保守基序的分析发现,29个UPF0114基因差异不大,说明该基因家族成员在进化上相对保守。该研究为进一步验证CiUPF0114基因的功能奠定了基础。
- 杨杞牛肖翠王瑞刚王瑞刚
- 关键词：基因克隆中间锦鸡儿基因家族进化分析
- 柠条锦鸡儿肉桂酰辅酶A还原酶基因克隆和分析被引量：7
- 2014年
- 肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)是木质素特异合成途径中的关键酶。根据已报道的植物CCR基因序列设计简并引物,利用RACE技术,首次从柠条锦鸡儿(Caragana korshinkii Kom.)中克隆得到CCR基因全长cDNA序列,命名为CkCCR,GenBank登录号为HQ829859。该序列长1 270bp,具备长度为1 014bp的完整开放阅读框(ORF)。推导该基因编码的蛋白质有434个氨基酸,预测等电点6.69,分子量36.76kDa。序列分析发现,柠条锦鸡儿CCR基因推导的氨基酸序列与其它植物来源的CCR序列高度相似,并且具有植物CCR共有的氨基酸序列"KNWYCYGKA"以及NADPH的结合序列。系统进化分析显示,柠条锦鸡儿CCR与拟南芥CCR2处于同一分支,与同属豆科的银合欢CCR亲缘关系最近。利用荧光定量PCR技术对柠条锦鸡儿一个月龄幼苗基因转录水平进行检测,结果显示CkCCR基因在根、茎、叶中广泛表达,并且干旱处理初期表达量有所下降,处理后期又恢复到未处理时的表达水平。
- 李高杨杞张烨王颖张涛李国婧王瑞刚
- 关键词：柠条锦鸡儿
- 柠条锦鸡儿香豆酸-3-羟化酶基因克隆及其功能初步研究被引量：12
- 2013年
- 香豆酸-3-羟化酶(Coumarate 3-Hydroxylase,C3H)是木质素生物合成途径中的关键酶之一。以柠条锦鸡儿为材料,利用RACE技术克隆了C3H基因。对柠条锦鸡儿C3H基因的gDNA和cDNA全长分析显示该基因具有3个外显子,2个内含子,编码框长度为1530bp,编码509个氨基酸。预测该基因编码蛋白的等电点位7.67,分子量约57.61kDa。氨基酸序列分析显示具有一个保守的P450结构域。系统进化分析表明该蛋白与大豆C3H具有最高的同源性,将该基因命名为CkC3H,GeneBank登录号为HQ829858。构建了35S启动子驱动的CkC3H基因植物表达载体,互补拟南芥C3H(CYP98A3)基因突变体ref8,转基因植物表型得以部分恢复。这些结果说明柠条锦鸡儿CkC3H与拟南芥C3H至少具有部分相同的功能。
- 李高杨杞张烨王瑞刚李国婧
- 关键词：木质素
- 柠条干旱胁迫转录组数据分析以及部分基因功能验证
- 柠条是柠条锦鸡儿(Caragana korshinskii)、中间锦鸡儿(Caragana intermedia)和小叶锦鸡儿(Caragana microphylla)的统称,属于豆科锦鸡儿属多年生灌木,是干旱草原、荒...
- 杨杞韩晓敏于秀敏赵娜王光霞万永青杨飞芸李娜毛铭铢郑如玉刘坤岳文冉刘建政杨天瑞任方媛红格日王燕飞牛肖翠于爽王瑞刚李国婧
- 关键词：柠条转录组功能分析转录因子基因家族
- 一种农杆菌介导的中间锦鸡儿瞬时表达体系建立的方法
- 本发明属于植物基因工程技术领域，具体涉及一种农杆菌介导的中间锦鸡儿瞬时表达体系的建立方法，选取生长18～22天左右的中间锦鸡儿幼苗，使用1mL无针头注射器，在叶片的背面将农杆菌悬浮液注入叶片内，注射完后，黑暗覆膜24h，...
- 杨杞刘坤王光霞王瑞刚李国婧
- 一种中间锦鸡儿Senescence_reg-1类蛋白编码基因CiDUF584-1及其应用
- 本发明提供了一种新的编码Senescence_reg‑1类蛋白基因及其蛋白、cDNA序列，该基因来源于豆科锦鸡属灌木中间锦鸡儿(Caragana intermedia Kuang et H.C.Fu)，该基因包括633b...
- 杨杞丛靖宇杨天瑞王瑞刚李国婧
- 文献传递
- 干旱胁迫下柠条锦鸡儿叶片SSH文库构建及CkWRKY1基因克隆被引量：19
- 2013年
- 为研究柠条锦鸡儿抗旱的分子机制,挖掘干旱响应相关基因,成功构建干旱胁迫下柠条锦鸡儿叶片的抑制性差减杂交(SSH)文库,获得1286条高质量的EST序列,平均长度475bp,拼接得到Unigenes645条。对这些Unigenes进行Blast比对注释后发现很多抗旱相关基因,例如LEA蛋白、DHN蛋白编码基因,MYB、bZIP、WRKY、NAC和bHLH转录因子等。通过RACE技术克隆其中1个WRKY转录因子的cDNA全长,命名为CkWRKY1,GenBank登录号为JX987095。CkWRKY1编码330个氨基酸的蛋白质,氨基酸序列中有1个"WRKYGQK"的WRKY转录因子家族保守序列,属于第Ⅱ类WRKY转录因子。利用实时荧光定量PCR技术检测发现,CkWRKY1基因在干旱处理后mRNA的表达水平明显上升,预示该转录因子可能与柠条锦鸡儿抗旱的分子机制相关。
- 杨杞张涛王颖李高尹佳佳韩晓敏齐力旺李国婧王瑞刚
- 关键词：柠条锦鸡儿干旱胁迫WRKY基因克隆
- 柠条锦鸡儿CkLEA4基因克隆及表达分析被引量：7
- 2014年
- LEA蛋白是一种与植物抗逆相关的胚胎发育晚期丰富蛋白。该研究从已构建的柠条锦鸡儿干旱胁迫抑制削减杂交文库中筛选到1条LEA蛋白编码基因的部分序列,用RACE技术扩增得到该基因cDNA全长并对其进行了克隆。测序表明该基因cDNA长870bp,其中开放阅读框长510bp,编码169个氨基酸,推测蛋白分子量为17.03kD,等电点为9.3,是一种亲水蛋白。序列比对和系统进化分析表明,该基因属于LEA4基因家族成员,命名为CkLEA4。实时荧光定量PCR检测发现,CkLEA4基因在干旱、ABA和NaCl处理下均受到不同程度的诱导,说明CkLEA4基因可能与柠条锦鸡儿响应逆境胁迫有关。
- 张燕娜于秀敏杨杞岳文冉王瑞刚李国婧
- 关键词：LEA基因克隆柠条锦鸡儿
