沈蕾 作品数:26 被引量:48 H指数:4 供职机构: 南通大学附属医院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家质检公益性行业科研专项 南通市科技计划项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 理学 更多>>
一种罕见的菌血症病原菌——霍氏鲍特菌的分离鉴定及临床意义分析 被引量:2 2019年 目的通过探讨一株罕见菌——霍氏鲍特菌(Bordetella holmesii, B.holmesii)的鉴定及耐药特征,分析其临床意义,提高对该菌的检出及临床诊疗水平。方法从细菌培养特性、生化特征以及16S rRNA基因序列分析来鉴定一株菌血症分离菌;运用Mega 7.0软件对鲍特菌属全部成员模式菌株与所分离菌16S rRNA基因序列进行同源性比对,并构建系统进化树;E-test法检测该分离菌的药物敏感性;分别添加不同浓度核黄素及其抑制剂光黄素于该菌培养基中,检测其生长活力。结果引起该免疫功能完善者菌血症的病原菌为B.holmesii,并将菌种上传中国普通微生物菌种保藏管理中心(CGMCC,菌种保藏号:CGMCC 1.13721);同时将该分离菌B.holmesii ABD2 16S rRNA基因序列上传美国国家生物技术信息中心(NCBI,序列号:KT828544.1);无根树显示B.holmesii与百日咳鲍特菌更具有亲缘性;药物敏感性试验(AST)显示哌拉西林、头孢他啶、头孢吡肟、亚胺培南、美罗培南、环丙沙星、左氧氟沙星、庆大霉素、阿米卡星、红霉素、四环素以及多黏菌素对该菌株的最小抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)较低,而头孢唑啉、头孢呋辛酯、头孢西丁、头孢噻肟、氨曲南及复方新诺明的MIC值较高;核黄素能够促进B.holmesii的生长,光黄素则抑制该菌的生长。结论B.holmesii分离率极低,鉴定困难,因此临床、微生物学以及流行病学相关资料甚少,为一种罕见的病原菌,有待我们更深入地探讨。 浦江 钱晨 李娴 汪桂华 汤自洁 沈蕾 鞠少卿 褚少朋关键词:菌血症 RRNA基因序列分析 核黄素 ROC曲线评价血清鳞状细胞癌抗原诊断慢性肾功能衰竭的价值 被引量:1 2018年 目的:评价鳞状细胞癌抗原(squamous cell carcinoma antigen,SCCA)对慢性肾功能衰竭(chronic renal failure,CRF)的诊断价值。方法 :回顾性分析2014年1—12月我院所有进行SCCA检测病例,以1.5 ng/mL为诊断分界点,计算各疾病SCCA异常者所占比例;分别比较健康体检者与CRF肾功能不全代偿期、肾功能不全失代偿期、肾功能衰竭期和尿毒症期患者血清SCCA浓度水平;用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC曲线)分析SCCA对CRF各期诊断曲线下面积(area under the curve,AUC)、敏感性和特异性。结果:CRF患者SCCA异常比例最高,为68.3%;CRF各期与健康体检组SCCA质量浓度水平差异均有统计学意义(P<0.05),肾功能不全代偿期与CRF其他3期SCCA质量浓度水平差异均有统计学意义(P<0.05);SCCA对CRF各期的诊断AUC分别为0.716±0.030、0.922±0.014、0.940±0.013和0.941±0.013,敏感性分别为64.81%、88.48%、83.93%和88.44%,特异性分别为70.24%、81.55%、92.26%和88.69%。结论 :SCCA对CRF具有较高的辅助诊断价值,值得在临床推广应用。 季伙燕 沈蕾 蔡花 贾心媛关键词:慢性肾功能衰竭 鳞状细胞癌抗原 受试者工作特征曲线 血清hsa_circ_0000437对胃癌辅助诊断及预后判断的意义 被引量:4 2022年 目的探讨胃癌患者血清hsa_circ_0000437表达水平及其临床价值。方法选取2018年10月至2020年12月南通大学附属医院经病理确诊的80例胃癌患者(男57例,女23例);50例胃良性疾病患者(男28例,女22例)及80名健康对照者(男46例,女34例)。收集血清样本,同时收集上述胃癌患者中35例患者手术后血清样本。采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)方法检测血清hsa_circ_0000437表达水平。采用Mann-Whitney U检验比较不同组间、胃癌患者不同分期及手术前后血清hsa_circ_0000437水平的差异,采用χ²检验分析胃癌患者血清hsa_circ_0000437水平与其临床病理特征之间的相关性。化学发光法检测癌胚抗原(CEA)、糖类抗原199(CA199)、糖类抗原724(CA724)。运用受试者工作特征(ROC)曲线及其曲线下面积(AUC)评估hsa_circ_0000437、CEA、CA199以及CA724的诊断效能。Kaplan-Meier生存曲线分析hsa_circ_0000437表达水平与患者预后的关系。结果胃癌、胃良性疾病患者和健康对照者血清hsa_circ_0000437表达水平分别为2.252(1.235,4.765)、1.598(1.139,1.982)及1.000(0.818,1.385),胃癌患者高于胃良性疾病和健康对照者(P均<0.001),胃良性疾病患者高于健康对照者(P<0.001)。胃癌患者术后血清hsa_circ_0000437的表达水平低于手术前(P<0.001)。胃癌患者血清hsa_circ_0000437的表达水平在肿瘤T分期、N分期、肿瘤分化程度差异均有统计学意义(P=0.043、P=0.025和P=0.013)。胃癌患者区别于健康对照者,hsa_circ_0000437、CEA、CA199和CA724 AUC分别为0.863、0.619、657和0.608,4项指标联合检测AUC为0.892,敏感度高达97.5%(78/80)。Kaplan-Meier生存曲线显示血清hsa_circ_0000437高表达患者的总体生存率明显低于血清hsa_circ_0000437低表达患者(P=0.008)。结论hsa_circ_0000437可能是胃癌辅助诊断和预后判断的一个生物学指标。 申娴娟 沈蕾 马硕 戚菁 鞠少卿关键词:胃肿瘤 实时荧光定量PCR 生物标志物 磷酸吡哆醛对血清ALT、AST测定的影响及相关参考值的初步建立 被引量:5 2013年 目的研究磷酸吡哆醛(PLP)对测量表观健康人群(未排除脂肪肝患者)丙氨酸氨基转移酶(ALT)和天冬氨酸氨基转移酶(AST)催化活性浓度的影响,初步建立血清ALT和AST的参考值。方法以问卷调查方式收集研究对象基本资料,并分为脂肪肝组和非脂肪肝组;将ALT、AST参考测量程序转移至生化分析仪;检测试剂含和不含PLP时的ALT、AST:ALT1(PLP+)、ALT2(PLP-)、AST1(PLP+)、AST2(PLP-);分析PLP对研究对象血清ALT和AST活性测定的影响,并建立参考值。结果总人群、非脂肪肝组男、女间ALT1、ALT2、AST1、AST2差异均有统计学意义(P均<0.05)。总人群男、女间ALT、AST激活程度差异均有统计学意义(U分别为17 985.5、19 111.0,P<0.05);非脂肪肝组男、女间ALT激活程度差异无统计学意义(U=9 616.0,P>0.05),AST激活程度差异有统计学意义(U=8 947.0,P<0.05);脂肪肝和非脂肪肝人群的ALT激活程度和AST激活程度的差异有统计学意义(U分别为8 552.0、16 502.5,P<0.01)。若排除脂肪肝人群,试剂中加入PLP,男性ALT参考值为9.6~43.6 U/L,女性为7.0~30.2 U/L;男性AST参考值为19.8~39.6 U/L,女性为17.9~34.3 U/L。结论若在纳入参考人群时严格排除脂肪肝患者,试剂中添加PLP后ALT及AST参考值与现行参考值较接近,可考虑推广加入含PLP的试剂。 沈蕾 倪红兵 苏建友 刘才旺 王建新 季伙燕 保方 王惠民关键词:丙氨酸氨基转移酶 天冬氨酸氨基转移酶 脂肪肝 参考值 肽段同位素稀释质谱法定量重组肌钙蛋白I含量的方法 肽段同位素稀释质谱法定量重组肌钙蛋白I含量的方法,它涉及一种准确定量重组肌钙蛋白I含量的方法;包括以下步骤:特征肽段设计;特征肽段质谱分析离子对的确定;LC‑MRM条件研究;样本分析前处理:主要步骤有:重组蛋白变性、还原... 王建新 沈培 王旭东 鞠少卿 王惠民 季伙燕 沈蕾文献传递 氨基酸分析-同位素稀释质谱法准确定量胱抑素C重组蛋白 被引量:4 2017年 目的:建立同位素稀释液相色谱串联质谱法进行氨基酸分析,准确定量人重组蛋白胱抑素C(Cys C)。方法:优化Cys C蛋白酸水解条件,将Cys C蛋白水解成氨基酸,以水解产物缬氨酸(Val)和苯丙氨酸(Phe)为研究对象,13C5-Val和13C9,15N-Phe为内标,根据括号法分别计算水解产物Val和Phe浓度,从而准确定量Cys C蛋白。结果:Cys C蛋白在130℃,6 mol/L HCl溶液中水解4 h可完全水解。以水解产物Val和Phe分别计算Cys C浓度为1.324 mg/g和1.328 mg/g,一致性较好,检测结果变异系数均小于7%(n=5),取二者平均值得到重组Cys C蛋白浓度为1.326 mg/g。结论:成功建立同位素稀释质谱法准确定量重组蛋白Cys C的氨基酸分析方法,有望为临床实验室蛋白质检测的溯源提供思路。 沈蕾 季伙燕 崔明 王建新 倪红兵 王惠民关键词:氨基酸分析 同位素稀释质谱法 蛋白定量 循环非编码RNA作为乳腺癌标志物的研究进展 被引量:4 2019年 非编码RNA(ncRNA)为不具备编码蛋白质功能的基因组转录产物,在基因转录、转录后及翻译水平发挥调控作用,与肿瘤发生和发展密切相关。ncRNA以微泡、外泌体或蛋白质复合物形式进入循环系统,形成循环ncRNA,稳定而广泛存在于血液、尿液等体液中。某些循环ncRNA在肿瘤中存在差异性表达,提示其具备作为肿瘤液体活检标志物的潜在价值。本文对循环ncRNA中的微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA)作为乳腺癌标志物的研究进展进行综述,探讨了循环ncRNA作为乳腺癌诊断与预后新型生物标志物的临床应用价值。 汪桂华 浦江 沈蕾 鞠少卿关键词:微RNAS 酶学参考测量体系的量值溯源探讨 被引量:2 2014年 酶学参考实验室通过量值溯源,确保与其测量结果及相关工作条件溯源至现有最高计量学等级,包括对能直接溯源至国际单位制(international system of units,SI)导出单位的酶催化活性浓度,及与测量有关仪器设备主要性能参数的量值溯源。本文以肌酸激酶参考测量程序为例,对其量值溯源,涉及的相关因素有时间、容量、温度、分光光度计波长和透光度、比色杯光径、酸度计p H、质量等。以阐明酶活性浓度量值溯源过程中应注意事项,以尽量避免溯源过程中可能出现的偏差。 王惠民 林景星 季伙燕 胡冬梅 吕京 陈宝荣 王建新 沈蕾关键词:酶学 生物信息学分析CysC特异性肽段及质谱验证 被引量:1 2017年 目的用生物信息学技术分析半胱氨酸蛋白酶抑制剂C(Cys C)的特异性肽段及其性质,并用质谱技术验证预测结果。方法用在线软件工具分析胰蛋白酶水解Cys C产生的肽段和同源性,预测特异性肽段质谱扫描离子化碎片信息;对人工合成的特异性多肽样品进行母离子扫描和子离子扫描,人重组Cys C和血清样品经胰蛋白酶水解后分析质谱,比较分析结果与预测结果。结果选择T3(ALDFAVGEYNK)肽段作为Cys C的特异性肽段,用串联质谱对T3样品[M+2H]^(2+)进行子离子扫描,几乎可发现Skyline软件预测的所有b离子和y离子。人重组Cys C和血清样品经胰蛋白酶水解出的肽段与T3*在同一时间出峰。结论用生物信息学技术快速准确地筛选出了Cys C特异性肽段并准确预测该肽段质谱扫描离子化碎片。 沈蕾 王惠民 季伙燕 沈培 王建新关键词:半胱氨酸蛋白酶抑制剂C 生物信息学技术 质谱 一种基于样本重量的医学检验方法 本发明涉及图像压缩传输技术领域,一种基于样本重量的医学检验方法,包括:接收医学检验指令,启动医学检验设备,其中医学检验设备内嵌有样本处理系统、信号采集系统及光谱分析系统,首先,称取原目标样本重量,对原目标样本依次加工处理... 汤自洁 沈蕾 浦江 钱晨 季伙燕 汪桂华