钟宁
- 作品数：8 被引量：4H指数：1
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- 发文基金：山东省科技攻关计划重大科技专项山东省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 胰腺癌蛋白质组学研究
- ＜正＞项目的研究目标是:以胰腺癌为模式建立蛋白质组学技术平台,发现新的胰腺癌肿瘤标志物,建立肿瘤早期诊断和治疗监测方案,为胰腺癌发病机理的研究、早期诊断、预后判断和个体化治疗提供研究基础,并将此模式推广应用于其他类型的肿...
- 韩金祥崔亚洲吴坚美宗美娟常晓天鲁艳芹朱波潘继红黄海燕亓同钢钟宁陈彧田美周小艳宋冠华赵丽刘骁勇张登禄李天亮
- 文献传递
- 基于定量蛋白质组学技术的肿瘤标志物筛选
- 肿瘤标志物研究可以为发病机理研究、诊断和抗癌药物研发提供靶点。胰腺癌发病隐匿，转移发生早，对放化疗不敏感，但可供选择的肿瘤标志物数量却远少于其他大多数恶性肿瘤，使其诊断方法和靶向性治疗的研究发展受到限制，因此发现新的胰腺...
- 韩金祥朱波宗美娟钟宁崔亚洲常晓天鲁艳芹周小艳宋冠华田美亓同钢吴坚美
- 胰腺癌蛋白表达谱的生物信息学分析
- 目的通过生物信息学方法分析胰腺癌蛋白质组学数据。方法对通过蛋白质组学方法筛选出的98种胰腺癌表达上调蛋白使用NCI-Nature、Osprey1.2和DAVID软件分别进行信号通路分析、蛋白质相互作用分析及基因本体论(G...
- 李天亮钟宁周小艳崔亚洲韩金祥鲁艳芹张更林
- Ezrin的原核表达及与其相互作用蛋白的研究被引量：1
- 2009年
- 目的体外筛选人胰腺癌细胞中与Ezrin蛋白相互作用的蛋白。方法提取人胰腺癌Panc-1细胞总RNA,RT-PCR法扩增Ezrin基因。将扩增得到的Ezrin基因片段和pET15b质粒转化E.coli DH5α,获得pET15b-Ezrin重组质粒,双酶切后测序鉴定。将测序正确的重组质粒转化至E.coli BL21-CodonPlus(DE3)-RIL,以异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)诱导表达,对表达产物进行Ni2+-NTA亲和层析和分子筛纯化后,行SDS-PAGE、MALDI-TOF-MS/MS质谱分析和蛋白质印迹鉴定。裂解Panc-1细胞,获得总蛋白提取液,采用Pull-down方法体外筛选与Ezrin重组蛋白相互作用的蛋白,并对筛选出的目的蛋白进行双向凝胶电泳和MALDI-TOF-MS/MS质谱鉴定。结果RT-PCR扩增出的Ezrin基因片段(1761bp)与理论DNA表达片段大小一致,测序鉴定显示克隆的Ezrin基因序列与GenBank报道序列相符。SDS-PAGE、质谱分析和蛋白质印迹分析显示纯化后Ezrin重组蛋白相对分子质量为69400,与质谱分析的相对分子质量结果相符,为带有His-6标签的特异蛋白。双向凝胶电泳和质谱鉴定结果共筛选出可与Ezrin重组蛋白相互作用的7种蛋白,其分别为RNA-binding motif protein39(RBM39)、Transgelin(TAGLN)、Albumin(ALBU)、Formin-1(FMN1)、Rho GTPases(RHGBA)、Tetratricopeptide repeat protein16 (TTC16)、Syntaxin-binding protein1(STXBP1)。结论在大肠杆菌中成功表达、纯化了Ezrin蛋白,并在体外成功筛选出可信的与Ezrin蛋白相互作用的蛋白。
- 周小艳韩金祥崔亚洲张松涛钟宁宋冠华
- 关键词：细胞支架蛋白质类胰腺肿瘤
- 基于定量蛋白质组学技术的肿瘤标志物筛选
- 肿瘤标志物研究可以为发病机理研究、诊断和抗癌药物研发提供靶点。胰腺癌发病隐匿,转移发生早,对放化疗不敏感,但可供选择的肿瘤标志物数量却远少于其他大多数恶性肿瘤,使其诊断方法和靶向性治疗的研究发展受到限制,因此发现新的胰腺...
- 韩金祥崔亚洲常晓天鲁艳芹周小艳宋冠华田美亓同钢吴坚美朱波宗美娟钟宁
- 文献传递
- 胰腺癌蛋白表达谱的生物信息学分析被引量：3
- 2010年
- 目的:通过生物信息学方法分析胰腺癌蛋白质组学数据。方法:对通过蛋白质组学方法筛选出的98种胰腺癌表达上调蛋白使用NCI-Nature、Osprey1.2.0和DAVID软件分别进行信号通路分析、蛋白质相互作用分析及基因本体论(Gene On-tology,GO)分析。结果:98种基因共涉及50条信号通路,其中富集度P值<0.05的信号通路有15条,最具显著性的为HIFα-转录因子信号通路;98种基因在"细胞骨架生成"、"细胞骨架"及"蛋白结合"3种GO中富集度最为显著;在蛋白相互作用网络中,连接度最高的为Ezrin和Vimentin。结论:利用生物信息学方法对蛋白质组学数据进行挖掘,可以为进一步了解胰腺癌的发病机制提供新的思路。
- 李天亮钟宁周小艳崔亚洲韩金祥
- 关键词：胰腺肿瘤蛋白质组学生物信息学
- 胰腺癌蛋白表达谱的生物信息学分析
- 目的：通过生物信息学方法分析胰腺癌蛋白质组学数据.方法：对通过蛋白质组学方法筛选出的98种胰腺癌表达上调蛋白使用NCI-Nature、Osprey1.2.0和DAVID软件分别进行信号通路分析、蛋白质相互作用分析及基因本...
- 李天亮钟宁周小艳崔亚洲韩金祥
- Ezrin的原核表达及与其相互作用蛋白的研究
- 目的体外筛选人胰腺癌细胞中与Ezrin蛋白相互作用的蛋白。方法提取人胰腺癌Panc-1细胞总RNA,RT-PCR法扩增Ezrin基因。将扩增得到的Ezrin基因片段和pET15b质粒转化E.coli DH5a,获得pET...
- 周小艳韩金祥崔亚洲钟宁
- 关键词：EZRIN原核表达相互作用双向电泳
- 文献传递
