刘倩
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
- 供职机构：军事医学科学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 基于转录终点序列特征预测大肠杆菌sRNA被引量：3
- 2011年
- 细菌sRNA是一类长度在40～500nt的调控RNA,在细菌与环境相互作用中发挥重要功能,因此,细菌sRNA识别研究具有重要意义。然而,与蛋白编码基因具有易于识别的特征不同,目前细菌sRNA识别仍是一件比较困难的事。此方法介绍了一个基于已知细菌sRNA转录终点的碱基频率矩阵来识别sRNA的预测策略,并在大肠杆菌K-12 MG1655中进行了sRNA的预测。结果表明,该模型在独立测试集中具有较高的特异性和阳性检出率,因此,这一方法将为实验发现细菌sRNA提供较好的生物信息学支持。
- 刘倩应晓敏吴佳瑤查磊李伍举
- 基于转录终点信号或保守性的大肠杆菌sRNA预测研究
- 细菌sRNA是细菌中普遍存在的一类长度在40~500个核苷酸的调控小分子RNA(small regulatory RNA),主要位于基因间区,但也有位于蛋白编码基因5’端和3’端非编码区的情况。与通常的非编码RNA如tR...
- 刘倩
- 关键词：保守
- 文献传递
