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徐志节

作品数：8 被引量：31H指数：2
供职机构：上海交通大学电子信息与电气工程学院图像处理与模式识别研究所更多>>
相关领域：自动化与计算机技术医药卫生生物学更多>>

合作作者

题名
作者

文献类型

  • 4篇期刊文章
  • 2篇专利
  • 1篇学位论文
  • 1篇会议论文

领域

  • 3篇自动化与计算...
  • 3篇医药卫生
  • 2篇生物学

主题

  • 4篇元胞
  • 4篇图像
  • 4篇自动机
  • 4篇可视化
  • 2篇序列图
  • 2篇序列图像
  • 2篇元胞自动机
  • 2篇生物信息
  • 2篇生物信息学
  • 2篇特征可视化
  • 2篇特征提取
  • 2篇全序列
  • 2篇自动机模型
  • 2篇线性降维
  • 2篇降维
  • 2篇非线性降维
  • 2篇SARS
  • 2篇DNA序列
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白质

机构

  • 8篇上海交通大学

作者

  • 8篇徐志节
  • 7篇杨杰
  • 5篇刘国平
  • 5篇王猛
  • 4篇黄振德
  • 2篇王猛
  • 2篇姚莉秀
  • 1篇戈新良
  • 1篇谢凯
  • 1篇沈文忠
  • 1篇程建

传媒

  • 2篇上海交通大学...
  • 2篇生物医学工程...
  • 1篇2003年全...

年份

  • 1篇2007
  • 2篇2006
  • 3篇2005
  • 1篇2004
  • 1篇2003
共 8 条 记 录，以下是 1-8
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基于LLE的特征提取及应用
本文重点介绍LLE及其改进算法的原理以及他们在膜蛋白数据预测和图像领域中的应用。主要工作包括： 1） 本文详细地介绍了常用的降维方法。 2） 详细介绍了LLE算法思路以及基本原理。 3） LLE算法中有三个参数需要...
徐志节
关键词：特征提取图像分类生物信息学
RNA全序列特征可视化提取方法
一种RNA全序列特征可视化提取方法，主要包括数据预处理、规则选取、元胞自动机CA方法应用及序列图像生成，首先对得到的RNA序列中每个脱氧核糖核酸“A”“T”“G”“U”进行编码，引入一维元胞自动机模型，选用特定的元胞自动...
王猛黄振德杨杰刘国平徐志节姚莉秀
文献传递
智能信息处理技术在抗'非典'中的应用
非典型性肺炎(SARS)是严重危害着人民生命健康的传染性疾病.本文综合运用了多媒体、网络通讯、工作流管理、数据挖掘等高新技术,介绍一个自主研制的基于Netmeeting和数码相机的SARS疑似病人远程会诊系统,以及其中关...
杨杰王猛沈文忠戈新良谢凯程建刘国平徐志节
关键词：远程会诊DNA序列分析图象处理非典型肺炎
文献传递
利用非线性降维方法预测膜蛋白类型被引量：13
2005年
将氨基酸的组成含量以及它们之间的相关系数作为膜蛋白序列的特征向量,采用有监督的局部线性映射(SLLE)的方法对该向量进行降维,并使用最简单的欧氏距离分类器来预测膜蛋白类型.利用统计学中Self-consistency,Jackknife和Independentdataset3种典型方法检验SLLE的降维结果,取得了明显的效果.试验结果表明,SLLE算法能够成功地预测膜蛋白数据类型.
徐志节杨杰王猛
关键词：膜蛋白非线性降维蛋白质组学生物信息学
RNA全序列特征可视化提取方法
一种RNA全序列特征可视化提取方法，主要包括数据预处理、规则选取、元胞自动机CA方法应用及序列图像生成，首先对得到的RNA序列中每个脱氧核糖核酸“A”“T” “G”“U”进行编码，引入一维元胞自动机模型，选用特定的元胞自...
王猛黄振德杨杰刘国平徐志节姚莉秀
文献传递
一种新的彩色图像降维方法被引量：18
2004年
基于内容的图像检索(CBIR)是图像检索的重要分支,而基于颜色的特征提取是CBIR的常用方法之一.如果对图像颜色的特征数提取过多、维数过大,则不利于对图像的快速匹配.本文将图像的色彩直方图作为输入向量,然后采用局部线性映射(LLE)算法对原始数据进行降维,并分别在4种色彩空间下对降维后的彩色图像进行分类.实验证明,在处理非线性数据降维时,LLE较主成分分析(PCA)具有明显的优势.
徐志节杨杰王猛
关键词：图像检索色彩直方图特征提取非线性降维
一种新的SARS DNA序列的可视化分析方法
2006年
传统的DNA序列分析方法是对DNA序列的比对,而本文则给出了一种新的DNA分析方法。它是基于S.W o lfram的元胞自动机(CA)原理,将DNA序列的一维信息转化为二维可视图谱。使用本方法应用于SARSDNA序列分析中,并发现一个SARS病毒不同于其他非SARS病毒的DNA序列特征。通过比对已知的冠状病毒家族各病毒株的全序列二维图谱,证明该特征是SARS病毒所特有的,这有助于SARS的临床鉴定。
徐志节杨杰刘国平王猛黄振德
关键词：元胞自动机SARS可视化
基于SARS RNA序列可视化方法的进一步分析与研究被引量：1
2007年
我们提出了一种新的基因可视化分析方法。该可视化方法基于元胞自动机(CA)原理,将RNA序列的一维信息转化为二维可视图谱;在将此方法应用到SARS RNA序列的分析中,可以发现SARS-CoV病毒不同于其他非SARS的冠状病毒的RNA序列可视特征;在此基础上,对得到的RNA特征序列进行片断提取,用片断可视化取代全序列可视化,并用主成分分析(PCA),支持向量机(SVM)等算法对RNA片断进行分析。结果证明,SARS-CoV的该类特征具有很好的模式可分性,与模式分析方法的结合则可以作为可视化的佐证,可以更充分地利用特征片断作为判别SARS-CoV的一种非常规的手段。
刘国平杨杰徐志节王猛黄振德
关键词：元胞自动机SARS可视化主成分分析支持向量机
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