赵晓宇
- 作品数：5 被引量：6H指数：1
- 供职机构：大连理工大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术医药卫生石油与天然气工程更多>>
- 一种采用知识打分函数的分子对接方法被引量：1
- 2010年
- 分子对接是计算机辅助药物分子优化设计的重要组成部分.引入了一种通过计算原子对间距离来评价结合自由能的知识打分函数,其构造方法与平均力势能函数相似.同时采用基于信息熵的多种群自适应遗传算法,形成一种新型的分子对接程序KGAsDock.给出与著名的分子对接程序DOCK6.1的对接结果比较,数值实验表明,该算法在不降低计算效率的前提下,提高了对接的精度.
- 王希诚赵晓宇康玲李洪林
- 关键词：分子对接遗传算法
- 一种精细药物分子对接模型和优化方法被引量：1
- 2008年
- 首先阐述了分子对接设计的基本原理,然后在蛋白质受体中引入关键残基的概念,建立了一个新的柔性分子对接模型.以配体的中心坐标以及它和受体关键残基的旋转键角为设计变量,以设计变量的尺寸为约束,通过最小化分子间相互作用能得到分子的最优取向和构象.一个自适应的遗传算法被用于求解上述优化模型,该算法采用多种群遗传策略、信息熵控制的空间减缩搜索技术以及拟精确罚函数方法,较好地平衡了效率与精度之间的关系,从而能够快速而稳定地逼近最优解.在此基础上,发展了新的精细分子对接程序,该程序可以进行受体与配体的柔性对接.药物分子对接实例证明,本文发展的精细药物分子对接算法和程序能够有效地用于药物分子设计.
- 康玲李洪林赵晓宇王希诚
- 关键词：分子对接
- 单层保温管外腐蚀失效模式及改进方法研究
- 随着海洋油气资源的大量开采，海底管道作为海洋资源输运最重要的途径，其腐蚀问题已引起了高度的重视。由于海底管道长期处于恶劣的海洋环境中，其外腐蚀破坏的原因也十分复杂，而近几年运行期单层保温管道腐蚀事故的频发，也暴露出国内对...
- 赵晓宇
- 关键词：海底管道电化学性能计算机模拟
- 药物分子设计的多目标优化模型和算法
- <正> 新药的研发是一个高投入、低效率的工作,据统计,一个新药从筛选到成功上市,大约平均需要花费14年的时间,中间过程的花费则高达2.0-3.5亿美元,并且这一费用继续逐年增长。医药产业正面临着一个提高药物投放市场成功率...
- 李洪林赵晓宇王希诚
- 文献传递
- 药物分子对接的优化模型与算法
- 药物的设计和研发工作长久以来以其高投入、高风险的特质成为制约药物领域发展的重要因素。随着上世纪计算机技术的迅猛发展，将计算机技术、优化方法与药物设计三者融合而成的计算机辅助药物分子设计已经成为创新药物研究的重要领域;而药...
- 赵晓宇
- 关键词：药物分子分子对接遗传算法信息熵药物设计计算机辅助设计
- 文献传递
