- 二联咪唑环芳识别氨基酸甲酯的理论研究
- 2013年
- 对二联咪唑环芳(DBICP)受体和氨基酸甲酯(AME)配体间的相互作用,重点从受配体间的电荷转移和配体溶剂可及表面积2个方面进行研究。受配体各单体经G03在B3LYP/6-31G(d)水平上优化后,用CDOCKER将配体与受体对接,为每对复合物获得了一组最低能量的初始构象。将构成复合物的单体及每个复合物初始构象用Turbomole在BLYP/def-TZVP水平进行几何构型优化。之后对收敛后的复合物最低能量构象及各单体作NBO分析。以受配体间的电荷转移量及配体带负电荷原子的溶剂可及表面积构建了表达复合物稳定性的2参数定量关系模型。该模型能准确地计算DBICP-AME复合物的结合常数,计算值与实验值间的相关系数高达0.997。最后对DBICP与AME间的相互作用进行讨论,揭示了一些共同作用特征。
- 刘祥均娄永峰肖蓉杨明理向明礼
- 关键词：分子间相互作用密度泛函理论
- 手性咪唑环芳识别氨基酸甲酯的作用模式研究
- 2010年
- 采用Gaussian 03在B3LYP/6-31G(d)水平上分别优化手性咪唑环芳受体和氨基酸甲酯配体,并在同样条件下计算NBO电荷。用AutoDock Vina将优化后的受体、配体进行对接,获得相应复合物的最稳定构象。以复合物亲和能和配体侧链电子电荷指数,建立了表达复合物稳定常数的定量关系模型。从单体的NBO电荷分布、复合物最稳定构象等方面分析探讨,发现静电吸引、受体配体间的空间匹配和氢键作用等,是影响手性咪唑环芳选择性识别氨基酸甲酯的主要影响因素。
- 娄永峰向明礼杨明理
- 关键词：分子力学密度泛函理论分子识别氨基酸甲酯
