郑凤荣
- 作品数:8 被引量:6H指数:2
- 供职机构:国家海洋局第一海洋研究所更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划国家海洋公益性行业科研专项公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 军曹鱼淋巴囊肿病毒的系统关系研究及基因型分析被引量:3
- 2007年
- 从患淋巴囊肿病的养殖军曹鱼肿瘤中分离到一种虹彩病毒,命名为淋巴囊肿病毒军曹鱼分离株(LCDV-rc)。为探讨LCDV-rc的系统地位,从DNA水平上分析了该病毒株与淋巴囊肿病毒中国牙鲆分离株(LCDV-cn)、淋巴囊肿病毒韩国鲈鱼分离株(LCDV-sb)、淋巴囊肿病毒日本牙鲆分离株(LCDV-jf)、淋巴囊肿病毒欧洲分离株(LCDV-1)和淋巴囊肿病毒日本岩鱼分离株(LCDV-rf)的系统关系。以核衣壳蛋白(MCP)基因为分子标记,通过PCR扩增和克隆测序获得了长度为1356bp的含178个信息位点的mcp基因序列;用最大简约法、最大似然法、邻接法和Bayesian法构建了分子系统树并进行了置信度检验。结果表明,构建的淋巴囊肿病毒ML、NJ、MP和Bayesian系统树的拓扑结构一致,LCDV-rc和LCDV-sb聚为一支,LCDV-cn和LCDV-jf聚为一支,LCDV-1和LCDV-rf分别各为一支。在35种虹彩病毒的系统关系分析中,LCDV-rc与另5株淋巴囊肿病毒在系统树上聚为一大支,说明LCDV-rc与淋巴囊肿病毒的关系近于其他虹彩病毒。根据遗传距离和系统关系分析认为,LCDV-rc属于一种新的基因型,称其为淋巴囊肿病毒Ⅳ型基因型。
- 闫秀英孙修勤吴淑勤吴谡琦张进兴洪旭光郑凤荣曲凌云
- 关键词:虹彩病毒基因型
- 牙鲆淋巴囊肿病的多肽疫苗的制备方法
- 一种牙鲆淋巴囊肿病的多肽疫苗的制备方法,首先对已知的淋巴囊肿病毒欧洲分离株基因组序列所进行的生物信息学分析而得到牙鲆淋巴囊肿病毒中国分离株核衣壳蛋白和囊膜蛋白的3个模拟表位,然后依据模拟表位的氨基酸序列,合成得到相应的3...
- 吴谡琦孙修勤张进兴郑凤荣洪旭光曲凌云
- 文献传递
- 牙鲆淋巴囊肿病的多肽疫苗的制备方法
- 一种牙鲆淋巴囊肿病的多肽疫苗的制备方法,首先对已知的淋巴囊肿病毒欧洲分离株基因组序列所进行的生物信息学分析而得到牙鲆淋巴囊肿病毒中国分离株核衣壳蛋白和囊膜蛋白的3个模拟表位,然后依据模拟表位的氨基酸序列,合成得到相应的3...
- 吴谡琦孙修勤张进兴郑凤荣洪旭光曲凌云
- 文献传递
- 卵巢成熟期和退化期星斑川鲽脑垂体和下丘脑组织的转录组比较分析被引量:2
- 2017年
- 为了解星斑川鲽(Starry Flounder,Platichthys stellatus)脑组织基因表达与卵巢发育调控的关系,发掘相关功能基因,研究提取卵巢成熟期和退化期星斑川鲽雌鱼脑垂体和下丘脑组织总RNA,运用Hi Seq 2000高通量测序技术进行转录组测序分析。测序结果经拼接组装后共获得30640条Unigenes,Blast同源性比对显示,其中24128条Unigenes获得注释;经egg Nog功能注释后29137条Unigenes序列分为26类,分别涉及信号转导、翻译机制等生理生化过程。KEGG pathway数据比对显示,卵巢成熟期涉及98种代谢途径,135条序列表达上调;卵巢退化期涉及192种代谢途径,648条序列表达上调。Unigenes表达量及表达差异分析表明在卵巢成熟期334条序列表达上调,卵巢退化期987条序列表达上调。获得功能注释的Unigene中,408条涉及生殖调控和内分泌调控,参与生殖调控的信号分子有1508条。试验采用实时定量PCR研究了涉及生殖调控和内分泌调控基因促性腺激素释放激素(Gn RH)、神经激肽B(NKB)、促性腺激素(Gt H)、促滤泡激素(FSH)、肿瘤转移抑制因子(Kiss)以及催乳素释放肽受体(Pr RPR)在卵巢两个不同发育时期脑垂体和下丘脑的表达情况,结果表明除FSH外,其余均在卵巢退化期时期脑组织中表达升高,与转录组测序结果趋势一致。
- 周江王丽娟王波郑凤荣王长海
- 关键词:星斑川鲽转录组测序实时定量PCR
- 病原微生物模拟表位的生物信息学筛选方法
- 一种病原微生物模拟表位的生物信息学筛选方法。本方法首先对LCDV-1基因组序列进行了BLAST比对,从中筛选得到保护性抗原蛋白候选基因TK和ORF29;然后分别对两个基因表达的蛋白质进行了疏水和亲水性、抗原性和跨膜结构分...
- 吴谡琦孙修勤张进兴郑凤荣洪旭光曲凌云
- 文献传递
- 养殖新品种钢头鳟的种质特征分析被引量:1
- 2012年
- 钢头鳟(Oneorhynehus mrkiss,Domsea Steelhead trout),俗称丹虹三纹鱼、钢头三纹鱼(steelhead—salmon)、钢头(steelhead)、三纹鳟(salmon—trout)等。与虹鳟(rainbow trout)属于同一品种的不同品系,在产卵时期、分布区域等方面存在一定的差异。钢头鳟的肉呈鲜橙色,肉质结实中不乏爽滑,做生鱼片,
- 王波王伟刘建军郑凤荣丛柏林
- 关键词:品种钢虹鳟种质特征养殖生鱼片分布区
- 丹虹三纹鱼的生物学特征
- 丹虹三纹鱼(Oncorhynchus mykiss)学名钢头鳟(Domsea Steelhead trout),又称钢头三纹鱼(steelhead-salmon)、钢头(steelhead)、三纹鳟(salmon-tro...
- 王波刘建军郑凤荣丛柏林
- 关键词:良种选育生态特征鱼肉品质
- 文献传递
- 养殖刺参皮肤腐烂病病原的分离鉴定
- 近年来我国刺参养殖业得到了迅速发展,但随之而来的刺参的疾病发生也日渐增多。国内外各研究者对刺参养殖过程中导致皮肤溃烂、肿嘴等流行病症状发生的病原,已做了不少研究,但关于导致皮肤溃烂、肿嘴、吐脏几种病症的病原到底是细菌还是...
- 郑凤荣
- 关键词:刺参疾病细菌病毒