叶楠
- 作品数:7 被引量:18H指数:2
- 供职机构:重庆大学更多>>
- 发文基金:教育部“春晖计划”重庆市应用基础研究项目霍英东基金更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生理学轻工技术与工程更多>>
- 新分子距边矢量用于环境毒物多氯代二苯并呋喃的定量结构保留相关建模被引量:12
- 2005年
- 在烷烃分子距离边数矢量基础上, 提出以基团作拟原子为基准的新分子距边矢量(μ), 借助多元线性回归方法(MLR)分别建立了多氯代二苯并呋喃(PCDF)在非极性、中等极性、极性色谱柱上的色谱保留参数与其结构表征矢量μ之间的定量相关模型. 为检验该定量结构保留相关(QSRR)模型的稳定性和预测能力, 采用留一法(LOO)进行了交互校验(CV). 对非极性色谱柱(DB-5)上色谱保留指数RI及相对保留时间RRT的QSRR模型, 其相关系数R都在0.99以上; 对另外两种非极性固定相色谱柱(OV-101, SE-54)上相对保留时间RRT的QSPR模型, 其相关系数R>0.98; 对中等极性固定相(OV-1701)色谱柱上相对保留时间RRT的QSRR模型, 其相关系数R>0.95; 而对极性色谱柱SP-2310上色谱保留指数QSRR模型的相关系数R较小, 仅为0.90左右(R = 0.884~0.958). 表明新分子距边矢量m 能很好地表征二苯并呋喃在非极性及中等极性色谱柱上的色谱保留行为; 而对极性色谱柱上的色谱保留行为的表征能力较差, 尚需改进.
- 邓洪黄萍胡银玉叶楠李志良
- 关键词:多氯代二苯并呋喃QSRR
- 电性距边矢量系统(MED)应用于生物医药分子建模与定量构效优化
- 李志良刘树深蔡绍皙李根容吴世容廖春阳周丽平张梦军梅虎孙立力杨胜喜覃仁辉曹晨忠熊清周原李波叶楠兰玉坤侯敏刘振德李伯玉聂金媛尹子卉徐红王远强曾晖刘永红仇亮加林光华
- 该课题据分子拓扑结构并依原子划分方案,按原子电性和间距描述相互作用,提出系列二维新型电性距边矢量(MED/MDE/MEE/MHD)描述子,用于生物与药物及毒物分子结构表达。通过不同结构分辨及定量构效相关考察,证明能高效简...
- 关键词:
- 关键词:医药
- 分子电性距离矢量(MEDV-B)用于二肽的分子结构表征与生物功能预测被引量:5
- 2005年
- 使用从分子一级拓扑结构出发、结合分子中非氢原子电性和键连属性以及原子间相对距离的分子电性距离矢量(MEDV-B),对58个血管紧张素转化酶(ACE)抑制剂二肽和48个苦味(BT)二肽进行定量结构活性相关(QSAR)研究,用多元线性回归建立矢量描述子与活性观测值间相关模型,并用留一法交互校验(LOO-CV)检验其预测力,取得较满意的结果(ACE:n=58,m=10,R=0.894,Rcv=0.818;BT:n=48,m=10,R=0.947,R=0.898);再用逐步回归对变量进行筛选与优化,建立新模型,稳定性与预测力得到进一步改善(AACE:n=58,m=5,R=0.859,Rcv=0.824;BT:n=48,m=5,R= 0.931,Rcv=0.908)。结果表明:该矢量描述子可用于二肽结构表征与生物功能预测,且计算简便。
- 王远强熊清叶楠李志良
- 关键词:定量结构活性相关分子电性距离矢量
- 环境毒物分子结构参数化表达与色谱保留定量性相关研究被引量:1
- 2002年
- 在烷烃分子距边矢量的基础上 ,提出一种以各种非氢原子为基准的分子距离边数矢量(VMDE ;μ矢量 ) ,表征了环境有毒物二的分子结构并借助多元线性回归方法分别建立了二在非极性与极性色谱柱上的色谱保留指数或相对保留时间与其结构表征参数 μ矢量间的定量结构保留关系(QSRR)模型 .在非极性与极性色谱柱 (DB - 5 ,SP - 2 10 0 ,SE - 5 4 ,OV - 170 1)上色谱相对保留时间的QSRR模型的线性相关系数均在 0 .93以上 ,高达 0 9985。为检验模型的稳定性和预测能力 ,还进行了留一法交互校验 (crossvalidationwithleave -one -outofprocedure) ,结果优良。
- 王远强叶楠董建文李志良
- 关键词:分子结构色谱保留QSRR二恶英环境毒物
- 肽定量构效关系的研究与应用
- 李志良梅虎周原周鹏吴世容李根容杨胜喜蔡绍皙梁桂兆刘树深曾晖田菲菲张巧霞陈刚张梦军周丽平廖春阳杨力叶楠熊清杨善彬兰玉坤刘振德李伯玉覃仁辉聂金媛李波侯敏尹子卉王远强曹晨忠林志华仇亮加徐红王娇娜刘永红陈国华彭传友邓婕等
- 该项目从拓扑结构、物化性质及相互作用等方面,建立起肽定量构效关系(QSAR)分子结构表征体系,通过最优化实验设计方法及自适应构效模型技术,实现相关肽和蛋白质的定量化生物活性预测与功能开发。该成果深层次融合肽定量构效关系研...
- 关键词:
- 关键词:定量构效关系
- HMG-CoA还原酶阻滞剂的多维多元定量构效关系
- 2001年
- 采用比较分子场 (CoMFA)分析法和偏最小二乘回归 (PLS)法对十多种HMG -CoA还原酶阻滞剂的构效关系进行了多维定量建模研究。在描述变量数远远超过样本数的情况下 ,经典的Hansch方法等均不适应 ,而笔者的方法可给出良好结果。
- 王远强叶楠李志良白石Y宫下Y佐佐木S
- 关键词:HMG-COA药物
- 核酸与分子建模及结构表达启动子强度预测
- 2003年
- 从核酸分子的一级结构出发 ,基于分子中原子间距离及各原子电负性 ,构建了能描述核酸分子结构的系列参数 :分子电性边数矢量简称分子电边矢量。据此对 38个脱氧核糖核酸 (DNA)启动子序列的强度进行定量结构活性相关 (QSAR)及定量序列活性模型 (QSAM)研究 ,取得良好结果。与其它方法相比 ,分子电边矢量具结构分辨率高、活性相关性好、计算简便等特点 。
- 李波仇亮加李劲为叶楠李志良
- 关键词:脱氧核糖核酸启动子序列生物大分子