目的分析我国大陆地区柯萨奇病毒A组10型(coxsackievirus A10,CV-A10)流行株基因结构及引起重症手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)毒株的序列特征.方法从美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)数据库下载我国大陆地区各省份或地区不同年份的流行株序列信息,使用MEGA5.2软件构建系统进化树,应用Simplot软件进行重组分析,应用MegAlign软件对引起厦门2015年重症手足口病暴发的毒株进行比对分析.结果我国大陆地区在2010年之前曾有LineageC毒株流行,2010年之后流行的毒株均属于Lineage E,且表现为E2和E3毒株共同流行的趋势.未见已报道的CV-A10大陆流行株与其他血清型人类肠道病毒发生重组.引起不同症状的毒株在序列同源性上未见显著差异,而引起厦门2015年重症HFMD暴发的毒株在5′-UTR区128~130位点处存在3个核苷酸位点(ACT)缺失.结论应加强CV-A10的监测和流行病学研究,为CV-A10疫苗及多价HFMD疫苗的研发奠定基础.
目的探讨接种疫苗诱导免疫应答的机制,为疫苗的研发和应用提供理论基础。方法运用整合分析(Meta分析),分析自美国生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)的基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载的3套疫苗免疫基因芯片表达谱数据,初步筛选出疫苗免疫机体后获得性免疫在转录水平上的关键基因及通路。结果应用Meta分析得到疫苗免疫3套数据集的共同差异基因1 403个,其中表达水平上调基因709个,主要包括人类真核翻译延伸因子(EEF1A1)、白细胞介素18(IL-18)和核糖体蛋白大亚基P2(RPLP2)等,富集出自然杀伤细胞(natural killer,NK)介导的细胞毒作用和B细胞受体信号通路等26条通路;表达水平下调的基因694个,主要包括核糖体蛋白L41(RPL41)、核糖体蛋白L32(RPL32)、核糖体蛋白L34(RPL34)和胞浆多聚A结合蛋白3(PABPC3)等,富集出氧化磷酸化和T细胞受体信号通路等11条通路。结论应用Meta分析方法获得多个疫苗免疫机体后诱导获得性免疫的关键基因及通路,对了解疫苗的免疫机制具有重要意义。
肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)为手足口病(Handf,oot and mouth disease,HFMD)和相关疾病的主要病原体,多感染婴幼儿,少数病例可以并发呼吸道感染和心肌炎、无菌性脑膜炎、脑炎、急性弛缓性麻痹等严重疾病,可致残、致死。因此EV71实验室诊断对EV71引起疾病的治疗和防控具有重要意义。本文将从核酸检测、抗体检测及其他检测等三部分对EV71的实验室诊断方法研究进展进行了综述。
