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吴爽

作品数：7 被引量：19H指数：2
供职机构：陕西师范大学更多>>
发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金陕西省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
相关领域：自动化与计算机技术哲学宗教医药卫生更多>>

合作作者

文献类型

  • 3篇期刊文章
  • 2篇学位论文
  • 2篇专利

领域

  • 4篇自动化与计算...
  • 1篇哲学宗教
  • 1篇医药卫生

主题

  • 5篇PPI网络
  • 3篇优化算法
  • 3篇网络
  • 3篇聚类
  • 3篇加权
  • 2篇蛋白
  • 2篇蛋白质
  • 2篇蛋白质相互作...
  • 2篇蛋白质相互作...
  • 2篇鱼群算法
  • 2篇数据库
  • 2篇群算法
  • 2篇人工蜂群
  • 2篇人工鱼
  • 2篇人工鱼群
  • 2篇人工鱼群算法
  • 2篇相互作用
  • 2篇聚类算法
  • 2篇加权图
  • 2篇加权网络

机构

  • 7篇陕西师范大学

作者

  • 7篇吴爽
  • 5篇雷秀娟
  • 2篇李永明
  • 2篇郭玲
  • 2篇田建芳
  • 2篇裘国永
  • 1篇黄旭

传媒

  • 1篇电子学报
  • 1篇计算机应用研...
  • 1篇计算机科学

年份

  • 1篇2019
  • 1篇2015
  • 5篇2012
共 7 条 记 录，以下是 1-7
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排序方式：
基于人工蜂群繁殖机制的PPI网络聚类方法
本发明公开了一种基于人工蜂群繁殖机制的PPI网络聚类方法，具体包括如下步骤：将PPI网络转化为无向加权图；参数设置；对PPI网络的每个结点和边预处理；计算所有结点的加权网络综合特征值；初始化蜂后；婚飞过程；幼蜂的局部搜索...
雷秀娟李永明田建芳裘国永吴爽尤梦丽
文献传递
基于批判视角的彼得·辛格动物解放思想研究
彼得·辛格是当代著名的澳大利亚裔美国籍哲学家和伦理学家。他在功利主义哲学的基础上,提出了动物解放理论。主张人们将道德关怀的范围直接扩展到动物界,将自由、平等、博爱等人道主义精神也推广到动物世界。辛格认为动物们和人类一样,...
吴爽
关键词：彼得·辛格动物解放
PPI网络的改进谱聚类算法被引量：1
2012年
蛋白质相互作用(PPI)网络是生物信息学的一个新的研究领域。近年来谱聚类算法在未知蛋白质的功能预测方面发挥了重要作用,但是它要求事先确定聚类数目,为此提出了一种基于边的得分搜索的谱聚类算法。该算法采用谱聚类方法对数据进行预处理,并通过构造蛋白质节点之间的边的得分矩阵找到数据样本之间的相关性,同时融入粒子群算法来确定边的得分的最佳选择阈值,最后用广度优先遍历结点的方法得到聚类结果。算法在PPI网络数据集上进行了测试,结果表明该算法不但可以自动确定聚类数目,而且聚类结果的正确率和F-measure值都得到了提高。
吴爽雷秀娟郭玲
关键词：谱聚类算法粒子群优化算法蛋白质相互作用网络
基于人工蜂群繁殖机制的PPI网络聚类方法
本发明公开了一种基于人工蜂群繁殖机制的PPI网络聚类方法，具体包括如下步骤：将PPI网络转化为无向加权图；参数设置；对PPI网络的每个结点和边预处理；计算所有结点的加权网络综合特征值；初始化蜂后；婚飞过程；幼蜂的局部搜索...
雷秀娟李永明田建芳裘国永吴爽尤梦丽
文献传递
基于连接强度的PPI网络蚁群优化聚类算法被引量：16
2012年
由于PPI网络数据的无尺度和小世界特性,使得目前对此类数据的聚类算法效果不理想.根据PPI网络的拓扑结构特性,本文提出了一种基于连接强度的蚁群优化(Joint Strength based Ant Colony Optimization,JSACO)聚类算法,该算法引入了连接强度的概念对蚁群聚类算法中的拾起/放下规则加以改进,以连接强度作为拾起规则,对结点进行聚类,并根据放下规则放弃部分不良数据,产生最终聚类结果.最后采用了MIPS数据库中的PPI数据进行实验,将JSACO算法与PPI网络数据的其他聚类算法进行比较,聚类结果表明JSACO算法正确率高,时间开销低.
雷秀娟黄旭吴爽郭玲
关键词：PPI网络蚁群优化算法聚类
基于群智能机理的PPI网络功能模块聚类
随着人类基因组计划的完成和蛋白质组学的研究进展,由生物体动态产生并执行遗传程序的蛋白质逐渐进入人们的视线。众所周知,蛋白质是是构成一切细胞组织的必不可少的成分,是生理功能的执行者。但是研究表明细胞中的大部分蛋白质并不是孤...
吴爽
关键词：蛋白质相互作用网络人工鱼群算法细菌觅食优化算法直觉模糊集
文献传递
融合人工鱼群机理的PPI网络聚类模型与算法被引量：2
2012年
预测蛋白质交互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)网络中未知蛋白质的功能,是生物信息学的一个研究热点。目前基于功能流的方法能有效地解决PPI网络的聚类问题,但是其正确率偏低、时间复杂度较高。为此提出了一种融合人工鱼群机理的PPI网络聚类模型与算法:将人工鱼看作一组聚类中心,觅食行为是指从每个聚类中心开始向它的邻接结点搜索并添加结点到该聚类模块中;接下来将目标函数值最大的人工鱼对应的一组聚类模块看作初始的聚类结果,对应鱼群的追尾行为;剩下的人工鱼开始执行聚群行为,判断对应的聚类模块与初始的聚类结果之间的相似度。如果相似度低于给定的阈值,则将聚类模块添加到初始的聚类结果中。PPI数据集上的仿真实验表明,该算法可以自动确定聚类数目,而且聚类结果的正确率和算法的运行效率都优于功能流算法。
吴爽雷秀娟
关键词：人工鱼群算法
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