李雪松
- 作品数：7 被引量：42H指数：4
- 供职机构：上海海洋大学水产与生命学院水产种质资源发掘与利用省部共建教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：上海市教育委员会科技发展基金国家公益性行业科研专项公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- “粉玉”体色瓯江彩鲤MHC class Ⅱ B基因多态性及其与鱼体抗病力的关系被引量：9
- 2012年
- 利用1对特异性引物DABF和DABR,分别从30尾感病和13尾抗病"粉玉"体色瓯江彩鲤(Cyprinus carpiovar.color)的cDNA中扩增出长度为624 bp的MHC classⅡB基因片段。对210个有效克隆进行测序,获得84个不同的编码序列,分属13个不同的等位基因,其中Cyca-DAB3*17和Cyca-DAB3*18为新发现的2个等位基因。核苷酸、氨基酸变异位点总数为267、130,变异率较高(42.79%、62.50%)。MHCⅡB基因片段包括第1 4个外显子,分别编码信号肽、β1和β2结构域及跨膜区。β1结构域的变异明显大于β2结构域,表现为在长度为276 bp的β1结构域中,核苷酸、氨基酸变异位点分别为150个(54.35%)和72个(78.26%);而长度为282 bp的β2结构域的核苷酸、氨基酸变异位点较少,分别为105个(37.23%)和54个(57.45%)。在β1结构域的24个抗原结合位点(PBR)上,有22个发生了变异。β1结构域的PBR、非抗原结合位点(non-PBR)及β2结构域的非同义碱基替换率(dN)与同义碱基替换率(dS)的比值ω分别为1.366、0.992、0.792,表明"粉玉"体色瓯江彩鲤MHC classⅡB基因的β1结构域在进化过程中受到正向选择作用。基因Cyca-DAB3*09在抗病群体中出现的频率(7.81%)显著高于感病群体(1.37%,P<0.05),新等位基因Cyca-DAB3*18(频率为3.13%)只出现在抗病群体中,基因Cyca-DAB1*08、Cyca-DAB3*08和Cyca-DAB3*17为感病群体所特有。研究结果为抗病"粉玉"体色瓯江彩鲤的选育奠定了基础。
- 赵雪锦刘至治李雪松王宇王成辉
- 关键词：多态性
- 四种改良CTAB法提取大叶朴基因组DNA比较研究被引量：10
- 2010年
- 以大叶朴成熟叶片为试材,采用4种改良CTAB法提取大叶朴基因组DNA,并比较其提取效果。结果表明:用这4种方法均可获得没有发生褐变、完整性好的DNA。其中方法2(用了低浓度乙醇和高盐去多糖)和方法4(用了低浓度乙醇去多糖)去多糖的效果更好一些,但获得的DNA浓度较低;ISSR扩增结果表明,4种方法提取的DNA均可用于ISSR扩增,但方法2和3扩增的效果稍好一些。
- 赵静叶欢李雪松李建华
- 关键词：改良CTAB法基因组DNA多糖褐变
- 鲢长江群体与国外移居群体间遗传变异的主要组织相容性复合体分析被引量：2
- 2012年
- 利用MHCⅠ类α2结构域基因片段,分析鲢长江群体(YZL)与多瑙河群体(DAN)、密西西比河群体(MIS)间的遗传变异。从3群体共40尾个体的117个有效克隆中,获得MHCⅠ类α2结构域等位基因68个。主要结果为:(1)YZL、DAN和MIS群体的等位基因数分别为21、27和20个,且群体间核苷酸序列(54.1%～99.5%)、氨基酸序列(39.4%～98.6%)的同源性变异范围大,揭示3群体MHCⅠ类α2结构域的多态性都较丰富。(2)群体内平均核苷酸/氨基酸序列同源性的大小顺序为MIS>DAN>YZL;而群体内核苷酸/氨基酸多样性指数(π/πaa)的大小顺序恰与此相反,表明鲢YZL群体MHCⅠ类α2结构域的变异较DAN和MIS群体大。(3)以氨基酸序列进行AMOVA分析的结果表明,3群体间、国内群体与国外移居群体间都存在显著的遗传分化(P<0.05)。(4)3群体抗原结合区(PBR)的非同义碱基/同义碱基替换值ω的大小顺序为YZL(1.652 5)>MIS(1.499 5)>DAN(1.337 0)>1,且在PBR区检测到5个正向选择位点,揭示3群体鲢MHCⅠ类分子均受到正向选择压力的作用,其中YZL群体的选择压力最大。
- 冯维刘至治李思发李雪松唐文乔杨金权
- 关键词：主要组织相容性复合体
- “全红”体色瓯江彩鲤MHC-DAB基因多态性及其与鱼体抗病力关系的分析被引量：17
- 2011年
- 利用一对特异性引物DABF和DABR,分别从21尾感病和16尾抗病"全红"体色瓯江彩鲤的cDNA中,扩增出长度为624 bp的MHC-DAB基因片段。共测序185个有效克隆,获得76个不同的核苷酸序列。MHC-DAB基因片段包括第1～4外显子,分别编码信号肽、β1和β2结构域及跨膜区。长度为276 bp的β1结构域有144个核苷酸变异位点(52.17%)和70个氨基酸变异位点(76.07%),而长度为282 bp的β2结构域只有98个核苷酸变异位点(34.75%)和50个氨基酸变异位点(53.19%),显示β1结构域的变异要明显大于β2结构域。在β1结构域的24个抗原结合位点(PBR)上,有23个发生了变异。β1结构域的PBR、非抗原结合位点(non-PBR)及β2结构域的ω值(ω=dN/dS)分别为1.367、0.886和0.754,表明"全红"体色瓯江彩鲤MHC-DAB基因(特别是β1结构域)在进化过程中受到正向选择作用。在所得的20个不同的等位基因中,基因DAB3*15在抗病群体中出现的频率(13.75%)显著高于感病群体中出现的频率(3.81%)(P<0.05);基因DAB3*09和DAB3*10的出现频率都为3.75%(P<0.05),仅存在于抗病群体中;而基因DAB3*02和DAB3*14的出现频率分别为7.62%(P<0.05)和8.57%(P<0.01),仅存在于感病群体中。
- 李雪松刘至治赵雪锦马晓茜冯维王成辉
- 关键词：瓯江彩鲤主要组织相容性复合体多态性
- 湖北三潭风景区野生省沽油遗传多样性的ISSR分析被引量：4
- 2010年
- 采用ISSR分子标记技术对湖北三潭风景区野生省沽油群体32个样本进行遗传多样性分析,从18条ISSR引物中筛选出10条引物用于PCR扩增,共扩增出147条DNA条带,其中多态性条带134条,占91.16%,平均每个引物扩增条带的数目为14.7条。利用POPGENE1.32和NTSYS-pc软件分析得出该野生省沽油样本的平均有效等位基因数为1.4319,平均Nei′s基因多样性指数为0.2653,平均Shannon信息指数为0.4118;样本间的遗传相似系数在0.47～0.87之间;UPGMA聚类结果,在遗传相似性系数0.6558处可把供试的32个样本分为3大类,表明该野生省沽油群体的遗传多样性比较丰富。
- 叶欢李建华汪殿蓓李雪松田春元
- 关键词：省沽油ISSR
- “全红”体色瓯江彩鲤MHC多态性及其与鱼体抗病力关系的分析
- 主要组织相容性复合体/(Major Histocompatibility Complex, MHC/)是存在于脊椎动物体内与免疫功能密切相关的高度多态的基因群。许多研究表明，MHC不同等位基因与机体的抗病力密切相关。本研...
- 李雪松
- 关键词：瓯江彩鲤主要组织相容性复合体多态性抗病力
- 文献传递
- 大贵寺国家森林公园野生青檀居群的遗传多样性被引量：8
- 2011年
- 利用ISSR分子标记技术对湖北省大贵寺国家森林公园野生青檀(Pteroceltis tatarinowii Maxim.)居群进行遗传多样性分析。用11条ISSR引物对6个青檀居群64个样品进行扩增,扩增片段长度在200 bp至3 000 bp之间,检测到179个位点,其中多态位点165个,多态位点百分率(P)为92.14%。青檀在物种水平上的Nei基因多样性指数(He)和Shannon信息指数(I)分别为0.273和0.423,在居群水平上分别为0.225和0.343,显示出青檀有着较高的遗传多样性。居群间的遗传分化系数(GST)为0.192,表明青檀居群间存在着较大的遗传分化;UPGMA聚类分析表明遗传距离与海拔差距有一定的相关性,相邻海拔的青檀居群间遗传距离较近。不同海拔导致的异质生境可能是影响青檀居群遗传分化的主要原因。
- 李建华李雪松田春元邹礼平汪殿蓓
- 关键词：青檀ISSR标记
