赵雪锦
- 作品数：6 被引量：22H指数：2
- 供职机构：上海海洋大学更多>>
- 发文基金：上海市教育委员会科技发展基金公益性行业(农业)科研专项国家公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 玻璃红鲤MHCⅡ类基因多态性与组织表达分析被引量：2
- 2013年
- 以cDNA为模板进行PCR扩增和克隆分析,从7尾玻璃红鲤(Cyprinus carpio var.wananensis)的70个有效克隆中,获得长度为624 bp的MHC IIα/β不同编码序列25/31个,分属于7/10个不同等位基因,揭示玻璃红鲤MHC II类基因的多态性仍较丰富。其中Cyca-DXA17*01和Cyca-DAB1*1201、Cyca-DAB1*1301、Cyca-DAB3*1901、Cyca-DAB3*2001、Cyca-DAB3*2101、Cyca-DAB3*2201为新发现的7个基因。分析表明,α1/β1结构域的核苷酸/氨基酸变异位点数明显高于α2/β2结构域;α1、β1结构域抗原结合位点(PBR)的ω值(ω=dN/dS,5.209和1.703)都大于1,揭示玻璃红鲤MHC II类基因在进化过程中受到正向选择作用。半定量分析显示,玻璃红鲤MHC II类基因在肾和脾中有较强表达,中等程度表达于胃、肝和肠,而鳃、心和眼的表达较弱。
- 张天睿刘至治刘俊赵雪锦王成辉
- 关键词：组织特异性表达
- “粉玉”体色瓯江彩鲤MHC II类基因多态性与鱼体抗病力的关系及补体C9基因的全长克隆与表达
- 本研究以“粉玉”体色瓯江彩鲤为对象,人工感染嗜水气单胞菌(AEROMONASHYDROPHILA)后,一方面分析主要组织相容性复合体(MAJORHISTOCOMPATIBILITYCOMPLEX,MHC)II类α和β基因...
- 赵雪锦
- 关键词：主要组织相容性复合体多态性抗病力
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- “粉玉”体色瓯江彩鲤MHC class Ⅱ B基因多态性及其与鱼体抗病力的关系被引量：9
- 2012年
- 利用1对特异性引物DABF和DABR,分别从30尾感病和13尾抗病"粉玉"体色瓯江彩鲤(Cyprinus carpiovar.color)的cDNA中扩增出长度为624 bp的MHC classⅡB基因片段。对210个有效克隆进行测序,获得84个不同的编码序列,分属13个不同的等位基因,其中Cyca-DAB3*17和Cyca-DAB3*18为新发现的2个等位基因。核苷酸、氨基酸变异位点总数为267、130,变异率较高(42.79%、62.50%)。MHCⅡB基因片段包括第1 4个外显子,分别编码信号肽、β1和β2结构域及跨膜区。β1结构域的变异明显大于β2结构域,表现为在长度为276 bp的β1结构域中,核苷酸、氨基酸变异位点分别为150个(54.35%)和72个(78.26%);而长度为282 bp的β2结构域的核苷酸、氨基酸变异位点较少,分别为105个(37.23%)和54个(57.45%)。在β1结构域的24个抗原结合位点(PBR)上,有22个发生了变异。β1结构域的PBR、非抗原结合位点(non-PBR)及β2结构域的非同义碱基替换率(dN)与同义碱基替换率(dS)的比值ω分别为1.366、0.992、0.792,表明"粉玉"体色瓯江彩鲤MHC classⅡB基因的β1结构域在进化过程中受到正向选择作用。基因Cyca-DAB3*09在抗病群体中出现的频率(7.81%)显著高于感病群体(1.37%,P<0.05),新等位基因Cyca-DAB3*18(频率为3.13%)只出现在抗病群体中,基因Cyca-DAB1*08、Cyca-DAB3*08和Cyca-DAB3*17为感病群体所特有。研究结果为抗病"粉玉"体色瓯江彩鲤的选育奠定了基础。
- 赵雪锦刘至治李雪松王宇王成辉
- 关键词：多态性
- “全红”体色瓯江彩鲤MHC-DAB基因多态性及其与鱼体抗病力关系的分析被引量：17
- 2011年
- 利用一对特异性引物DABF和DABR,分别从21尾感病和16尾抗病"全红"体色瓯江彩鲤的cDNA中,扩增出长度为624 bp的MHC-DAB基因片段。共测序185个有效克隆,获得76个不同的核苷酸序列。MHC-DAB基因片段包括第1～4外显子,分别编码信号肽、β1和β2结构域及跨膜区。长度为276 bp的β1结构域有144个核苷酸变异位点(52.17%)和70个氨基酸变异位点(76.07%),而长度为282 bp的β2结构域只有98个核苷酸变异位点(34.75%)和50个氨基酸变异位点(53.19%),显示β1结构域的变异要明显大于β2结构域。在β1结构域的24个抗原结合位点(PBR)上,有23个发生了变异。β1结构域的PBR、非抗原结合位点(non-PBR)及β2结构域的ω值(ω=dN/dS)分别为1.367、0.886和0.754,表明"全红"体色瓯江彩鲤MHC-DAB基因(特别是β1结构域)在进化过程中受到正向选择作用。在所得的20个不同的等位基因中,基因DAB3*15在抗病群体中出现的频率(13.75%)显著高于感病群体中出现的频率(3.81%)(P<0.05);基因DAB3*09和DAB3*10的出现频率都为3.75%(P<0.05),仅存在于抗病群体中;而基因DAB3*02和DAB3*14的出现频率分别为7.62%(P<0.05)和8.57%(P<0.01),仅存在于感病群体中。
- 李雪松刘至治赵雪锦马晓茜冯维王成辉
- 关键词：瓯江彩鲤主要组织相容性复合体多态性
- “粉玉”体色瓯江彩鲤MHCⅡ类基因多态性与鱼体抗病力的关系及补体C9基因的全长克隆与表达
- 本研究以“粉玉”体色瓯江彩鲤为对象,人工感染嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)后,一方面分析主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex, MHC)II类α...
- 赵雪锦
- 关键词：主要组织相容性复合体全长克隆
- 文献传递
- '粉玉'体色瓯江彩鲤MHC class Ⅱ B基因多态性及其与鱼体抗病力关系的分析
- 瓯江彩鲤是分布于浙江省瓯江流域的一种地方性养殖对象，有1200余年的养殖历史。它有'全红'、'大花'、'麻花'、'粉玉'和'粉花'等5种基本体色，具有很高的观赏价值。本研究以'粉玉'体色瓯江彩鲤为对象，人工感染嗜水气单胞...
- 赵雪锦刘至治李雪松王宇王成辉
- 关键词：瓯江彩鲤抗病能力
- 文献传递
