金鼎立
- 作品数：2 被引量：0H指数：0
- 供职机构：上海大学理学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
- 基于Java3D的蛋白质相互作用网络成像软件
- 2011年
- 蛋白质-蛋白质相互作用网络三维呈现对于蛋白质组学的进一步研究有着重要的促进作用。本文利用Java6.0开发工具包,设计了一个蛋白质相互作用网络显示的软件(Protein-Protein Interaction Network Expandor,简称PINE)。PINE从目前三个常用的蛋白质相关数据库中提取信息,经整合后将蛋白质的综合信息呈现给用户。在二维相互作用网络图的基础上,利用Java3D绘制了三维蛋白质相互作用网络图。此外,PINE还引入三维立体双图,增强了网络图的立体层次感。
- 金鼎立答亮冯铁男王翼飞
- 利用提升小波的蛋白质相互作用特征提取
- 2011年
- 利用提升小波从蛋白质序列中提取出它们相互作用的频谱特征,经支持向量机训练学习后,用于预测蛋白质间的相互作用.模拟计算结果表明,在阳性数据和阴性数据平衡的前提下,利用提升小波获取的低维蛋白质相互作用特征向量可以得到较高预测精度.进一步阐述了不同物种的蛋白质相互作用网络有着不同特征,为了得到更准确的预测结果,需要利用不同的方法提取蛋白质相互作用的特征.
- 冯铁男答亮金鼎立王翼飞
- 关键词：提升小波蛋白质相互作用
