李玉芳
- 作品数：8 被引量：34H指数：5
- 供职机构：中国水产科学研究院南海水产研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家科技支撑计划广东省科技计划工业攻关项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 南海短尾大眼鲷的种群遗传结构分析被引量：9
- 2015年
- 在南海北部陆架和南海南沙西南陆架6个地理位点采集224尾短尾大眼鲷（Priacanthus macracanthus）样品,采用线粒体控制区（mt DNA D-loop区）序列分析了其种群遗传结构,探讨了6个采样位点之间短尾大眼鲷种群归属关系。所得224条同源序列D-loop片段（729 bp）中检测到101个突变位点和94个核苷酸多态位点,定义了172种单倍型;遗传多样性表现出高单倍型多样性（0.980 5-0.997 1）和低核苷酸多样性（0.048 2-0.060 9）的特点;系统发育分析、分子方差分析和成对的Fst分析显示南海各群体之间有较高的遗传同质性,遗传分化不显著,也没有出现明显的地理分支或聚簇;中性检测和不对称分布分析发现南海的短尾大眼鲷群体发生过种群扩张。结果表明,南海海域的6个短尾大眼鲷群体属于同一种群,该结果为今后中国与南海周边国家渔业资源共享和争取捕捞配额提供了依据。
- 熊丹李敏陈作志李永振李玉芳黄梓荣
- 关键词：线粒体控制区
- 南海黄鳍马面鲀/(Thamnaconus hypargyreus/)种群分析
- 黄鳍马面鲀/(Thamnaconus hypargyreus/)是具有较高经济价值的鱼类，曾是南海最大宗的高产鱼种，是底拖网作业的主要捕捞对象。鲀形目/(Tetraodontiformes/)鱼类的分子系统学研究是国内外...
- 李玉芳
- 关键词：种群分析线粒体DNA细胞色素B控制区
- 文献传递
- 基于线粒体控制区序列的南海圆舵鲣种群遗传结构分析被引量：5
- 2016年
- 利用线粒体控制区(D-loop)高变区序列作为遗传标记,分析了中国南海5°N^21°N之间7个圆舵鲣(Auxis rochei)地理群体的遗传结构特征。201尾样本的D-loop区序列共检测到185种单倍型。各个采样点均呈现出很高的单倍型多样性(0.958 2~1.000 0)和较高的核苷酸多样性(0.034 327~0.041 235)的特征。单倍型邻接关系树未呈现与地理群体对应的谱系结构。分子方差分析和成对遗传分化系数(FST)显示南海海域圆舵鲣的遗传变异主要来自群体内(98.33%),群体间基因交流频繁,是一个随机交配群。核苷酸不配对分布和中性检验表明南海圆舵鲣在更新世晚期曾经历过种群的快速扩张。结果表明,南海圆舵鲣具有丰富的遗传多样性水平,遗传分化不显著,在渔业上可以作为一个单元来管理。
- 李敏李玉芳张鹏陈作志
- 关键词：种群线粒体控制区
- 南海扁舵鲣种群遗传结构和遗传多样性评价被引量：6
- 2015年
- 利用线粒体控制区(Dloop区)全序列,对2013年3月~2015年4月采自中国南海6°N^20°N之间8个地理群体的200尾扁舵鲣(Auxis thazard)进行了种群遗传多样性和遗传结构分析。序列总长991 bp,包含184个多态性位点,定义了191个单倍型。遗传多样性分析表明,南海扁舵鲣总体呈现出很高的单倍型多样性(0.999 5±0.000 6)和较高的核苷酸多样性(0.019±0.009)。系统发育分析、分子方差分析和成对遗传分化系数(FST)分析显示,南海范围内扁舵鲣不存在与地理群体对应的支系,群体间存在很强的基因流,遗传分化不显著。种群动态的中性检验和核苷酸不配对分布分析表明,南海扁舵鲣历史上曾经历过种群的快速扩张。结果表明,南海扁舵鲣遗传多样性丰富,具备较高的生态适应和进化能力;南海扁舵鲣属于同一个随机交配的种群,在渔业开发和管理上可视为一个单一的管理单元。
- 李敏张鹏李玉芳陈森张魁孔啸兰陈作志
- 关键词：种群遗传结构
- 南海黄鳍马面鲀遗传多样性研究
- 采用线粒体DNA细胞色素b(Cytochrome b,Cyt b)基因片段为遗传标记,分析了南海北部陆架和南沙西南部陆架海域5个黄鳍马面纯Thamnaconus hypargyreus群体的遗传多样性.分析结果表明：在1...
- 李玉芳李永振陈国宝孙典荣崔科
- 关键词：线粒体细胞色素B基因
- 鲹科鱼类线粒体全基因组序列结构特征及系统发育分析
- 为了解鲹科鱼类的线粒体全基因组序列结构特征及系统发育信息,对已知的23种鲹科鱼类线粒体全基因组进行了分析。结果显示:(1)鲹科鱼类线粒体基因组全序列长度在16530 bp到16610 bp之间,基因组的结构和基因排列顺序...
- 李玉芳陈作志李敏
- 关键词：鲹科线粒体基因组系统发育关系
- 文献传递
- 基于线粒体Cyt b基因的黄鳍马面鲀种群分析被引量：14
- 2014年
- 采用线粒体细胞色素b(cytochrome b,Cyt b)基因片段为遗传标记,分析了南海北部陆架和南沙西南部陆架海域5个黄鳍马面鲀群体的遗传结构,以判定南海北部不同海域之间及南海北部与南沙西南部陆架海域黄鳍马面鲀的种群归属。结果表明,在156个个体的779 bp Cyt b同源序列中共检测到56个变异位点和58种单倍型,5个群体间遗传距离为0.002 95~0.004 15,遗传分化性呈现出高单倍型多样性(0.820 1~0.980 4)和低核苷酸多样性(0.002 62~0.004 69)的特点;分子方差分析和遗传分化指数显示,黄鳍马面鲀的遗传变异来自群体内个体间,群体间无显著遗传分化;单倍型网络结构图和群体系统发育树结构均未出现明显的以地方群体为单位的家系式分支或者聚簇。比较5个不同地理群体间的遗传发育关系并结合种属界定标准判定,南海北部和南沙西南部陆架5个黄鳍马面鲀群体属于同一个种群。
- 李玉芳李永振陈国宝孙典荣于杰崔科
- 关键词：种群分析线粒体细胞色素B基因遗传分化
- 南海短尾大眼鲷线粒体Cytb基因序列及种群判别分析被引量：12
- 2016年
- 对采集于中国南海北部近岸和南沙西南部陆架海域7个采样点共246尾短尾大眼鲷（Priacanthus macracan-thus）样品进行了线粒体细胞色素b基因（cytochromeb，cyt6）序列的扩增与分析，获得了长度为684bp的同源序列。碱基A、T、C、G含量分别为22．7％、28．4％、33．4％、15．5％，共检测到多态位点92个，定义了90个单倍型。其遗传多样性表现出高单倍型多样性（0．8130～0．9012）和低核苷酸多样性（0．0040～0．0053）的特点。两两群体间的Fs。分析显示，大部分群体间的只。值均小于0．05，且差异不显著（p〉0．05），样本总体分化指数仅为0．012，群体间分化程度很低。分子方差分析（AMOVA）表明，群体间的遗传变异仅占总遗传变异的1．25％，98．75％的遗传变异源于群体内，群体之间有较高的遗传同质性。基于邻接法构建的系统发育树和基于中间连接法构建的单倍型网络图均显示，南海短尾大眼鲷不存在与地理群体对应的支系，遗传分化不显著。中性检测和不对称分布分析发现，南海短尾大眼鲷群体在更新世晚期发生过种群扩张。结果表明南海短尾大眼鲷群体间的遗传交流较频繁，可以认为是一个大的种群。
- 熊丹李敏李永振李玉芳张魁陈作志
- 关键词：细胞色素B
