蔡涛
- 作品数：4 被引量：23H指数：2
- 供职机构：北京大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划北京市科委基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 微生物基因组拼接辅助系统及基于ontology的基因组注释和比较
- 随着测序技术的进步和成本的降低，我们一方面希望对更多的物种进行测序从中了解生命的本质，另一方面，我们希望能从海量基因组序列数据中快速有效地挖掘真正有用的信息。本论文针对这些问题，对基因组测序，基因组功能注释和比较进行研究...
- 蔡涛
- 关键词：基因组学微生物基因组比较基因组学
- Maze的安全性及可靠性改进研究
- Maze作为当前教育网内最流行的P2P文件共享系统，以它短小精悍的设计，强劲的下载速度，受到越来越多用户的喜爱。但在Maze的设计实现过程中，为了简化设计，快速开发出可用的系统，没有考虑到一些P2P系统的安全问题。当用户...
- 蔡涛
- 关键词：客户端数字签名身份认证权限认证
- 微生物基因组注释系统MGAP被引量：7
- 2003年
- 利用生物信息学方法和工具开发了微生物基因组注释系统 (Microbialgenomeannota tionpackage ,MGAP) ,并用于蓝细菌PCC70 0 2的基因组注释。该系统由基因组注释系统和基于Web的用户接口程序两部分组成。基因组注释系统整合多个基因识别、功能预测和序列分析软件 ;以及蛋白质序列数据库、蛋白质资源信息系统和直系同源蛋白质家族数据库等。用户接口程序包括基因组环状图展示、基因和开放读码框在染色体上的分布图 ,以及注释信息检索工具。该系统基于PC微机和Linux操作系统 ,用MySQL作数据库管理系统、用Apache作Web服务器程序 ,用Perl脚本语言编写应用程序接口 ,上述软件均可免费获得。
- 禹胄李涛蔡涛赵进东罗静初
- 关键词：微生物基因组基因组注释生物信息学蓝细菌
- SARS冠状病毒全基因组序列初步分析被引量：16
- 2003年
- 对已经完成全序列测定的 12个SARS病毒基因组进行了多序列比对 ,发现序列主体部分 2 970 8b具有99 82 %的相同碱基 ,除 2个序列各有 5个和 6个碱基的缺失外 ,其余部分共有 4 2个位点核苷酸碱基的差异 ,其中2 8个位点的碱基差异可引起氨基酸残基改变。利用蛋白质二级结构和跨膜螺旋预测以及蛋白质定位等生物信息学工具 ,分析了这些产生氨基酸改变部位的蛋白质构像 ,推测了可能产生的结构和功能改变 ,为进一步生物学实验提供参考。所有分析结果同时在北京大学生物信息中心抗SARS网站 (antisars.cbi.pku .edu .cn)上发布。
- 陈蕴佳高歌鲍一明Rodrigo LOPEZ吴健民蔡涛叶志强顾孝诚罗静初
- 关键词：SARS冠状病毒多序列比对蛋白质序列分析生物信息学
