马建民
- 作品数:11 被引量:77H指数:4
- 供职机构:东南大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学电子电信建筑科学社会学更多>>
- 不同折叠类型蛋白编码基因的密码子使用被引量:10
- 2002年
- 对 1 95个编码不同折叠类型蛋白 (5 0种全α结构蛋白 ,6 6种全 β结构蛋白 ,3 7种α +β结构蛋白 ,42种α/β结构蛋白 )基因的密码子使用偏性的方差分析研究表明 ,不同折叠类型蛋白的密码子使用偏性有着显著的区别 .特定折叠类型的蛋白有着特定的编码基因的密码子使用模式 .这一结果表明 ,在蛋白质折叠类型和蛋白质二级结构的预测过程中 ,编码基因的密码子使用偏性可以作为蛋白质一级结构以外的一项重要的预测标准 .
- 顾万君马建民周童孙啸陆祖宏
- 关键词:编码基因密码子折叠类型方差分析
- 早拆模板竖向施工荷载传递的研究被引量:3
- 1995年
- 早拆模板竖向施工荷载传递的研究郭正兴,章建军,马建民,王银芝(东南大学,南京210096)(南通市建工局)(溧阳市茶亭建安公司)高层建筑现浇楼板应用早拆模板体系的基本原理是:楼板混凝土浇筑后3~4d,达到设计强度50%时,即可拆除楼面模板,而部分支撑...
- 郭正兴章建军马建民王银芝
- 关键词:高层建筑早拆模板载荷
- 多次压印定点合成法制备化合物微阵列芯片的方法
- 多次压印定点合成法制备化合物微阵列芯片的方法是一种利用多次压印定点合成法制备各种化合物微阵列芯片的方法,该方法首先根据所需化合物的微阵列设计制备一套微印章,然后根据原先的设计在制备的各微印章上涂上一层对应的化学反应物,最...
- 陆祖宏张林刚马建民徐春祥陈亚莉
- 文献传递
- 密码子使用偏性研究及其在基因芯片设计中的应用
- 随看大量核酸序列的测序,寻找新基因已成为后基因组时代的重要研究内容.基因芯片具有获取信息量大、检测效率高的优点,可以实现对基因数据的大规模的检测.该文提出了一种特定蛋白mRNA检测芯片,根据给定肽段的氨基酸组成及密码子使...
- 马建民
- 关键词:密码子基因芯片核酸序列后基因组时代遗传密码
- 文献传递
- 基于社会学人际关系与信任模型的社会网络服务
- 社会网络服务的作用和延伸日益引起学术界和工业界研究人员的兴趣和关注。大部分的社会网络服务网站支持用户来维护已有的社会网络。还有一部分社会网络服务网站帮助用户通过共同的兴趣、政治观点或者一些活动和陌生人建立新的人际关系。但...
- 马建民
- 关键词:社会网络服务人际关系信任模型
- 文献传递
- 多次压印定点合成法制备化合物微阵列芯片的方法
- 多次压印定点合成法制备化合物微阵列芯片的方法是一种利用多次压印定点合成法制备各种化合物微阵列芯片的方法,该方法首先根据所需的寡核苷酸探针阵列芯片设计和制备按压印顺序和压印位置制作的表面具有凹凸图案的一套微印章,然后根据原...
- 陆祖宏张林刚马建民徐春祥陈亚莉何农跃
- 文献传递
- SARS及其他几种冠状病毒密码子使用偏性的位点差异(英文)
- 2005年
- 分析了SARS冠状病毒以及其他5种冠状病毒基因编码起始区与终止区的密码子使用偏性.结果表明,冠状病毒基因组的稀有密码子倾向于出现在编码起始区和终止区附近.起始区的这种倾向性对冠状病毒基因的表达具有负性调控作用,可以用稀有密码子调控假说解释.终止区的这种倾向性表明,这些出现在终止区的稀有密码子对基因的表达也有负性调节作用.研究结果同时暗示了稀有密码子调控假说不仅适用于细菌,而且还适用于某些病毒基因组.
- 周童顾万君马建民孙啸陆祖宏
- 关键词:密码子使用偏性SARS冠状病毒基因表达
- 不同折叠类型蛋白中基于密码子的二级结构偏向性分析被引量:1
- 2004年
- 在传统的Chou Fasman蛋白质二级结构预测方法的基础上引入同义密码子使用的信息 ,计算了 2 0 0个蛋白 ( 4 9种全α结构蛋白 ,69种全β结构蛋白 ,38种α + β结构蛋白 ,44种α/β结构蛋白 )中不同密码子对应的氨基酸形成不同二级结构 (α :螺旋 ,β :折叠 ,C :卷曲 )的偏向性参数 .通过对这些密码子对应氨基酸二级结构偏向性的分析 ,得到了氨基酸二级结构偏向性分析中所忽略的同义密码子的蛋白结构信息 .
- 顾万君周童马建民孙啸陆祖宏
- 关键词:同义密码子使用蛋白质二级结构预测
- 哺乳动物MHC密码子使用概率的聚类分析被引量:24
- 2001年
- 利用系统聚类分析方法对随机选取的 3种哺乳动物的 60个主要组织相容性复合体(MHCⅠ类和Ⅱ类 )基因的mRNA序列进行了同义密码子使用概率偏性研究 .结果发现 ,不同物种的MHC基因群中类型相同的基因具有相近的同义密码子使用偏性 ,而对于同一类型的基因由物种引起的同义密码子使用偏性的差异较小 .即功能和类型决定密码子使用模式的大的分类 ,而物种决定该大类中进一步的差异 .基因密码子偏向性的研究对于大幅度增加目标蛋白的产量具有重要的意义 .该结果也为基因分类和基因功能的预测提供了新的生物信息学方法 .
- 周童马建民顾万君孙啸陆祖宏
- 关键词:同义密码子密码子偏性MHC聚类分析哺乳动物
- 一种基于密码子使用偏性的检测型基因芯片设计方法被引量:4
- 2002年
- 首先预测特定蛋白密码子使用概率表 ,以确定序列中各氨基酸的编码密码子 ,这样可以将芯片表面探针的数量减少为原来的 4.47% .然后进一步考虑密码子在编码时的C G选择性分离原则、G T配对原则 ,以进一步将芯片表面探针的数量减少至 4.2 5 % .在对探针特异性要求不高的情况下 ,可以采用最优密码子使用概率表 ,以求最大限度的降低探针的数目 ,这样芯片表面探针的数量可减少到原来的 0 .2 0 % .通过上述方法 。
- 马建民顾万君周童孙啸陆祖宏
- 关键词:设计方法特定蛋白密码子使用偏性遗传密码