付鹏程
- 作品数：20 被引量：57H指数：5
- 供职机构：洛阳师范学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程重要方向项目国家科技基础性工作专项更多>>
- 相关领域：生物学农业科学文化科学建筑科学更多>>
- 基于查尔酮合酶基因探讨鲜卑花的种群动态历史与遗传分化被引量：2
- 2014年
- 以高山灌木鲜卑花为研究材料,收集其在中国全部分布区域内的13个居群共139个个体,以查尔酮合酶基因(CHS)的内含子区域为分子标记,探讨鲜卑花的种群动态历史、遗传分化的时间与成因。在鲜卑花中CHS共鉴定了29种单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.9248和0.007 545,遗传变异大;贝叶斯分析说明鲜卑花种内遗传分化的时间始于4.37 Ma左右。中性检验与歧点分布分析一致表明鲜卑花在近期经历了明显的居群扩张,估算的扩张时间在55.8 ka左右。研究结果表明鲜卑花在末次冰期间冰阶时期从冰期避难所向外经历了明显的居群扩张;而青藏高原的整体隆升导致的环境剧变,加剧了鲜卑花居群间的遗传分化。
- 付鹏程高庆波张发起陈世龙
- 关键词：遗传分化查尔酮合酶
- 青藏高原地区两种鲜卑花的比较谱系地理学研究
- 通过对青藏高原地区特有灌木窄叶鲜卑花Sibiraea angustata及其近缘类群鲜卑花Sibiraea laevigata的比较谱系地理学研究,探讨青藏高原隆升及更新世以来的冰期运动对该地区物种演化的影响.本研究选取...
- 付鹏程高庆波张发起邢睿Gulzar Khan张金华王久利刘海瑞陈世龙
- 关键词：基因流
- 花锚属一新变型——玉花卵萼花锚被引量：3
- 2018年
- 报道了龙胆科卵萼花锚的一个新变型——玉花卵萼花锚。新变型区别于原变型的唯一特征是其花冠为白色,部分花距为黄色。
- 曹倩付鹏程王久利陈世龙周党卫
- 关键词：龙胆科
- 基于cpDNA和ITS序列对西川红景天(Rhodiola alsia)种内遗传分化进行研究
- 西川红景天Rhodiola alsia(Fr(o|¨)derstr(o|¨)m)S.H.Fu隶属于景天科Cmssulaceae红景天属Rhodiola L.,为青藏高原特有的多年生草本植物,生于海拔3400-4800米的...
- 高庆波张得钧段义忠张发起李印虎付鹏程陈世龙
- 文献传递
- 基于454测序技术的青藏高原黄绿蜜环菌微卫星引物的开发被引量：6
- 2014年
- 【目的】本研究利用454焦磷酸测序技术,对青藏高原黄绿蜜环菌(Armillaria luteo-virens)转录组进行测序,从获得的Expressed sequence tags(EST)序列中开发EST-SSR引物。【方法】利用高通量测序获得的EST序列设计微卫星引物,通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳和毛细管电泳检测筛选出合格的微卫星引物。【结果】共得到了1997121条reads,总数据量超过80Mb,序列平均长度为449bp。对于所获得的reads进行拼接后得到了22236条非冗余的EST序列,其中含有2024条contigs(平均读长974bp)和20212条singletons(平均读长404bp)。在所有序列中共找到321条符合条件的含有SSR的序列,从中随机选择98对,成功开发出27对具有多态性条带的微卫星引物。利用采集自3个不同居群的66个个体对上述27对引物进行验证,有17对引物符合Hardy-Weinberg平衡且没有连锁不平衡现象。【结论】首次成功利用高通量测序技术开发的EST-SSR引物将会对今后黄绿蜜环菌遗传多样性的研究以及种质资源鉴定、遗传图谱构建等打下了坚实基础。
- 邢睿高庆波张发起李印虎付鹏程张金华王久利陈世龙
- 关键词：黄绿蜜环菌微卫星青藏高原
- 《植物生理学》课程教学改革的探索被引量：1
- 2023年
- 植物生理学是高等院校生物学领域重要的专业基础课,理论性强、知识点繁多、抽象难学。本文通过精简教学内容、改进教学方法、引入科学前沿、改革考核方式等手段,激发学生学习的兴趣和主动性,提高教学质量,启发和培养学生的科研意识和创新精神。1引言植物生理学是研究植物生命活动规律及其与环境之间相互关系、揭示植物生命[1]现象本质的科学,是高等院校生物学领域重要的专业基础课。随着分子生物学、细胞生物学等学科的迅速发展,植物生理学研究涉及的范围越来越广.
- 付鹏程孙姗姗
- 关键词：植物生理学细胞生物学《植物生理学》生命活动规律分子生物学
- 青藏高原地区两种鲜卑花的比较谱系地理学研究
- <正>通过对青藏高原地区特有灌木窄叶鲜卑花Sibiraeaangustata及其近缘类群鲜卑花Sibiraealaevigata的比较谱系地理学研究,探讨青藏高原隆升及更新世以来的冰期运动对该地区物种演化的影响。本研究选...
- 付鹏程高庆波张发起邢睿Gulzar Khan张金华王久利刘海瑞陈世龙
- 关键词：基因流
- 文献传递
- 基于SSR标记的豫西枣品种与酸枣的群体遗传结构与基因流分析被引量：1
- 2017年
- 为在分子水平上研究豫西枣品种遗传结构,揭示品种分化与野生种的亲缘关系,本研究选取豫西两个枣品种和一个野生酸枣群体共48份种质为材料,采用20对SSR引物,研究野生酸枣与品种的遗传结构。三个群体在遗传组成上被分为3组,群体间的界限清晰。野生酸枣与两个枣品种间的基因流是不对称的,主要是酸枣和灰枣流向扁核酸。扁核酸虽然遗传多样性低,但与其他群体的基因交流频繁。本研究所用SSR标记及方法可用于不同枣品种的遗传结构分析,为研究酸枣与枣种质资源间的群体进化提供了借鉴。
- 李娟伦涵宁李曼付鹏程
- 关键词：酸枣基因流
- 基于磁珠富集法的绣线菊SSR分子标记分离与筛选被引量：4
- 2014年
- 微卫星序列(SSR)具有多态性高、共显性遗传等特点,是一种极具价值的分子遗传标记。采用磁珠富集法从高山绣线菊基因组DNA中分离和筛选SSR标记。高山绣线菊基因组经限制性内切酶Mse I酶切后与接头连接,并与生物素标记SSR探针(AC)15和(AG)15杂交,然后通过链霉亲和素磁珠富集、洗脱、PCR扩增、克隆,完成微卫星文库构建。利用载体通用引物和探针序列引物进行PCR扩增,筛选重组克隆并测序,获得112条序列。随机挑选其中60条序列设计的引物,经初期筛选获得多态性引物16对。用所得16对引物对4个居群92个个体的蒙古绣线菊和高山绣线菊进行PCR扩增。统计分析PCR产物的毛细管电泳结果,发现4个居群的平均等位基因数、平均期望杂合度及平均观测杂合度都比较高。64个数据系列(4个居群×16个位点)中的26个显著偏离HardyWeinberg平衡,推测可能由于无效等位基因的存在所引起。分析显示研究开发的16对多态性SSR引物可以用于后续遗传多样性、物种进化与亲缘关系等方面研究,丰富了绣线菊遗传多样性研究的分子标记。
- 张金华Gulzar Khan付鹏程雷淑云陈世龙张发起
- 关键词：绣线菊微卫星磁珠富集
- 基于Solexa高通量测序的唐古特红景天(Rhodiola algida)微卫星信息分析被引量：17
- 2014年
- 利用所获得的Solexa高通量唐古特红景天转录组拼接EST序列进行微卫星位点的挖掘分析,期望为红景天属SSR标记的开发提供生物信息学依据。在得到的6552条EST序列中,三碱基最多,占总EST序列的41.50%;单核苷酸和二核苷酸重复类型的SSR含量相似,分别为27.76%和24.76%;二至六碱基微卫星分布密度与其对应的SSR含量成正比。在单核苷酸重复类型中,T和A重复类型最多,分别为总SSR的14.91%、12.70%,而G和C重复类型则很少;在二核苷酸重复类型中,AG重复类型最多,占总SSR的5.60%,GA和TC重复类型次之,分别为4.75%、4.72%;在三核苷酸重复类型中,GAA重复类型最多,为总SSR的1.85%,GAT次之,为1.79%,TTC、TCT、TCA、GGA、GCT、GAG重复类型间的SSR数相差不大;四、五、六核苷酸重复类型则很少。除五、六核苷酸重复类型外,其长度变化与其对应的重复类型碱基长度成反比;同种重复类型中,微卫星的长度与其对应的SSR数成反比。
- 雷淑芸高庆波付鹏程杨慧玲陈世龙张发起
- 关键词：高通量测序微卫星
