尹曦
- 作品数：3 被引量：1H指数：1
- 供职机构：南方医科大学更多>>
- 发文基金：广东省生物芯片重点实验室基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 不同分化程度卵巢癌细胞中胚胎干细胞相关通路的基因集富集分析被引量：1
- 2010年
- 背景:近年来一些研究发现肿瘤细胞具有与干细胞类似的特征,因此,控制干细胞功能的某些基因调控网络,可能也在某些肿瘤中同样发挥作用。目的:观察不同分化程度卵巢癌的分子特征,获得与胚胎干细胞相关基因的表达情况。方法:从美国国立生物信息中心(NCBI)共享数据库GEO下载原始基因芯片文件,登录号为GSE2109,选取卵巢癌样本作为研究材料。去除临床指标缺失的样本,按照组织学分级将卵巢癌样本分为高分化和低分化两组。原始数据经dChip进行质量检验和标准化,获得基因表达的矩阵。收集胚胎干细胞相关的基因集、生物学过程和KEGG通路在不同分化的卵巢癌中的富集情况,用GSEA进行基因集富集分析。结果与结论:选取了13个与胚胎干细胞相关的基因集,低分化的卵巢癌细胞中有9个基因集上调,PRC2靶点相关的4个基因集下调,说明与胚胎干细胞相关的基因集大多在低分化的卵巢癌细胞中上调。并且在低分化卵巢癌细胞显著上调的都是与细胞周期、细胞分裂、DNA复制等与增殖相关的通路。基因表达谱分析表明低分化的卵巢癌与胚胎干细胞具有相似的分子特征,这可以为卵巢癌的早期诊断和治疗提供新的思路。
- 叶云王桂平杨晓勤尹曦梁爽郑文岭马文丽
- 关键词：表达谱胚胎干细胞分化卵巢癌
- 结直肠癌组织特异性治疗靶点的生物信息学筛选
- 2011年
- 目的 预测与筛选结直肠癌组织特异性基因,作为靶向治疗的候选靶点.方法 利用自主开发的Python语言程序分析人类正常组织与结直肠癌组织mRNA表达的组织特异性,结合人类胚胎干细胞富集基因集以及文献挖掘结果,筛选可能的与结直肠癌发生或发展相关的基因作为候选靶点,并对其进行通路分析及基因富集分析.结果 获得了结直肠癌组织特异的且与肿瘤生物学通路密切相关的4个基因,作为进一步研究的候选靶点.结论 应用生物信息学方法从芯片数据进行挖掘,可以为结直肠癌的靶向治疗提供候选靶点,并为后续的药物设计奠定基础.
- 尹曦叶云梁爽马文丽郑文岭
- 关键词：结直肠癌组织特异性治疗靶点生物信息学
- 难治性急性髓系白血病特异调控通路的初步研究
- 背景与目的:
急性白血病按细胞形态学、细胞化学染色可分为急性淋巴系白血病(acutelymphoblastic leukemia,ALL)和急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)两大...
- 尹曦
- 关键词：急性髓系白血病差异表达基因调控通路药物靶点
