杨歆璇
- 作品数:11 被引量:9H指数:2
- 供职机构:海南大学更多>>
- 发文基金:公益性行业(农业)科研专项中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- Chelex-100法快速提取镰刀菌基因组DNA
- 本文旨在建立快速提取香蕉枯萎病菌基因组DNA作为PCR扩增反应模板的方法。方法:采用Chelex-100法提取香蕉枯萎病菌基因组DNA,通过设计的特异引物进行PCR扩增。结果显示:Chelex-100法能在30min内从...
- 杨歆璇羊玉花杨腊英李松伟贾慧升黄俊生
- 关键词:PCR扩增
- 文献传递
- 香蕉枯萎病菌fga1基因的克隆与序列分析被引量:6
- 2009年
- 为了解fga1基因在尖孢镰刀菌古巴专化型侵染香蕉过程中的作用,及其与尖孢镰刀菌古巴专化型生理小种1号和生理小种4号之间的致病力差异的关系,采用PCR和RT-PCR方法扩增了2个生理小种的fga1基因,并对扩增产物进行了测序及相似序列搜索和比对,还对基因编码的蛋白进行了氨基酸序列比对和功能分析。研究结果表明2个生理小种fga1基因开放阅读框均为1062bp,编码353个氨基酸,基因同源性为99.5%,氨基酸序列相同。推测fga1基因可能与香蕉枯萎病菌自身繁殖和附着胞的形成有关。从fga1基因序列及其编码蛋白的氨基酸序列看,2个生理小种致病力的差异与fga1基因并无明显对应关系,这为进一步研究fga1基因功能奠定了基础。
- 羊玉花杨腊英杨歆璇李松伟黄俊生
- 关键词:尖孢镰刀菌古巴专化型生理小种
- 香蕉枯萎病菌cyp1基因的克隆与序列分析被引量:2
- 2010年
- 为了解亲环素基因(cyp1,其编码亲和蛋白)在尖孢镰刀菌古巴专化型生理小种1号和生理小种4号之间及与其他镰刀菌之间的差异,分析cyp1基因与两生理小种之间的寄主选择性差异的关系,通过比对现有镰刀菌属的亲环素基因序列,设计并合成引物,采用PCR和RT-PCR方法扩增了尖孢镰刀菌古巴专化型生理小种1号和生理小种4号2个生理小种的cyp1基因,并测序进行比较分析,同时对编码蛋白进行了氨基酸序列比对和功能分析。结果表明,2个生理小种cyp1基因全长均为1066bp,开放阅读框均为675bp,编码224个氨基酸,基因序列间差异性为0.8%,编码蛋白间仅存在1个氨基酸的差异;两生理小种的cyp1基因序列与镰刀菌属其他专化型或不同种间存在差异性,与不同属之间其他种间的差异最大达50%,比对蛋白序列发现仅存在0.85%的差异,这进一步证明亲和蛋白在真菌中较保守。从cyp1基因序列及其编码蛋白的氨基酸序列在两生理小种之间的差异性分析结果推测,2个生理小种寄主选择性差异与cyp1基因并无明显对应关系,这为进一步研究cyp1基因功能奠定了基础。
- 杨腊英黄小娟谢玉萍羊玉花杨歆璇方晓东黄俊生
- 关键词:尖孢镰刀菌古巴专化型生理小种寄主选择性
- 香蕉枯萎病病原菌转化体系的建立及FEM1基因功能的初探
- 香蕉枯萎病是一种由尖孢镰刀菌古巴专化型(Fusarium oxysporum f.sp.cubense)引起的系统性维管束土传病害。病原菌从根部进入植物体内,通过堵塞维管束和分泌有毒物质危害寄主,造成植株叶片萎蔫和全株枯...
- 杨歆璇
- 关键词:香蕉枯萎病尖孢镰刀菌古巴专化型
- 香蕉枯萎病菌pacC基因的克隆与序列分析被引量:2
- 2010年
- 采用PCR和RT-PCR方法扩增尖孢镰刀菌古巴专化型(Fusarium oxysporum f sp.cubense,FOC)1号和4号生理小种的pacC基因(FOC1-pacC,FOC4-pacC),对FOC1-pacC和FOC4-pacC相似序列进行搜索和比对,以及对基因编码蛋白进行结构预测,发现FOC1-pacC和FOC4-pacC开放阅读框分别为1 863、1 905 bp,编码634、620个氨基酸,2个小种之间基因序列和氨基酸序列差异明显,FOC1-pacC比FOC4-pacC缺少1个基因片段,FOC-pacC与其相似序列有显著差异,比对缺少2个基因片段;初入侵转录组表达分析说明,2生理小种pacC基因在小种侵染不同品种香蕉过程中表达有差异,FOC1-pacC基因只在粉蕉中检测到表达,而FOC4-pacC则在粉蕉和香蕉中都检测到表达,但在粉蕉中的表达量明显高于香蕉。
- 李松伟黄俊生羊玉花杨歆璇贾慧升杨腊英王国芬方晓东李传东
- 关键词:尖孢镰刀菌生理小种致病力
- 香蕉枯萎病菌fgb1基因的克隆及序列分析
- 为了解fgb1基因在尖镰刀菌古巴专化型侵染香蕉过程中的作用,及其与尖镰刀菌古巴专化型生理小种1号和生理小种4号之间的致病力差异的关系,采用PCR和RT-PCR方法扩增了2个生理小种的fgb1基因,并对扩增产物进行了测序及...
- 羊玉花杨腊英杨歆璇李松伟黄俊生
- 关键词:生理小种
- 文献传递
- Chelex-100法快速提取镰刀菌基因组DNA
- 杨歆璇羊玉花杨腊英李松伟贾慧升黄俊生
- 香蕉枯萎病菌pg1基因的克隆与表达研究
- 为了解pg1基因在尖孢镰刀菌古巴专化型侵染香蕉过程中的作用及其1号生理小种和4号生理小种之间存在的差异,本研究以香蕉枯萎病原菌1号生理小种和4号生理小种的基因组DNA和cDNA为材料,通过对尖孢镰刀菌番茄专化型致病相关基...
- 杨歆璇羊玉花杨腊英贾慧升黄俊生
- 关键词:尖孢镰刀菌古巴专化型生理小种
- 文献传递
- 香蕉枯萎病菌pgx4基因的克隆与序列分析被引量:2
- 2009年
- 为了解pgx4基因在尖孢镰刀菌古巴专化型侵染香蕉过程中的作用,及其与尖孢镰刀菌古巴专化型生理小种1号和生理小种4号之间的致病力差异的关系,以尖孢镰刀菌古巴专化型1号生理小种和4号生理小种的基因组DNA和cDNA为材料,采用PCR和RT-PCR方法扩增了2个生理小种的pgx4基因,并对扩增产物进行克隆测序后再用生物信息学软件对序列进行比对分析。结果表明:2个生理小种pgx4基因的开放阅读框均为1395bp,编码465个氨基酸,且前17个氨基酸均构成该基因的信号肽。通过DNAStar7.1比对发现,尖孢镰刀菌古巴专化型2个生理小种pgx4基因的核苷酸序列存在25个碱基的差异,而其编码的465个氨基酸中,也有3个氨基酸不同,分析这些核苷酸序列和氨基酸序列的差异可能与尖孢镰刀菌古巴专化型1号生理小种和4号生理小种在侵染蕉类不同栽培种时的识别专性寄主机制有一定关系。
- 杨歆璇杨腊英羊玉花黄俊生
- 关键词:尖孢镰刀菌古巴专化型生理小种
- Chelex-100法快速提取镰刀菌基因组DNA
- 旨在建立快速提取香蕉枯萎病菌基因组DNA作为PCR扩增反应模板的方法.方法:采用Chelex-100法提取香蕉枯萎病菌基因组DNA,通过设计的特异引物进行PCR扩增.结果显示:Chelex-100法能在30min内从香蕉...
- 杨歆璇羊玉花杨腊英李松伟贾慧升黄俊生
- 关键词:香蕉枯萎病镰刀菌聚合酶链反应