肖冰
- 作品数：4 被引量：24H指数：2
- 供职机构：辽宁师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 鸮形目五种鸟类线粒体调控区全序列的测定与比较研究
- 利用Long-PCR和Primer Walking的方法对短耳鹗、长耳鹗、纵纹腹小鸮、灰林鸮、雕鸮这五种鸮形目鸟类的线粒体调控区进行了全序列的测定。结果表明:短耳鸮的调控区长度为3288bp;长耳鸮为2848bp;纵纹腹...
- 肖冰李庆伟
- 关键词：鸮形目全序列线粒体
- 文献传递
- 鸮形目两种鸟类线粒体基因组全序列测定与比较研究被引量：22
- 2004年
- 利用Long-PCR和PrimerWalking结合克隆测序法对短耳鸮和长耳鸮线粒体基因组进行了全序列测定.结果表明:短耳鸮mtDNA序列全长为18858bp,长耳鸮mtDNA全长为18493bp,其中短耳鸮mtDNA是目前已知最长的鸟类线粒体基因组.两种鹗类的基因组结构和基因排列顺序与家鸡相同,无假控制区,在ND3基因174位点都存在一个额外插入的胞苷酸(C).控制区序列异常增大是造成这两种鸟类mtDNA增大的主要原因,短耳鸮控制区长度为3288bp,长耳鸮为2926bp,这是目前已知的脊椎动物线粒体基因组中仅次于盲鳗的最大的控制区.在其控制区3'端存在大量的串联重复序列,分析发现这两种鸮类的重复序列和Mt5调控元件有较高的序列相似性,且能形成多重的茎环二级结构,这表明该重复序列可能具有一定的生理功能,影响线粒体基因组的复制或转录表达,从而使相应物种具有更大的选择优势,以适应环境和生存竞争.
- 孙毅马飞肖冰郑俊杰袁晓东汤敏谦王黎于业飞李庆伟
- 关键词：线粒体基因组鸟类串联重复序列调控元件转录表达
- 鸮形目4种鸟类线粒体调控区全序列的测定与比较研究(英文)被引量：2
- 2006年
- 利用Long-PCR和PrimerWalking的方法对鸮形目的短耳鸮、长耳鸮、纵纹腹小鸮、灰林鸮4种鸟类的线粒体调控区进行了全序列测定。结果表明:短耳鸮的调控区长度为3290bp;长耳鸮为2848bp;纵纹腹小鸮为2444bp;灰林鸮为1771bp。短耳鸮的调控区长度是4种鸮中最大的,并且是目前已知最大的鸟类线粒体调控区。这4种鸮类调控区的基本结构和其他鸟类相似,按照碱基变化速率的不同可以分为3个区:碱基变化速率较快的外围区域Ⅰ、Ⅲ和保守的中间区域Ⅱ。这4种鸟类调控区的3′端均存在大量的串联重复序列,短耳鸮为126bp单元重复7次和78bp单元重复14次;长耳鸮为127bp单元重复8次和78bp单元重复6次;纵纹腹小鸮有3个重复单元,分别为89bp单元重复3次、77bp单元重复4次和71bp单元重复6次;灰林鸮仅有1个单元的串联重复为78bp重复5次。调控区中串联重复序列可能是由链的滑动错配产生,另外这些重复序列都能形成热力学稳定的多重茎环二级结构,而且在重复序列中还发现一些保守基序,这说明重复序列可能具有一定的生理功能,影响调控区的调控功能从而影响线粒体基因组的复制和转录。
- 肖冰马飞孙毅李庆伟
- 关键词：鸮形目线粒体基因组调控区
- 鸮形目鸟类线粒体调控区序列的测定与比较研究
- 本论文主要测定了鸮形目四种鸟类的线粒体调控区全序列，从比较基因组学和生物信息学的角度对鸮形目鸟类线粒体调控区的结构进行了研究分析，并对鸟类线粒体调控区的起源、进化、生理功能等进行了探讨，进而研究串联重复序列的起源和进化及...
- 肖冰
- 关键词：鸮形目鸟类基因组学细胞生物学
- 文献传递
