韩葳葳
- 作品数：25 被引量：36H指数：4
- 供职机构：吉林大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金吉林省自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：理学生物学医药卫生一般工业技术更多>>
- Furcatin水解酶的三维结构模建和与furcatin的对接研究被引量：2
- 2005年
- 利用同源模建和动力学模拟方法,模建了furcatin水解酶(FH)的三维结构.并在这基础上,分析了活性位点的组成和结构.研究了furcatin与FH的对接.结果表明,Ser84,Arg146,Thr189,Thr234和Gly372在复合物的形成过程中起重要的作用.其中,Ser84,Arg146和Thr189是在FH的活性口袋的二糖部分的亚单位-1中重要的氨基酸,Thr234和Gly372是亚单位-2中重要的氨基酸.
- 韩葳葳李泽生潘秀梅郑清川孙家钟
- 关键词：同源模建分子动力学
- 大肠杆菌中高丝氨酸琥珀酰基转移酶的同源模建与对接研究被引量：4
- 2008年
- 利用同源模建和分子动力学模拟方法,模建了大肠杆菌中高丝氨酸琥珀酰基转移酶的三维结构.分析了活性位点的组成,从结构上佐证了Cys142而不是Lys47为亲核进攻的残基,并通过与其天然底物琥珀酰-辅酶A的对接研究,从理论上确认了对复合物形成起到重要作用的氨基酸残基.
- 周奕含李泽生韩葳葳姚远
- 关键词：同源模建分子动力学
- 嗜热酯酶EstTs1的远源三维结构模建及分子对接
- 2011年
- 利用Phyre网络服务器,构建嗜热酯酶EstTs1的三维结构,并通过分子动力学优化构型,得到了可靠的构型.分子对接研究表明,p-硝基苯基丁酸酯是EstTs1的最适底物,其大小正适合EstTs1的活性口袋.Thr111是底物与酶结合的重要残基,与底物形成了氢键;Ser85是重要的催化残基.
- 詹冬玲邵鸿泽韩葳葳刘景圣
- 关键词：分子对接
- 嗜热菌Pyrococcus horikoshii OT3蛋白酶基因的原核表达、纯化和性质表征被引量：6
- 2010年
- 将来源于嗜热菌Pyrococcus horikoshii OT3的蛋白酶(PH1704)基因在大肠杆菌BLP-CodonPlus中高效表达.采用超声、热失活和HiTrap Q Sepharose柱层析等方法对产物进行分离纯化.通过SDS-PAGE,Native-PAGE和Western-blot对表达产物进行鉴定,发现该重组酶以十二聚体为主的寡聚体形式存在,并具有SDS抗性.蛋白酶活力染色表明,其六聚体以上有活力.以azo-gelation为底物,对其酶学性质进行初步研究表明,其最适温度为85℃,最适pH=8.0,并且具有良好的热稳定性.
- 詹冬玲白挨玺白鹤韩葳葳冯雁
- 关键词：嗜热蛋白酶
- 松香酸在制备治疗和/或预防高尿酸血症的药物中的应用
- 本发明提供了松香酸在制备治疗和/或预防高尿酸血症的药物中的应用，属于生物医药技术领域。本发明首次通过酶活测定实验结合分子对接模拟，证实了松香酸在高尿酸血症中的潜在治疗作用，通过抑制黄嘌呤氧化酶的活性，可有效的减少尿酸的生...
- 李婉南戴惠咛钱志明许肖付学奇韩葳葳韩璐高波
- 嗜热蛋白酶PH1704别构中心量子化学计算与突变体动力学被引量：6
- 2014年
- 通过量子化学计算，确定嗜热菌PyrococcushorikoshiiOT3的PHl704蛋白酶别构位点的关键残基为Argll3，Tyrl20和Asnl29．其中，Argll3及Asnl29与别构抑制剂结合，参与别构调控．Tyrl20残基位于亚基交界面附近，并与亲核残基Cys100之间以氢键相连，可通过影响亚基聚合来影响酶的亲核催化．DJ-1超家族的4种构建蛋白的结构显示，120位点位于亚基交界面处，影响亚基的聚合，进而影响蛋白酶的活力，并间接参与别构调控．分子生物学实验显示，突变体R113T／Y120P／N129D的kcat/km（L·μmol^-1·min^-1）值是野生型kcat/km。值的6倍，h系数由野生型的0．86转变为1．3，负协同效应消失．113和129位点处阴离子别构剂脱离，从而破坏113，120和129位点间的封闭环结构，使AC交界面胡螺旋（124～129，524—529）间聚合度增强；120位点残基由rryr转变为Pro，与Cys100间氢键断裂，亲核进攻的阻力减小，从而使酶活力提高，别构负调控消失．
- 詹冬玲高楠韩葳葳冯雁
- 关键词：嗜热蛋白酶量子化学计算定点突变
- 黑色食物活性物质研究
- 2019年
- 黑色食品包含黑芝麻、黑米、黑豆、黑花生、黑木耳等众多食物种类,并且各个具有不同功效和食用方法,其中黑豆多肽含量多达36%~40%,黑花生中油酸的含量高达50%以上,大多黑色食物含有大量花青素、黄铜和酚类物质,这些物质对保肝护肾、预防肥胖,改善血糖和抗氧化方面有着巨大作用,本文对黑色食物的活性成分、作用及巨大的发展潜力做了介绍。
- 梁馨之李婉南韩璐常浩韩葳葳
- 关键词：黑色食物肝损伤发酵抗氧化
- 一种黄嘌呤氧化酶抑制剂及其筛选方法和应用
- 本发明提供了一种黄嘌呤氧化酶(XO)抑制剂及其提取方法和应用，属于医药技术领域。本发明提供的黄嘌呤氧化酶抑制剂，包括泽兰色原烯、枯醇和1,5,8‑对薄荷三烯中的至少两种。本发明提供的XO抑制剂能够与XO的活性中心形成Pi...
- 韩璐刘新胜韩葳葳董占德高波李婉南
- 文献传递
- 富勒烯衍生物作为新型抑制剂在酪氨酸磷酸酶PTP1B中结合模式的分子动力学模拟研究
- 富勒烯及其衍生物作为纳米尺寸的碳材料,具有高比表面积,强穿透能力等优秀的物理化学特性。这些特殊的性质使其在生物材料,药物治疗等领域有广泛的应用前景。实验发现经过特殊修饰的富勒烯衍生物对蛋白质酪氨酸磷酸酶(PTP1B)具有...
- 钱梦丹韩葳葳张浩王嵩
- 关键词：纳米碳材料抑制剂疏水作用
- 自分泌运动因子(ATX)抑制剂结合位点的预测及其与rPAI-1的分子对接
- 2014年
- 利用复合物指纹的虚拟筛选预测自分泌运动因子(ATX)抑制剂的结合位点,并通过与24个抑制剂(10个脂质和脂基抑制剂,14个小分子抑制剂)分子对接和动力学模拟表明,Thr209,Asp172,Tyr306,Phe210,Leu243,Leu213和Phe274是抑制剂结合位点的重要残基,且这些残基均通过侧链与抑制剂作用.利用3D-partner预测出与ATX结合的蛋白为纤溶酶原激活物抑制剂1(rPAI-1),并通过同源模拟,得到rPAI-1的分子结构.利用软件GRAMM将ATX与rPAI-1分子结构相结合,并通过分子动力学模拟确定与大分子抑制剂rPAI-1作用的ATX重要残基Glu155和Ala158.
- 詹冬玲郑明珠韩葳葳刘景圣
- 关键词：自分泌运动因子
