初冠囡
- 作品数:8 被引量:22H指数:3
- 供职机构:中国海洋大学海洋生命学院更多>>
- 发文基金:大连市科学技术基金国家自然科学基金大连市科技攻关项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 中间球海胆生长分化相关的AFLP标记被引量:2
- 2010年
- 从同一遗传背景、同环境下培养的1龄中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)中,分别选择大个体50只、小个体30只,分别组成大小2组海胆,两组之间壳径、壳高2个指标均存在显著差异。共选用6对AFLP引物组合对2组海胆进行PCR扩增,发现43个标记在大小2组海胆间存在显著的频率差异(P<0.05),其中29个位点差异极显著(P<0.01)。所有存在显著频率差异的位点中,2个位点在大海胆组中缺失,4个位点在小海胆组中缺失,14个位点在大海胆组中出现的频率显著高于小海胆组(P<0.05),而23个位点在小海胆组中出现的频率高于大海胆组(P<0.05)。这一系列谱带可能与中间球海胆生长性状之间存在一定的相关关系。遗传多样性分析结果表明,大海胆组的平均Shannon氏指数、Nei氏杂合度2个指标均显著高于小海胆组(P<0.05),提示杂种优势可能与中间球海胆的快速生长存在一定联系。
- 初冠囡秦艳杰李霞罗耀明
- 关键词:中间球海胆生长分化AFLP
- 中间球海胆性别性状的微卫星分析被引量:2
- 2009年
- 针对中间球海胆Strongylocentrotus interm edius育苗生产中很难进行活体性别鉴定这一特点,采用组织切片法和微卫星标记分析法对海胆进行观察分析。试验用样品由大连太平洋海珍品有限公司提供,共31只。采用组织切片法鉴别雌、雄个体,发现17只个体为雌性,14只个体为雄性。同时,将31只个体分为雌、雄两个群体,提取性腺组织基因组DNA,利用已经筛选好的11对引物对雌、雄两个群体进行微卫星分析。结果表明,两个群体的遗传多样性没有显著差异;发现INST09-A,INST10-A,INST10-B三个等位基因的频率在两个群体间存在极显著差异(P<0.01),位点INST10在雌、雄两个群体中的基因型频率存在极显著差异(P<0.01)。初步说明这些位点及相应等位基因可能与性别决定位点存在一定的连锁关系。
- 初冠囡金迪马驰原罗耀明宋晓楠秦艳杰
- 关键词:中间球海胆性别微卫星
- 采用16S rRNA基因序列分析海扇贝与3种扇贝的亲缘关系被引量:3
- 2009年
- 采用16S rRNA基因序列分析技术,对2005年引自加拿大的海扇贝Placopecten magellanicus以及中国现有种类——虾夷扇贝P.yessoensis、栉孔扇贝Chlamys farreri和海湾扇贝Argopecten irradians进行了遗传学比较分析。每个扇贝种群随机抽取2个个体,利用通用引物进行16S rRNA基因片段扩增并双向测序。所得序列去掉不可信位点后,得到433 bp的基因片段。序列比对分析得到306个变异位点,其中转换位点为124个,颠换位点为111个,既有转换又有颠换的位点为45个,插入和缺失为26个。核苷酸变异值及分子系统树结果表明,海扇贝与虾夷扇贝的亲缘关系较近。
- 李霞秦艳杰初冠囡周伯文
- 中间球海胆放流群体和养殖群体的遗传学比较被引量:2
- 2011年
- 利用微卫星技术,对中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)的放流群体与养殖群体进行了遗传学比较。共用11对微卫星引物,分别对每个群体所有个体进行了扩增分析。每对引物分别扩增出了1~5个等位基因。所有引物在养殖群体中共扩增出36个等位基因,而在放流群体中扩增出了30个等位基因。所得数据经Popgen32软件分析,结果表明,2个群体Nei指数,Shannon氏指数,多态位点比例等遗传学指标没有显著差异,说明研究中所涉及的中间球海胆养殖群体与放流群体之间尚未产生明显的遗传分化。6个等位基因在养殖群体中出现,而在放流群体中缺失。说明养殖群体与放流群体之间仍存在着一定的遗传结构差异。以上研究结果表明,该放流群体尚未达到对中间球海胆进行种质资源保护的最初目的。该研究对中间球海胆养殖、增殖放流状况进行了初步的遗传学评价,为海胆养殖、增殖途径及策略的选择奠定了理论基础。
- 孙博林张慧敏王霞初冠囡金迪万良秦艳杰
- 关键词:中间球海胆养殖群体微卫星遗传学
- 卵胎生鱼许氏平鲉(Sebastes schlegelii)雌亲家系的微卫星鉴定被引量:7
- 2013年
- 本研究利用17对微卫星标记对4个许氏平雌本所生家系进行初步鉴别。结果表明,17个位点在家系#1中可以获得的雄亲等位基因数为1—2个,家系#2扩增的雄亲等位基因数为2—5个,另外2个家系中扩增的雄亲等位基因数为2—4个,未出现6个以上等位基因的情况,初步断定,家系#1为一雌一雄交尾的全同胞家系,家系#3和#4是一雌二雄交尾的半同胞家系,而家系#2为一雌三雄交尾的半同胞家系。本文结果可为今后建立以家系为基础的许氏平遗传图谱构建、生产性状的遗传力估算及选择育种体系建立提供一定的理论基础和技术支撑。
- 初冠囡姜黎明于海洋张正睿王亚楠姜海滨张全启
- 关键词:微卫星标记卵胎生
- 许氏平鲉(Sebastes schlegelii)微卫星标记筛选及遗传连锁图谱构建
- 许氏平鲉(Sebastes schlegelii)-黑鲪是一种沿海地区炙手可热的养殖鱼类。许氏平鲉属于卵胎生鱼种,每年11月中旬左右开始交尾,交尾后精子留在雌鱼体内,次年5月左右产子。本研究利用富集文库一菌落原位杂交法构...
- 初冠囡
- 关键词:海水养殖鱼类许氏平鲉微卫星标记遗传连锁图谱亲缘关系
- 中间球海胆群体遗传学研究中AFLP引物数量及样本量的选择被引量:1
- 2012年
- 采用10,20,30,40,50,60,70,80共8个样本量梯度,随机选择并逐步增加AFIP引物组合,研究了AFLP标记数量及样本量对中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)群体遗传学指标的影响。结果表明:基因多样性指数(H)、Shannon氏指数(I)和多态位点比例(PP)3个遗传学指标对样本量的敏感程度不同,PP指标受样本量影响较大,样本量≥50个时方稳定,H指标在样本量≥30时稳定下来,而I指标在样本量≥20时即不再出现显著差异。共采用6对A FIP引物对80只海胆进行群体遗传学研究。通过每1对、每2对、每3对、每4对、每5对引物组合分别计算各遗传学指标,发现前二者所得各值之间以及其与对照值(6对引物所得值)之间存在显著差异,而每三对引物组合计算的各指标间不存在显著差异。据此推测,对中间球海胆进行AFLP标记研究中,样本数量最好不少于50个;而若样本量足够大(80个个体),则至少需要3对AFLP引物(或不少于100个标记),方能对海胆群体进行准确的遗传学评价。
- 秦艳杰金迪初冠囡李霞李永仁
- 关键词:中间球海胆AFLP标记样本量群体遗传学
- 利用AFLP技术分析海扇贝与三种扇贝的亲缘关系被引量:4
- 2009年
- 本研究采用AFLP技术,对2005年引自加拿大的海扇贝(Placopecten magellanicus)以及中国北方主要养殖的虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)、栉孔扇贝(Chlamys farreri)和海湾扇贝(Argopecten irradians)进行了遗传学比较分析。结果表明,共用5对AFLP引物进行了扩增,共扩增出501个位点,多态性位点为392个,多态位点比例为78.24%。平均Nei氏基因多样性指数H分别为0.2139、0.1684、0.1441和0.1670,平均Shannon氏指数I分别为0.3356、0.2681、0.2439和0.2656。海扇贝多态位点比例、Nei氏基因多样性指数和Shannon氏指数均处在较高水平,说明海扇贝遗传多样性较高。UPGMA聚类结果表明,海扇贝与虾夷扇贝亲缘关系最近。
- 秦艳杰李霞周伯文周贺段晶晶初冠囡
- 关键词:AFLP