王成雄
- 作品数:3 被引量:7H指数:2
- 供职机构:电子科技大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 分块PCA提取细胞周期调控基因的研究被引量:3
- 2008年
- 用主成分分析(PCA)方法处理基因表达微阵列数据能够实现基因选择、基因表达模式提取、基因分类等,有其独特的优点。然而,PCA方法却存在容易丢失重要信息的弱点。为了克服这一方法的弱点,提出分块PCA,并以此为基础形成一种提取细胞周期调控基因的新方法。通过理论分析和对酵母微阵列数据的仿真实验研究,表明这种方法可行、有效,能够全面地提取出隐含在方差较小变量中的细胞周期调控基因,并能够给予实验结果较好的生物意义解释,在微阵列数据处理中具有应用前景。
- 饶妮妮匡斌王成雄任正隆陈曦
- 关键词:分块PCA微阵列数据细胞周期调控基因
- 基于统计分析的微阵列数据挖掘技术
- 微阵列技术已经广泛地应用于生物学和医学等领域,它已经成为生物学研究中一种重要的实验方法。微阵列的出现使得我们能够在基因组范围内同时研究大量基因的表达差异。一个典型的基因表达数据中含有数千或甚至数万基因在几个或几十个不同条...
- 王成雄
- 关键词:微阵列技术数据挖掘方法
- 用主成分分析探索基因表达模式被引量:4
- 2007年
- 以时间点(阵列)为变量,对酵母时间表达序列进行主成分分析,提取出三个主成分:第一主成分代表整个酵母细胞周期中平稳的基因表达状态,第二主成分代表酵母细胞周期中lateG1期和M期差异的基因表达状态,第三主成分表示的是earlyG1期和S/G2期差异的基因表达状态。由第二、和第三主成分揭示出基因表达谱中四个周期性基因表达模式:分别对应lateG1期、M期、earlyG1期和S/G2期,而且发现了一批表达水平呈周期性变化的基因,为进一步研究基因周期性表达和基因调控网络提供有价值的指导。
- 王成雄饶妮妮王玉
- 关键词:主成分分析微阵列基因表达谱基因表达模式