宋晓
- 作品数：16 被引量：27H指数：2
- 供职机构：上海市肺科医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市科学技术委员会科研基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术金属学及工艺更多>>
- 模块化组织工程气管软骨构建的模具
- 本实用新型涉及气管软骨模具技术领域，具体为模块化组织工程气管软骨构建的模具，包括支撑环、定型组件和装配组件，所述支撑环内壁设置有成型槽，所述支撑环外壁设置有所述装配组件，所述定型组件包括支柱、底板、连接件和导向板，所述支...
- 高二击王鹏力宋晓徐勇段亮姜格宁
- 基于生物信息学分析的TPX2在肺腺癌中的表达及意义被引量：1
- 2021年
- 目的利用多种肿瘤生物信息数据库分析TPX2在肺腺癌样本中的表达及临床意义,并在临床病理标本中进行验证。方法通过检索Oncomine生物信息基因数据库,分析TPX2在不同肺腺癌数据集中mRNA表达情况;利用cBioportal生物信息基因数据库分析TPX2的突变频率、突变位点,并分析TPX2基因突变与预后的关系;利用HPA数据库的组织图谱分析TPX2蛋白质在肺腺癌组织中的表达情况。通过UALCAN和OncoLnc数据库检索肺腺癌与正常组织中TPX2的表达情况,分析其与肺腺癌临床病理分期的关系,并采用Kaplan-Meier在线分析TPX2表达与患者生存期的关系。通过Western印迹法实验对比肺癌患者癌组织与癌旁组织TPX2蛋白表达差异以及TPX2在不同肺癌细胞系中的表达情况。结果Oncomine数据库的结果显示,TPX2在人肺腺癌不同数据集中的表达均显著高于正常肺组织(均P<0.001),HPA数据库检索IHC实验结果显示:与正常肺组织相比,TPX2蛋白在癌组织中的表达水平显著上调(P<0.05)。生存分析发现高表达TPX2的肺腺癌患者的生存期显著低于TPX2低表达的肺腺癌患者,TPX2高表达患者预后更差(P<0.05);cBioportal数据库分析结果显示,TPX2共有30个位点发生变异,总变异率为4%,其中有17个位点发生突变,突变频率分别为4.06%(TCGA PanCan),3.83%(Broad),且存在TPX2突变的肺腺癌患者的DFS更差(P<0.05)。在探讨TPX2在不同肺癌细胞系及肺腺癌组织和癌旁组织中的表达差异时,发现TPX2在肺鳞癌、肺腺癌、肺大细胞癌细胞系中均存在高表达,且TPX2在肺腺癌组织中的表达量显著高于癌旁组织(均P<0.05)。结论基于肿瘤生物信息库综合分析发现,TPX2在肺腺癌组织中的表达水平明显高于正常肺组织,且TPX2的其表达水平与肿瘤预后具有相关性,TPX2在肺腺癌中的高表达预示患者预后不良。
- 王庆亮赵艳峰蒋燕宋晓杨富钧姜格宁
- 关键词：TPX2肺腺癌生物信息学预后
- 过表达和敲除沉默信息调节蛋白6质粒的构建及稳定肺癌A549细胞株的筛选
- 2018年
- 目的构建过表达和敲除沉默信息调节蛋白6(SIRT6)基因质粒,并筛选过表达和敲除稳定肺癌A549细胞株。方法采用PCR技术扩增SIRT6基因序列,通过中间质粒p SK连接在慢病毒质粒CD513B上,鉴定正确后进行慢病毒包装,收集含慢病毒颗粒的上清感染A549细胞,加入嘌呤霉素筛选出过表达SIRT6基因的稳定细胞株,蛋白质印迹法检测细胞SIRT6蛋白表达水平。利用规律成簇间隔短回重复/Cas9基因编辑技术敲除SIRT6基因,确定敲除靶点位置为SIRT6基因的第一外显子和第二外显子,分别构建第一个显子,第二外显子的SIRT6-小向导RNA(sgRNA),将SIRT6-sgRNA连接到有Cas9的质粒CD513B上后转染A549细胞,加入嘌呤霉素筛选出转染成功的细胞,通过无限稀释法筛选出SIRT6敲除基因的A549细胞系,蛋白印迹法检测细胞SIRT6蛋白表达情况。结果 A549细胞的感染荧光效率接近100%,蛋白质印迹法检测过表达SIRT6基因A549细胞的SIRT6蛋白呈高表达。DNA测序检测敲除SIRT6基因A549细胞系有移码突变,蛋白质印迹法检测无SIRT6蛋白表达。结论成功构建过表达和敲除SIRT6基因质粒,并筛选出过表达和敲除SIRT6基因的稳定肺癌A549细胞株。
- 吴爱鲁梁世雄宋晓付佳美周子洋宋晓婷赵志鹏张春燕
- 关键词：基因过表达基因敲除肺癌A549细胞
- 一种高效定向无缝DNA片段连接方法
- 本发明属于基因工程技术领域，具体为一种定向无缝DNA片段连接方法。本发明的连接引物两端要与待连接DNA片段2a和3a的待连接处两侧各有5-40个碱基的序列完全互补；由于引物的tm值随着碱基数量和GC含量的增加变高，而完成...
- 卢大儒周翔达宋晓孙海燕陈红岩
- 文献传递
- 一种气管组织形态固定器
- 本实用新型公开了一种气管组织形态固定器，包括安装块，所述安装块的内部设置有中心杆，所述中心杆的左端圆周表面设置有固定块，所述中心杆左侧圆周表面套设有旋钮和滑块，且滑块滑动安装在中心杆的圆周表面，所述旋钮设置在滑块的右侧，...
- 高二击王鹏力刘丹驰徐勇宋晓段亮姜格宁
- 20q13.33,11q23.3和5p15.33染色体区域基因多态性与中国汉族人群脑胶质瘤易感性研究
- 脑肿瘤是危害人类健康的严重疾病之一,最近几年发病率呈上升趋势,尤其在发达的西方国家。在全球,每年有18-60万中青年人因胶质瘤失去生命。欧洲人群脑胶质瘤全基因组关联研究(GWAS)发现了5个脑胶质瘤易感基因:TERT,C...
- 陈红岩宋晓陈元渊赵英杰范薇薇卢大儒
- 一种高效定向无缝DNA片段连接方法
- 本发明属于基因工程技术领域，具体为一种定向无缝DNA片段连接方法。本发明的连接引物两端要与待连接DNA片段2a和3a的待连接处两侧各有5-40个碱基的序列完全互补；由于引物的tm值随着碱基数量和GC含量的增加变高，而完成...
- 卢大儒周翔达宋晓孙海燕陈红岩
- 文献传递
- 局部晚期非小细胞肺癌放疗后重症放射性肺炎相关因素分析被引量：20
- 2017年
- 目的探索局部晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者接受放射治疗后发生重症放射性肺炎(SRP)的相关危险因素。方法前瞻性随访分析153例接受三维适形放射治疗的Ⅲ期NSCLC患者的临床和剂量学资料,对可能与SRP发生相关的危险因素进行单因素和多因素分析。结果 153例患者中共发生SRP 16例,发生率为10.5%。单因素分析显示,年龄、血气分析(p H)、全肺平均照射剂量(MLD)和全肺接受5Gy以上剂量照射体积百分比(V5)等与SRP的发生相关(P<0.05)。多因素分析显示年龄≥63岁(OR=0.258,P<0.05)为SRP发生的独立危险因素。受试者工作特征曲线(ROC)分析显示,V5、MLD、年龄和p H值这4个参数联合评估SRP发生的曲线下面积达到0.771(P<0.01)。结论 V5、MLD、年龄及p H值与不同人群SRP的发生相关,在评估局部晚期NSCLC患者的放射治疗时,对于高龄患者除了考虑剂量学因素外还应参考其血气分析等指标,以避免SRP的发生。
- 周子洋宋晓吴爱鲁谭顺顺梁世雄张春燕
- 关键词：非小细胞肺癌放射性肺炎
- 耐热DNA连接酶介导的TLCR技术在简化DNA重组实验中的应用被引量：2
- 2016年
- 传统的DNA重组方法 TypeⅡ型限制酶技术受到片段纯化的限制,无法做到复杂混合体系中DNA片段的特异性连接。为解决这个问题,本研究将耐热连接酶链式反应(Thermostable ligase chain reaction,TLCR)引入DNA片段的连接与捕获。该技术利用耐热型DNA连接酶的特性,在热循环反应中配合针对目的片段末端序列设计的单链寡核苷酸连接模板——Helper,实现目的片段的特异性连接和产物数量的指数性增长。两个质粒构建实验被用于验证TLCR技术的可行性和应用效果。首先利用TLCR技术从一个未经纯化的含有7种不同大小片段的混杂体系中特异性地将一段1.5 kb的片段捕获进载体,随机抽取的克隆样品经检验准确率达到80%,验证TLCR技术在复杂混合体系中特异性连接DNA片段的可行性和准确性。在另一个质粒构建实验中,TLCR技术从λ噬菌体基因组Hind消化物中将两段总长达27 kb的片段按顺序捕获进载体,随机抽取的克隆样品经检验同样达到了80%的准确率。结果表明,TLCR技术能够简化DNA重组实验的操作,并且适用于多片段和大片段的连接,可以为生物学研究提供便利。
- 周翔达宋晓怀聪孙海燕陈红岩卢大儒
- 关键词：HELPER
- 自噬通路基因多态性与晚期非小细胞肺癌含铂化疗疗效的相关性分析被引量：3
- 2017年
- 对晚期非小细胞肺癌患者采用含铂化疗是肺癌临床治疗中非常重要的方法,然而不同患者对含铂化疗的敏感性却存在着明显的个体差异,这提示发现潜在的分子标志物对预测临床中含铂化疗疗效具有关键作用。本研究旨在探索自噬通路基因多态性与晚期非小细胞肺癌含铂化疗疗效之间的相关性,以期寻找可能影响含铂化疗药物敏感性的分子标记。本研究纳入了1004例接受含铂化疗的晚期非小细胞肺癌患者,分析了自噬通路中13个基因上的99个SNP位点与含铂化疗临床获益、无疾病进展时间及总生存时间之间的相关性。研究发现,位于ULK1基因的位点rs7953348(G>A)(P=0.017,OR:0.67,95%CI:0.49~0.93)和rs12303764(A>C)(P=0.009,OR:0.63,95%CI:0.45-0.89)及位于ATG14基因上的位点rs17742719(C>A)(P=0.002,OR:1.83,95%CI:1.26~2.66)、rs8003279(A>G)(P=0.006,OR:1.65,95%CI:1.16~2.35)和rs1009647(G>A)(P=0.002,OR:1.70,95%CI:1.22~2.37)与临床获益存在显著关联,位于DRAM基因上的位点rs7955890(G>A)(P=0.004,HR:0.63;95%CI:0.46~0.86)和rs17032060(G>A)(P=0.006,HR:0.65,95%CI:0.48~0.88)及位于ATG3基因上的位点rs13082005(G>A)(P=0.012,HR:1.27,95%CI:1.05~1.53)与含铂化疗的无疾病进展时间显著相关,位于ULK1基因的位点rs7953348(G>A)(P=0.011,HR:0.74,95%CI:0.58~0.93)和位于ATG10基因上的位点rs1864183(G>A)(P=0.016,HR:0.42,95%CI:0.21~0.85)对含铂化疗的总生存时间有着显著影响。研究结果提示自噬通路在含铂化疗敏感性中发挥着重要作用,自噬通路基因多态性可能是预测含铂化疗疗效的潜在分子标志物,这可能为临床上肺癌的个体化医疗提供一定的理论基础。
- 王诗铭宋晓赵雪莹陈红岩王久存吴俊杰高志强钱吉白春学李强韩宝惠卢大儒
- 关键词：自噬基因多态性非小细胞肺癌
