赵南蓉
- 作品数:26 被引量:7H指数:2
- 供职机构:四川大学化学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家教育部博士点基金四川省科技计划项目更多>>
- 相关领域:理学生物学一般工业技术建筑科学更多>>
- 生物大分子体系的非正常扩散和动力学无序效应的介观统计理论研究
- 本次报告主要分为三部分:纳米粒子及蛋白分子在亚浓聚合物溶液中的非正常扩散、单分子拉伸实验的动力学无序理论以及DNA逃逸生物纳米孔的多指数动力学。(1)采用模耦合理论(Mode coupling theory)计算纳米粒子...
- 赵南蓉边玉坤董运洪冯晓清
- 非平衡定态化学反应体系对细致平衡偏离的不可逆性之随机热力学量度
- 2004年
- 在随机描述的层次上 ,成功地构筑了非平衡定态化学反应体系对细致平衡偏离的不可逆性之随机热力学判据 .基于 Fokker-Planck方程建立了连续 Markov过程系统的随机熵平衡方程 ,发现在随机态空间中随机熵的时间变率亦可分为源项和流项两部分贡献 .对于化学反应体系 ,作为态空间源项的随机熵产生可作为偏离细致平衡不可逆性的合适度量 ,此泛函量的零值标志着细致平衡 .进一步借助按系统广度量的Ω展开法 ,通过对随机力及共轭的随机流的分析揭示态空间中的随机熵产生仅源于状态对细致平衡的偏离 ,并主要来自非 Poisson涨落的贡献 。
- 赵南蓉李琳丽罗久里
- 关键词:FOKKER-PLANCK方程
- 聚合物溶液中纳米粒子扩散动力学的模耦合理论研究
- 采用广义朗之万方程描述纳米粒子在溶液中的扩散动力学,其中含时摩擦记忆内核通过模耦合理论计算。主要考察了来自纳米粒子与溶液粒子直接碰撞以及与溶剂密度涨落耦合的微观贡献。采用聚合物参考作用位点模型(Polymer Refer...
- 董运洪陈谙谱赵南蓉
- 文献传递
- 生物大分子体系的非正常扩散和动力学无序效应的介观统计理论研究
- 本次报告主要分为三部分:纳米粒子及蛋白分子在亚浓聚合物溶液中的非正常扩散、单分子拉伸实验的动力学无序理论以及DNA逃逸生物纳米孔的多指数动力学。(1)采用模耦合理论(Mode coupling theory)计算纳米粒子...
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- 模耦合理论计算纳米粒子在聚合物熔体中的含时扩散系数与常规扩散常数
- 2013年
- 分析和计算了纳米粒子在聚合物熔体中的含时扩散系数与常规扩散常数.采用广义朗之万方程描述扩散动力学,并通过模耦合理论计算摩擦记忆内核.为简单起见,只考虑了来自两体碰撞和溶剂密度涨落耦合作用两类微观因素对摩擦记忆内核的贡献.采用聚合物参考作用点模型以及Percus—Yevick闭合条件计算了聚合物-纳米粒子复合溶液的平衡态结构信息函数;详尽分析了纳米粒子的尺寸与聚合物链的尺寸对扩散动力学的影响.揭示了结构函数、摩擦记忆内核以及扩散系数等随着纳米粒子半径和聚合物链长的变化关系.结果表明,对于小尺寸的纳米粒子或者短链的聚合物,短时间的非马尔可夫扩散动力学特征比较显著,含时扩散系数需要更长的时间弛豫到常规扩散常数.微观因素对扩散常数的贡献随着纳米粒子尺寸的增加而减小,却随着聚合物链长的增加而增大.此外,模耦合理论得到的扩散常数与Stokes—Einstein关系的预测值进行比较,发现对于小尺寸的纳米粒子或者长链的聚合物,微观因素对扩散常数的的贡献占主导地位.相反,当纳米粒子较大或者聚合物链长较短时,流体力学的贡献会发挥重要作用.
- 赖鑫昱赵南蓉
- 关键词:聚合物熔体
- 单分子拉伸力实验中DNA解链动力学无序效应的介观统计研究
- 2015年
- 单分子拉伸力实验对DNA解链动力学的研究发现了拉断力分布的宽尾特征,意味着解链动力学速率的含时涨落,即动力学无序现象.本文立足一维广义朗之万方程,描述在拉伸力作用下大分子体系构象态转变动力学,结合分数高斯噪声和幂律摩擦记忆内核,引入构型涨落的亚扩散特征;借助Kramers速率理论,推导含时反应速率k(t,F)、非单指数衰减残存概率分布S(t,F)以及恒速拉伸力作用下的拉断力分布p(F)等,揭示动力学无序效应;将理论应用于DNA解链的单分子拉伸力实验研究,采用漏斗势能模型,拟合不同恒速拉伸力作用下的拉断力分布曲线,估算体系的本征反应速率和势能面特征参数;与Bell公式,以及基于马尔可夫近似的介观统计理论进行系统比较.结果表明,本文建立的动力学无序理论能很好地拟合实验结果,解释单分子拉伸力作用下DNA解链拉断力分布的宽尾特征,揭示了该动力学无序效应与DNA构型慢涨落亚扩散机制的内在关联.
- 边玉坤赵南蓉
- 蛋白质构型变化的二维广义郎之万方程描述
- 2011年
- 采用二维广义郎之万方程描述蛋白质构型的随机变化,并与电子输运过程的原子密度填充模型相协调.假设通过键和通过空间的两类电子输运路径分别受到高斯分数噪声和高斯白噪声的影响.推导了电子转移给体-受体距离涨落和荧光寿命涨落自相关函数的一般表达式.采用数值拉普拉斯反变换计算了蛋白质构型涨落动力学,并详尽讨论了长时间和短时间行为的渐近解析.最后,明确了基于二维广义郎之万方程的蛋白质构型描述与一维描述之间的关系.
- 王莹希林广双木赵南蓉严以京
- Anomalous diffusion and dynamic disorder in biomolecular systems based on mesoscopic statistical modeling
- In this talk, I will present three relevant topics concerning anomalous diffusion of nanoparticles proteins in...
- 赵南蓉
- 文献传递
- 动力学无序理论在单分子拉伸力实验中的应用
- 单分子拉伸力实验常用于探测大分子反应,如蛋白质解折叠等的本征速率及本征活化能信息。大分子反应动力学过程同时伴随着大分子构型的慢变化,导致速率含时涨落,即动力学无序现象。我们基于广义朗之万方程,引入分数高斯噪声及幂律摩擦内...
- 赵南蓉边玉坤董运红
- 文献传递
- DNA逃逸α-溶血素纳米孔动力学无序的涨落瓶颈模型研究
- DNA逃逸α-溶血素纳米孔实验发现DNA在纳米孔中残存概率的多指数衰减,意味着逃逸速率的含时涨落,即动力学无序。基于涨落瓶颈模型,将DNA穿孔过程描述为穿过一个涨落的瓶颈。假设DNA逃逸速率正比于涨落瓶颈的横截面积,由纳...
- 边玉坤赵南蓉
- 文献传递