边玉坤
- 作品数：8 被引量：0H指数：0
- 供职机构：四川大学化学学院更多>>
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- 相关领域：理学生物学一般工业技术更多>>
- 生物大分子体系的非正常扩散和动力学无序效应的介观统计理论研究
- 本次报告主要分为三部分：纳米粒子及蛋白分子在亚浓聚合物溶液中的非正常扩散、单分子拉伸实验的动力学无序理论以及DNA逃逸生物纳米孔的多指数动力学。(1)采用模耦合理论(Mode coupling theory)计算纳米粒子...
- 赵南蓉边玉坤董运洪冯晓清
- DNA逃逸α-溶血素纳米孔动力学无序的涨落瓶颈模型研究
- DNA逃逸α-溶血素纳米孔实验发现DNA在纳米孔中残存概率的多指数衰减,意味着逃逸速率的含时涨落,即动力学无序。基于涨落瓶颈模型,将DNA穿孔过程描述为穿过一个涨落的瓶颈。假设DNA逃逸速率正比于涨落瓶颈的横截面积,由纳...
- 边玉坤赵南蓉
- 单分子拉伸力实验中DNA解链动力学无序效应的介观统计研究
- 2015年
- 单分子拉伸力实验对DNA解链动力学的研究发现了拉断力分布的宽尾特征,意味着解链动力学速率的含时涨落,即动力学无序现象.本文立足一维广义朗之万方程,描述在拉伸力作用下大分子体系构象态转变动力学,结合分数高斯噪声和幂律摩擦记忆内核,引入构型涨落的亚扩散特征;借助Kramers速率理论,推导含时反应速率k(t,F)、非单指数衰减残存概率分布S(t,F)以及恒速拉伸力作用下的拉断力分布p(F)等,揭示动力学无序效应;将理论应用于DNA解链的单分子拉伸力实验研究,采用漏斗势能模型,拟合不同恒速拉伸力作用下的拉断力分布曲线,估算体系的本征反应速率和势能面特征参数;与Bell公式,以及基于马尔可夫近似的介观统计理论进行系统比较.结果表明,本文建立的动力学无序理论能很好地拟合实验结果,解释单分子拉伸力作用下DNA解链拉断力分布的宽尾特征,揭示了该动力学无序效应与DNA构型慢涨落亚扩散机制的内在关联.
- 边玉坤赵南蓉
- 动力学无序理论在单分子拉伸力实验中的应用
- 单分子拉伸力实验常用于探测大分子反应,如蛋白质解折叠等的本征速率及本征活化能信息。大分子反应动力学过程同时伴随着大分子构型的慢变化,导致速率含时涨落,即动力学无序现象。我们基于广义朗之万方程,引入分数高斯噪声及幂律摩擦内...
- 赵南蓉边玉坤董运红
- 文献传递
- DNA逃逸α-溶血素纳米孔动力学无序的涨落瓶颈模型研究
- DNA逃逸α-溶血素纳米孔实验发现DNA在纳米孔中残存概率的多指数衰减,意味着逃逸速率的含时涨落,即动力学无序。基于涨落瓶颈模型,将DNA穿孔过程描述为穿过一个涨落的瓶颈。假设DNA逃逸速率正比于涨落瓶颈的横截面积,由纳...
- 边玉坤赵南蓉
- 文献传递
- 生物大分子体系的非正常扩散和动力学无序效应的介观统计理论研究
- 本次报告主要分为三部分:纳米粒子及蛋白分子在亚浓聚合物溶液中的非正常扩散、单分子拉伸实验的动力学无序理论以及DNA逃逸生物纳米孔的多指数动力学。（1）采用模耦合理论（Mode coupling theory）计算纳米粒子...
- 赵南蓉边玉坤董运洪冯晓清
- 单分子拉伸力作用下DNA解链动力学无序的涨落瓶颈模型研究
- 单分子拉伸力实验对DNA解链动力学的研究发现了剪断力分布的宽尾特征,意味着解链动力学速率的含时涨落,即动力学无序现象。基于Zwanzig涨落瓶颈模型(fluctuating bottleneck model),假设解链过...
- 边玉坤李昊赵南蓉
- 文献传递
- 生物大分子体系的非正常扩散和动力学无序效应的介观统计理论研究
- 本次报告主要分为三部分:纳米粒子及蛋白分子在亚浓聚合物溶液中的非正常扩散、单分子拉伸实验的动力学无序理论以及DNA逃逸生物纳米孔的多指数动力学。(1)采用模耦合理论(Mode coupling theory)计算纳米粒子...
- 赵南蓉边玉坤董运洪冯晓清
- 文献传递
