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香蕉A基因组品种间遗传关系的SSR检测被引量：15: 2007年; 应用SSR技术,对32个香蕉A基因组类型品种(系)的遗传关系进行了检测。40对SSR引物在32个品种(系)中分别扩增带数在3～15个,平均每个SSR座位可检测2.99个多态性带;引物的多态信息量(PIC)在0.00～0.88,平均0.62。依据SSR数据计算的品种间遗传距离在0.00%～34.27%,平均12.45%,大多数品种间的遗传变异非常有限,但也存在着遗传差异突出的品种:FHIA25、Yangambi KM5、Pisang Jari Buaya、Rose和皇帝蕉。依据26%的遗传距离,除了FHIA25和Pisang Jari Buaya单独化成1组外,其它30个品种可以分为2组:品种间遗传差异相对较高的组I和品种间遗传差异相对较低的组Ⅱ。Williams与引进的洪都拉斯3号、M931之间,洪都拉斯1号和洪都拉斯2号之间,高脚青芽蕉和高脚顿地雷分别没有区分开来,这可能是同物异名,也可能是同一品种未能分辨的突变体。; 冀小蕊陈业渊王静毅郑丽珊魏守兴谢子四武耀廷; 关键词：香蕉 A基因 SSR

番木瓜果皮和种子总RNA提取方法的研究被引量：13: 2006年; CTAB法、SDS法和改良的热硼酸法所提取的番木瓜果皮总RNA产量分别是107.8、90.4和70.4μg/g;种子总RNA产量分别是164.0、204.8和111.2μg/g。用TSSE或TE溶液溶解CTAB法中的LiCl过夜沉淀,得到的总RNA完整性好、纯度高,种子总RNA的产量明显提高,达到300μg/g以上。用CTAB法提取的果皮和种子总RNA已成功用于cDNA合成、文库构建和抑制消减杂交(SSH)等后续分子生物学试验。; 王静毅郑丽珊冀小蕊邓柳红武耀廷; 关键词：番木瓜果皮种子总RNA SSH

香蕉SSR反应体系的优化被引量：4: 2007年; 以香蕉品种AAcv Rose为试材,研究了香蕉SSR技术中PCR反应体系的主要成分对SSR扩增结果的影响,并比较了聚丙烯酰胺凝胶及琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物多态性的差异。结果表明:在20μL的反应体系中,各成分的最适用量分别为TaqDNA酶0.5U/mL;Mg2+2.5mmol/L;引物0.4μmol/L;模板DNA20～40ng/μL;dNTPs0.1mmol/L。利用24个香蕉品种验证此反应体系,80g/L的非变性聚丙稀酰胺凝胶电泳检测结果显示,扩增产物在150～300bp之间,不同品种间DNA谱带具有多态性。聚丙稀酰胺凝胶电泳检测的DNA多态性高于琼脂糖。; 郑丽珊王静毅冀小蕊武耀廷; 关键词：香蕉简单重复序列

棉花EST-SSRs在香蕉中的通用性被引量：20: 2008年; 香蕉SSR分子标记开发和应用有限,通过对棉花SSR分子标记在香蕉中的通用性研究。用1343对棉花EST-SSR引物对贡蕉(AA)和野蕉(BB)两个材料进行转移扩增,得到226对有效扩增的引物。进一步用该226对引物对20个香蕉品种和4个野蕉材料扩增,得到了157对多态性引物。157对多态性引物共扩增到1188个条带,平均7.6个;引物的多态信息含量范围在0.58～0.91之间。依据获得的SSR数据,应用非加权类平均聚类方法,在相似系数0.60水平上,将24个品种分为两大类群,类群I是以A基因组为主的品种群,类群Ⅱ是以B基因组和A基因组与B基因组杂交的品种群,证明了棉花EST-SSR分子标记在香蕉中具有通用性。; 郑丽珊石玉真王静毅黄秉智冀小蕊张保才袁有禄武耀廷; 关键词：棉花香蕉聚类分析

番木瓜遗传改良研究进展: 2007年; 综述番木瓜在离体培养、杂交育种、基因工程育种方面的研究进展,分析其今后发展存在的问题,并对其发展前景进行展望。; 姜立珍郑丽珊张树珍; 关键词：番木瓜

长梗蕉SSR标记的研究被引量：5: 2007年; 以云南野蕉(Musa.bilbisiana Colla)为实验材料,应用选择性扩增微卫星(SAM)法分离、克隆50个DNA序列,其中20个非重复,可用。一共20个序列用于特异引物的设计,再从20个序列的23个基因座设计出23对特异引物。研究表明:所采用的开发SSR标记的方法不仅简便、效率高且成本低。此外,5′锚定引物的简并性,引物与设计的特异引物配对后,部分引物对在进行检测时扩增得到的条带不清晰且稳定性较低。; 郑丽珊王静毅冀小蕊徐碧玉武耀廷; 关键词：香蕉 SSR标记

棉花SSR分子标记在香蕉中通用性的研究被引量：17: 2007年; 香蕉栽培品种是由尖叶蕉(Musa acuminata Colla,记为A基因组)和长梗蕉(Musa bilbisiana Colla,记为B基因组)这两个原始野生蕉种内或种间杂交后代进化而成的。目前,香蕉SSR分子标记开发的数量和应用研究非常有限,需要开展其它物种SSR分子标记在香蕉中的通用性研究。棉花(Gossypium spp.)是重要的经济作物,已经从基因组和EST开发了大量SSR分子标记。本研究应用1595对棉花SSR引物首先对A基因组的代表品种贡蕉和B基因组的代表品种野蕉进行转移扩增,得到183对有效扩增的引物。然后以20个香蕉栽培品种和4个野蕉品种对183对有效扩增的引物进行多态性筛选,最后得到111对多态性引物,共扩增到797个等位基因,平均每对引物的等位基因数为7.2。引物多态信息含量(PIC)在0.61～0.91之间。应用非加权类平均聚类方法,在相似系数0.61处将24个品种分为两大类群,类群I是以A基因组为主的品种群,类群Ⅱ是以B基因组和A基因组与B基因组杂交的品种群。; 郑丽珊袁有禄王静毅冀小蕊黄秉智武耀廷; 关键词：香蕉棉花基因组 SSR标记

香蕉引进品种遗传关系的微卫星检测被引量：5: 2008年; 应用SSR标记技术,对33个香蕉引进品种(系)和1个国内品种的遗传关系进行了检测。40对SSR引物在34个品种(系)中扩增带数在4～17个之间,平均每个SSR座位可检测3.05个多态性带;引物的多态信息量(PIC)在0.21～0.91之间,平均0.78。依据SSR数据计算的品种间遗传距离在0～45.53%之间,平均28.19%,说明引进的香蕉品种之间存在较为丰富的遗传变异。UPGMA聚类分析将34个品种分为A基因组和AB基因组为主的2大品种类群。检测出多个与我国早期引进的主栽品种巴西蕉和Williams遗传差异突出的引进品种,这为筛选鉴定出新的替代品种,以及进一步在不同类群品种之间进行杂交选育新的品种奠定了基础。洪都拉斯3号与M931之间,洪都拉斯1号和洪都拉斯2号之间没有区分开来,它们可能分别是同一克隆,或者是同一克隆的突变体。; 冀小蕊陈业渊王静毅郑丽珊魏守兴谢子四武耀廷; 关键词：香蕉 SSR 聚类分析

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郑丽珊