刘艳妍
- 作品数:6 被引量:33H指数:3
- 供职机构:西北农林科技大学更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划转基因生物新品种培育专项“十一五”科技支撑计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- A-FABP基因5’侧翼区多态性及其与秦川牛肉用性状的关联分析
- 本研究通过对牛脂肪型脂肪酸结合蛋白基因5’侧翼区的1441bp序列进行SNPs检测,结果在转录起始位点上游-389bp处发现T→C突变,进而利用PCR-SSCP的方法在秦川牛、南阳牛、鲁西牛、夏南牛和郏县红牛共5个牛群体...
- 刘艳妍昝林森王洪宝季舒涵樊月圆
- 关键词:A-FABP基因PCR-SSCP遗传多态性肉用性状
- 文献传递
- 一种用A-FABP基因预示秦川牛肉质的分子标记方法
- 本发明公开了一种用A-FABP基因预示秦川牛肉质性状的分子标记方法,根据牛A-FABP基因序列设计一对引物;利用该引物对牛的基因组DNA进行PCR扩增,然后使用聚丙烯酰胺凝胶对PCR产物进行电泳分离,检测出牛A-FABP...
- 昝林森刘艳妍刘永峰郝瑞杰王洪宝
- A-FABP基因5′侧翼区多态性及其与秦川牛肉用性状的关联分析被引量:12
- 2010年
- 本研究通过对牛脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因5′侧翼区的1441bp序列进行SNPs检测,结果在转录起始位点上游-389bp处发现T→C突变,进而利用PCR-SSCP的方法在秦川牛、南阳牛、鲁西牛、夏南牛和郏县红牛共5个牛群体中进行个体基因型分析,结果发现3种基因型,分别命名为AA、AB和BB。χ2检验表明,除秦川牛外其它各品种在该基因座均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。基因型与秦川牛肉用性状的关联分析发现,AB基因型个体的宰前活体质量、胴体质量、含水率均显著低于AA和BB基因型个体(P<0.05),AA和BB基因型个体之间差异不显著;BB基因型个体大理石花纹等级极显著优于AB基因型个体(P<0.01),显著优于AA基因型个体(P<0.05)。推测这一位点可能是影响牛肉大理石花纹及含水率的主效QTL或与之紧密连锁,可尝试做为肉牛肉质性状的候选分子标记。
- 刘艳妍昝林森王洪宝季舒涵樊月圆
- 关键词:A-FABP基因PCR-SSCP遗传多态性肉用性状
- 秦川牛A-FABP基因的生物信息学分析被引量:17
- 2010年
- 【目的】克隆秦川牛脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因,并对其进行生物信息学分析,为深入研究A-FABP基因与秦川牛肉质性状的关系奠定基础。【方法】以秦川牛脂肪组织为材料,采用RT-PCR方法对牛A-FABP基因进行克隆。使用DNAMAN、NCBI等一系列在线软件及工具,对所得到的序列及其编码蛋白质的结构和特性等进行生物信息学分析。【结果】秦川牛A-FABP基因含有15个酶切位点,编码的蛋白分子质量为14.7 ku,二级结构主要以α-螺旋、不规则盘绕和延伸链为结构元件,含132个氨基酸,其中强碱性氨基酸18个,强酸性氨基酸19个,疏水氨基酸45个,不带电荷的极性氨基酸32个;含有6个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,3个肉豆蔻酰基化位点,1个FABP结合域;含有4个Ser、6个Thr和1个Tyres,这11个氨基酸均可能成为蛋白激酶磷酸化位点。【结论】秦川牛A-FABP基因编码的氨基酸序列与人、鸡、小鼠、大鼠、野猪的氨基酸序列同源性分别为84.09%,85.61%,71.97%,88.33%,81.82%,表明在进化关系上,A-FABP氨基酸序列有较好的保守性;此蛋白序列具有脂钙蛋白结合域,没有信号肽;无明显跨膜区,不含有二硫键。
- 季舒涵昝林森王洪宝刘艳妍
- 关键词:A-FABP基因生物信息学
- 牛A-FABP基因的多态性及其与秦川牛肉用性状的关联分析
- 作为脂肪酸结合蛋白家族的一员,脂肪型脂肪酸结合蛋白在脂质代谢中发挥重要作用,能协助脂肪酸在细胞内的转运,增加细胞内脂肪酸的含量。该基因在猪和鸡的突变验证与脂质代谢有关。本研究以脂肪型脂肪酸结合蛋白基因为研究对象,利用PC...
- 刘艳妍
- 关键词:A-FABP基因PCR-SSCP遗传多态性肉用性状
- 文献传递
- 一种用A-FABP基因预示秦川牛肉质的分子标记方法
- 本发明公开了一种用A-FABP基因预示秦川牛肉质性状的分子标记方法,根据牛A-FABP基因序列设计一对引物;利用该引物对牛的基因组DNA进行PCR扩增,然后使用聚丙烯酰胺凝胶对PCR产物进行电泳分离,检测出牛A-FABP...
- 昝林森刘艳妍刘永峰郝瑞杰王洪宝
- 文献传递