林细华
- 作品数：2 被引量：6H指数：1
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院基础医学院基础医学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 利用RIP-Chip筛选结合多聚胞嘧啶结合蛋白2的microRNAs
- 2014年
- 目的通过核糖核蛋白免疫沉淀-芯片技术(RIP-Chip)在人正常神经胶质细胞(HA)和神经胶质瘤细胞(T98G和U87MG)中筛选与多聚胞嘧啶结合蛋白2(PCBP2)相互作用的microRNA(miRNA)。方法选择兔抗人PCBP2抗体,用Western blot法检测PCBP2蛋白在HA、T98G和U87MG细胞中的表达。用兔Ig G作为阴性对照,收集3种细胞的RIP蛋白和RNA样品,通过Western blot检测PCBP2蛋白富集效果,利用Nano Drop定量并经Agilent2100检测RNA完整性。选择Affymetrix miRNA 3.0芯片对RNA样品进行杂交,筛选富集4倍以上且P<0.05的miRNA。结果用PCBP2抗体进行RIP-Chip实验,最终筛选和PCBP2相互作用的103条miRNA,1条前体miRNA和1条核仁小分子RNA;其中15条存在PCBP2的结合位点。结论 PCBP2可以通过识别靶序列或者以核糖核蛋白复合物形式在细胞内结合成熟的miRNA、前体miRNA或核仁小分子RNA。
- 韩为林细华阴彬彭小忠
- 长链非编码RNA-TP53TG1在神经胶质瘤细胞中对糖剥夺应激反应的影响被引量：6
- 2013年
- 目的构建长链非编码RNA-TP53TG1的真核表达克隆,并探索其在神经胶质瘤中对糖剥夺应激反应的影响。方法用RT-PCR方法从人胶质瘤细胞中扩增出TP53TG1;构建了TP53TG1的全长真核表达克隆;实时定量PCR检测其在U87MG细胞内的表达;同时用低糖(0.3 g/L葡萄糖、8 h)处理;real-time PCR检测GRP78、IDH1和PKM2的表达水平。结果成功构建了真核重组表达质粒pCIG-TP53TG1;在转染U87MG细胞36 h后,可见绿色荧光的表达,U87MG细胞中TP53TG1 mRNA升高了2.9×106倍(P<0.05);过表达TP53TG1的同时低糖处理,GRP78和IDH1 mRNA的表达水平显著升高(P<0.05),而PKM2 mRNA的表达水平显著降低(P<0.05)。结论在U87MG细胞中,TP53TG1可能通过影响GRP78、IDH1和PKM2 mRNA的表达,而参与到对糖剥夺的应激反应过程。
- 包雯杨彬夏启胜林细华韩为阴彬彭小忠
- 关键词：GRP78IDH1
