钮冰
- 作品数：52 被引量：162H指数：7
- 供职机构：上海大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：上海市技术标准专项上海市科学技术委员会资助项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：轻工技术与工程理学生物学医药卫生更多>>
- 基于便携式拉曼高光谱成像技术的散装奶粉中硫脲可视化现场快速检测方法研究
- 2022年
- 硫脲是一种含氮量高、毒性较大的潜在蛋白掺假化合物,常规的实验室检测方法过程复杂、效率低,无法满足口岸对大批次散装奶粉样本质量快速筛查的需求。为解决口岸抽样监管缺乏快速实时评价方法的难题,利用自主搭建的便携式点扫描拉曼高光谱成像系统,开发了一种简单高效的奶粉中硫脲现场可视化快速检测方法,确保散装奶粉在进出口环节的精准监管。研究以不同添加浓度(0.005%~2.000%)的硫脲奶粉混合物为样本,分别用Whittaker平滑方法和自适应迭代重加权惩罚最小二乘算法(airPLS)消除光谱数据的背景随机噪音信号和荧光背景干扰,峰值识别后对硫脲特征位移处的单波段数据进行二值化处理,得到混合样本感兴趣区域的二值热图,通过二值图中硫脲像素点的有无和坐标,对奶粉中的硫脲进行定性判别和定位分析。进一步分析得感兴趣区域内硫脲像素点数目与添加浓度的关系,结果表明随着添加浓度的增加,硫脲像素点数目呈线性增长趋势,其中线性拟合的决定系数(R^(2))为0.9913,硫脲的最低检出浓度为0.05%。在0.25%,0.60%,1.20%和1.50%的添加水平下,利用像素点数目和线性拟合关系预测奶粉中硫脲的浓度,结果显示预测浓度的相对误差范围为-9.41%~4.01%,相对标准偏差小于7%。该点扫描拉曼高光谱成像系统能在10 min内完成单个样本的检测,结合软件控制系统,实时对奶粉中的硫脲颗粒进行定性、定量和污染分布分析,方法简单高效、准确性好、灵敏度高、稳定性强,为口岸现场对散装奶粉中硫脲掺假物的实时快速检测提供了技术监管手段,能显著提升口岸现场散装样本的监管环节质量评价的精准性,为进口奶粉快速通关提供技术保障。
- 杨巧玲陈沁钮冰邓晓军马金鸽古淑青于永爱郭德华张峰
- 关键词：硫脲奶粉
- 两种分子分型技术在乳制品克诺罗杆菌污染溯源分析上的比较被引量：4
- 2018年
- 对2005-2006年进口婴幼儿配方奶粉等乳制品的原料及产品中分离获得的49株阪崎肠杆菌(Enterobacter sakazakii),通过二代测序技术获得其全基因组序列,并比较两种分子分型技术的优缺点。通过二代测序技术获得49个菌株的全基因组序列,通过fusA确定菌株种属,根据多位点序列分型(Multi-locus Sequence Typing, MLST)确定序列型(ST, Sequence type)。再对32株ST13菌株进行单核苷酸多态性位点分析(single nucleotide polymorphism, SNP),并构建进化树。结果 49株阪崎肠杆菌均确认为阪崎克罗诺杆菌(C.sakazakii)。49株C.sakazakii由8个ST(Sequence type,序列型)组成。ST13的菌株占分离菌株的绝对优势(65.3%, 32/49)。ST13菌株的SNP结果显示32株菌被分成4个组和5个独立的菌株。表明随着高通量测序技术的不断完善,通过全基因组序列的MLST分型方法完成初步分型,而针对遗传相似性很高的菌株,应用SNP分析深入分型,能对被克罗诺杆菌属(Cronobacter spp.)污染的乳粉进行快速溯源,对全球疫情调查有重要意义。
- 郭清艳钮冰杨捷琳
- 关键词：全基因组测序多位点序列分型单核苷酸多态性位点
- 克罗诺杆菌在特殊环境中耐受性与耐药性的研究进展被引量：6
- 2020年
- 克罗诺杆菌是一种严重威胁婴幼儿健康的食源性致病菌,主要通过婴幼儿食品传播,易使婴幼儿患上如脑膜炎、坏死性小肠结肠炎等致死性疾病。克罗诺杆菌可在干燥、高温等不适合微生物存活的环境中生存,为详细了解克罗诺杆菌在特殊环境中的特性,本文从克罗诺杆菌的耐干燥性、耐热性、耐酸碱性以及耐药性的角度介绍了其目前的研究进展,研究结果将对食品生产尤其是婴幼儿食品生产的安全、临床治疗上提供医学方法,从而保障人类的健康具有重要意义。
- 陈翠玲钮冰杨捷琳赵丽娜蒋原
- 关键词：耐受性耐热性耐药性
- Adaboost算法研究土壤微量元素含量与白血病的关系(英文)
- 2014年
- 目的:本文使用数据挖掘方法研究土壤中微量元素和白血病的相关性。方法:使用CFS-Adaboost算法研究我国29个省、市、自治区白血病死亡率的统计数据和土壤中微量元素含量的对应关系。结果:从29种微量元素中发现了13种微量元素与白血病相关,其中砷(As)的相关性较为明显。基于该13种微量元素,建立了土壤中微量元素和白血病致死率的数学模型,该模型的预报准确率可达到89.7%。结论:土壤中微量元素的含量与白血病有一定关系,其中砷(As)元素含量与白血病死亡率较为密切,这与近年文献报导的少量氧化砷治疗白血病效果显著相符合。以上研究发现,可以为研究土壤中微量元素和白血病的关系提供参考,对白血病的防治工作具有一定意义。
- Isabel Cristina Echeverri Ocampo陈丁滢钮冰陈付学
- 关键词：白血病微量元素ADABOOST算法
- 膜蛋白分类在线预报方法
- 本发明公开了一种膜蛋白分类在线预报方法。本方法是利用机器学习方法Bagging对一个膜蛋白数据库样本进行学习，输出学习模型。预报器载入学习模型，输入数据转换器由Web客户端提交的膜蛋白序列码转换所得只包含“0”和“1”的...
- 金雨欢陆文聪钮冰刘亮王丽
- 文献传递
- 多位点序列分析方法在克罗诺杆菌属菌株溯源分析上的应用被引量：3
- 2019年
- 克罗诺杆菌(Cronobacter)是一种急性细菌病原体,最初因与新生儿重症监护室爆发的几起致死性疾病(脑膜炎,坏死性小肠结肠炎)相关而受到人们广泛关注。目前Cronobacter PubMLST基因组和序列定义数据库(http://pubmlst.org/cronobacter/)中已包含超过2400多株克罗诺杆菌分离菌株的序列信息,阪崎克罗诺杆菌1774株,丙二酸盐阳性克罗诺杆菌295株是其中的优势菌种,这些菌株共分离自40多个国家和地区。通过将7个位点的多位点序列分型(7-loci multilocus sequence typing,7-lociMLST)方案应用于2438株克诺罗菌株,共揭示了591种可定义的序列型(sequencetype,ST),其中ST4(334株)、ST1(280株)、ST7(78株)和ST13(67株)为主要序列型。7-lociMLST对于克罗诺杆菌的致病型分型鉴定有很大帮助,但由于MLST所针对的七个基因位点在基因组总量中占比较小,导致同一ST型中包含地理来源,分离时间,宿主等不相关的菌株,而对菌株溯源结果适得其反。为了解决这一问题,本研究进一步采用基于直系同源基因簇的多位点序列分析方法(Clusters of Orthologous Genes MLST, cogMLST(1865-loci)),对PubMLST中240株已完成全基因组测序的菌株,包括阪崎克罗诺杆菌ST1(67株),ST4(95株),ST13(43株)和丙二酸盐阳性克罗诺杆菌ST7(35株)进行了全基因组序列分析。结果显示,cogMLST可对ST型相同,但无相关性的菌株进行进一步分型,且不同聚类与菌株分离国家及来源之间存在一定相关性。这或许对于相同ST克罗诺杆菌属菌株的全球溯源分析及食源性疾病监测有较大帮助。
- 闫瑞杨捷琳陈翠玲钮冰徐之雯蒋原
- 关键词：多位点序列分型
- 深度学习在野生动物保护中的应用
- 2023年
- 野生动物是重要的生物资源之一,但是人类活动的增加和自然环境的恶化严重威胁着野生动物的生存。而深度学习已经成为人工智能领域重点研究方向之一,被广泛应用于各个学科领域,其灵活性使得它在野生动物保护中的图像识别、监测和音频识别等方面展现出了巨大的潜力。本文介绍了几种常见的深度学习算法,综述了不同深度学习模型在野生动物保护中的应用,分析了目前存在的问题及挑战,包括有限的训练数据、环境条件的多变性以及野生动物行为的复杂性等。在未来利用深度学习保护野生动物,除了要解决数据获取和利用、图像的抗干扰等方面的挑战外,还需开发更加稳健和高效的深度学习模型,以满足野生动物保护的特殊需求。
- 钟俊杰钮冰陈沁陈翔王艳
- 关键词：图像识别野生动物保护
- 基于液相色谱-质谱的蛋白质组学技术在食品鉴伪中的应用被引量：6
- 2019年
- 随着全球化的发展,食品供应链范围更加宽泛,而食品掺假等欺诈问题日益严重,影响着全球的经济市场、食品质量与安全监管和消费者的身体健康,食品掺假现象已得到社会各界的广泛关注。食品检测技术错综复杂,随着人类基因组序列测定的完成,人们把检测的研究方向转向了蛋白质组学,这种检测手段的先进性、适用性在食品质量和安全等方面取得广泛应用。质谱作为蛋白质组学方法的常用技术,可利用质谱的高通量分析优势对蛋白质和肽段进行鉴定、检测和定量研究,即可开发简单的、快速的方法来分析复杂的或深加工的食物,又可定量检测具有高分离度的微量分析物。本文主要介绍了蛋白质组学方法在食品鉴伪中的应用,阐述了高分辨质谱技术在乳制品、肉类、海产品以及葡萄酒的食品欺诈检测鉴别中的运用,为该类食品安全问题的处理提供有效的参考。
- 孟佳钮冰古淑青邓晓军方真
- 关键词：蛋白质质谱
- 高效液相色谱-蒸发光散射法测定液态乳中乳果糖含量被引量：1
- 2021年
- 液态乳中乳糖和乳果糖是同分异构体,因保留特性相似,成为色谱法分离检测乳果糖的难点。目前,虽有多种液相色谱检测乳果糖的报道,但方法在前处理的简便性、色谱柱的适用性及分离效果的稳定性等方面存在不足。该研究建立了高效液相色谱-蒸发光散射(HPLC-ELSD)检测液态乳中乳果糖的方法。采用0.4 mol/L醋酸铵(pH 3.8)沉降蛋白,氨基色谱柱分离,蒸发光散射检测器检测。液态乳中乳果糖与乳糖得到了良好的分离,在1.0~100 mg/L范围内线性关系良好(r^(2)=0.9980),检出限为15 mg/L,定量下限为50 mg/L,回收率为85.1%~110%,相对标准偏差(RSD)不大于7.5%。该方法操作简单,可在8 min内完成检测,结果重复性好、准确度高,满足液态乳中乳果糖的日常检测要求。
- 孙佩任硕陈柔含古淑青钮冰邓晓军
- 关键词：乳果糖高效液相色谱蒸发光散射液态乳
- 基于CFS算法研究肾癌中的关键基因
- 2017年
- 目的:识别肾细胞癌(RCC)中的关键基因,并揭示其在肿瘤中的作用机理.方法:从GEO数据库下载芯片数据GSE53757,筛选它们之间的差异表达基因(DEGs).使用DAVID在线工具对DEGs进行GO功能注释和KEGG富集分析,然后使用基于特征子集相关性(CFS)的变量筛选方法筛选DEGs的关键基因,并根据筛选出的关键基因,使用支持向量机(SVM)方法建立筛选RCC样本和正常对照样本的分类预测模型.结果:共筛选到541个DEGs,包括312个上调基因和229个下调基因.选择21个作为特征基因,通过SVM方法建立RCC样本和正常对照样本之间的分类模型,其预测精度为97.2%.此外,STRING数据库筛选的Top10Hub基因中也发现了4个与CFS算法筛选出的特征基因重合的Hub基因(CD40,EGFR,CAV1和TGFA).结论:CFS是用于筛选RCC中关键基因的有用工具.并且,CD40,EGFR,CAV1和TGFA这4个基因很可能为诊断RCC的目标基因.
- 张梦莹卢易钮冰苏强
- 关键词：基因表达谱癌症分类基因选择肾癌
