黎刚果
- 作品数：9 被引量：9H指数：2
- 供职机构：国防科学技术大学机电工程与自动化学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术机械工程更多>>
- 结合蛋白质相互作用数据进行基因表达数据聚类被引量：1
- 2009年
- 提出了一种蛋白质相互作用的相似性度量,将其与基因表达数据的相似性度量相结合,定义了一种融合的距离度量,并且将这种融合的距离度量用于改进现有的K-means聚类方法。经过实际数据的检验,改进后的K-means方法比常用的其它几种聚类方法具有更好的效果,说明结合蛋白质相互作用数据可以使得基因表达聚类的结果更有生物意义。
- 黎刚果王正志
- 关键词：蛋白质相互作用基因表达数据聚类
- 基于物理化学性质优化的蛋白质相互作用预测研究被引量：2
- 2009年
- 蛋白质相互作用预测是生物信息学研究的重要问题之一.提出了一种基于物理化学性质优化的蛋白质相互作用预测方法,与现有方法的显著不同就是,并未使用已知的氨基酸残基的物理化学性质,而是通过粒子群算法优化得到有益于相互作用预测的物理化学性质数值.对真实的数据集测试表明,优化得到的物理化学性质比现有的物理化学性质更有益于提高蛋白质相互作用的预测性能,与其它方法相比,也具有一定的优势,说明该方法是一种有效的蛋白质相互作用预测方法.
- 倪青山王正志赵英杰黎刚果
- 关键词：蛋白质相互作用物理化学性质粒子群优化算法
- 某型导弹起竖臂起竖过程的仿真被引量：3
- 2006年
- 在ANSYS环境中建立了某型导弹起竖臂的有限元模型;然后对起竖臂的起竖过程进行了分析,利用ANSYS结构参数化设计语言APDL进行编程,实现了对带弹起竖时起竖臂起竖过程的仿真,并得到了相应的结果。
- 黎刚果张锡恩杜力民
- 关键词：ANSYS有限元模型APDL语言
- 结合基因表达数据和ChIP-chip数据的酵母转录调控模块的识别
- 2011年
- 活细胞依赖其众多的转录调控模块来实现复杂的生物功能,识别转录调控模块对深入理解细胞的功能及其转录机制有着重要的意义。本文结合酵母基因表达数据和ChIP-chip数据,提出了一种转录调控模块识别算法。该算法通过采用不同的P值阈值分别得到了核心集和粗糙集,然后对核心集和粗糙集进行判别,最后对基因进行扩展之后得到基因转录调控模块。将该算法运用到两个酵母基因表达数据中,得到了一些具有显著生物学意义的基因转录调控模块。与其它算法相比,该算法不仅可以识别含有较多基因的转录调控模块,而且可以识别一些其它算法不能识别的基因转录调控模块。识别得到的基因转录调控模块有着不同的生物学功能,并且有助于进一步理解酵母的转录调控机制。
- 王晓敏王正志王广云黎刚果
- 关键词：基因表达数据酵母
- 一种基于线性流形的基因表达数据的聚类方法
- 2010年
- 由于基因表达数据的稀疏性和噪声性,传统聚类算法对其聚类时不能取得好的效果。针对这一问题,一种新的线性流形方法被提出,它的基本思想是搜索数据集中的线流形聚类,再将其中某些线流形聚类融合构造高维流形聚类。该算法将切向距离和法向距离作为线性流形的距离度量,运用空间近邻信息,采用聚类基因的平均表达水平作为转移向量,提高了聚类的准确度。实验结果表明,该算法的聚类准确性优于其它聚类算法,并且对带有噪声的数据可以保持较高的聚类准确度;在对Hela基因表达数据聚类时,算法得到了具有显著生物学意义的聚类。这些都说明提出的算法对基因表达数据聚类的适用性和有效性。
- 黎刚果王正志王广云倪青山强波
- 关键词：基因表达数据线性流形子空间聚类
- 基于K近邻的蛋白质功能的预测方法被引量：2
- 2009年
- 蛋白质功能预测是后基因组时代研究的重要问题之一。利用蛋白质相互作用网络,提出了一种基于K近邻的蛋白质功能的注释方法,该方法首先计算待注释的蛋白质与所有已知功能的蛋白质间的注释环境相似度,选择其中最相似的K个蛋白质,将该K个蛋白质的功能注释进行加权平均,作为待注释的蛋白质最终的功能注释。在构建的芽殖酵母的两组大规模相互作用数据集上的测试表明,该方法能够有效的对蛋白质功能进行预测,在蛋白质功能预测性能上优于现有的一些方法。
- 倪青山王正志黎刚果孟祥林
- 关键词：蛋白质相互作用蛋白质功能预测K近邻算法
- 导弹起竖臂的静动态有限元分析被引量：1
- 2006年
- 某型导弹起竖臂静动态有限元模型在ANSYS中建立,并采用动静法对其分析。模型含起升载荷,臂架结构自重载荷、导弹重力等载荷。当起竖臂所载起升质量突然离地起升或下降制动时,将起升和导弹重力载荷乘以起升载荷动荷系数或乘以起升冲击系数,获得前10阶振型。对起竖臂动态分析中,起竖臂低阶振型表现为起竖臂整体的振动,高阶振型则为起竖臂某个局部的振动。
- 黎刚果张锡恩王磊刘于端
- 关键词：ANSYS有限元模型动静法振型
- 一种提取捷联式惯性测量系统中加速度计动态误差的方法
- 2007年
- 本文提出了一种利用方向余弦矩阵提取捷联式惯性测量系统中加速度计动态误差的方法。
- 傅振华黎刚果王卫国黄海彬
- 关键词：加速度计
- 基因模块识别与分析相关问题研究
- 随着高通量生物芯片实验技术的出现,产生了大量的生物芯片数据。通过对不同芯片实验数据的分析,可以得到一些不同类型的分子网络,比如:蛋白质相互作用网络、基因调控网络、代谢网络等。研究表明,网络都具有模块性,而生物的功能往往也...
- 黎刚果
- 关键词：基因调控网络
- 文献传递
