吴丹 作品数:15 被引量:30 H指数:3 供职机构: 北京大学基础医学院医学遗传学系 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家教育部博士点基金 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
RNA干扰技术在医学遗传学中的应用 被引量:3 2005年 Experimental RNA interference (RNAi) leading to the selective knockdown of gene function is induced by introducing into cells either double stranded RNA (dsRNA), or short interfering RNA (siRNA) fragments into which dsRNA is cut. The siRNA triggers degradation of homologous messengerRNA (mRNA). Widely used as a research tool in the genetic model organisms Caenorhabditis elegans, Drosophila melanogaster and mouse to investigate the function of individual genes, RNAi has also been deployed in genome-wide, specific gene-knockdown screens. Recent rapid progress in the application of RNAi to mammalian cells, including neurons and muscle cells, offers new approaches to drug target identification and validation.Advances in targeted delivery of RNAi-inducing molecules have raised the possibility of using RNAi directly as a therapy for a variety of human genetic and other neural and neuromuscular disorders. Here, we review examples of the application of RNAi to worm, fly and mouse models of such diseases aimed at understanding their pathophysiology. 吴丹 吴白燕 梁红业 Nanbert ZHONG关键词:RNA干扰 动物模型 遗传性疾病 抑制人BI-1基因表达shRNA重组慢病毒表达载体的构建(英文) 被引量:1 2009年 背景:慢病毒介导的RNAi技术以其专一性、抑制效率高、作用持久等优点已广泛应用于基因功能研究中。该技术病毒包装、转染、以及shRNA序列设计都会对抑制效率产生影响。因此实验以人的Bax抑制子1(BI-1)为目的基因进行RNA干扰实验来探讨其影响因素。目的:为了利用慢病毒Lentivirus介导的RNAi技术寻找抑制人BI-1基因表达的siRNA。设计、时间及地点:单一样本观察,于2007-09/2008-12在北京大学医学部基础医学院医学遗传学系完成。材料:293T细胞、SH-SY5Y细胞为实验室保存;用Ambion公司(www.ambion.com)提供的网络在线工具设计了4个shRNA。方法:构建带有绿色荧光蛋白(EGFP)标签的、针对人BI-1基因不同区域设计的shRNA重组表达载体,然后与包装蛋白表达载体共转染293T细胞以包装成4种shRNA病毒粒子。通过流式细胞仪检测GFP的表达情况来摸索最佳包装条件。Real-timePCR以β-肌动蛋白mRNA被用作内参,将4种重组病毒和对照组病毒上清液侵染SH-SY5Y,检测内源性BI-1基因的敲低效率,筛选到最佳RNAi有效序列。主要观察指标:被不同包装病毒侵染的细胞内GFP的表达率。结果:pLentiLox3.7、rev、vsvg、rre等4质粒包装系统的最佳包装比例为2:1:1:1,包装48h收获的病毒粒子的感染效率最高,并且在包装后的24h之后换液会提高包装效率。靶定到人BI-1基因-2-17核苷酸(起始编码区域)的shRNARNA干扰效率最高。能够抑制40%正常基因表达。结论:实验摸索出Lentivirus介导的RNAi技术病毒包装的重要影响因素。为建立稳定的人BI-1基因表达敲低的神经细胞模型和研究BI-1异常表达参与的神经元凋亡疾病的病理研究打下基础。 吴丹 王师尧 王佩蓉 金巍娜关键词:RNA干扰 青少年型神经元蜡样脂褐质沉积病(JNCL)的发病机制 被引量:2 2009年 神经元蜡样脂褐质沉积病(Neuronal ceroid lipofuscinosis,NCLs)是一组儿科神经退行性变疾病,青少年型神经元蜡样脂褐质沉积病(Juvenile neuronal ceroid lipofuscinosis,JNCL)是其中一型。其临床表现包括视网膜退化进而失明、癫痫以及进行性的认知和运动能力的减退。本文综述了其发病机制,包括凋亡、自噬、质膜相关的功能障碍、氧化应激与NO转导通路受阻、线粒体和溶酶体功能障碍、胞内pH失衡等。其中研究最为清楚的是细胞凋亡和自噬两种方式。在凋亡中,CLN3基因正常功能的缺陷导致神经酰胺的积累,导致线粒体膜通透性增加(MMP),并最终引发依赖胱酰蛋白酶(Caspase)以及非依赖胱酰蛋白酶的凋亡。自噬既有发生又有被破坏,其破坏的主要原因是自噬小泡的不成熟导致自噬不能有效循环。本文对发病机制,尤其是其细胞死亡的途径的阐述,将有助于对JNCL等神经退行性病变一类疾病的认识。 王师尧 金巍娜 吴丹关键词:发病机制 细胞凋亡 自噬 医学遗传学双语教学的探索与思考 被引量:2 2010年 在学术交流日益全球化的推动下,双语教学已经成为一种新型的教学形式,引起了教育界的广泛重视。作为一门基础医学学科,医学遗传学实施双语教学具有积极意义,而目前在课程体系、师资力量、教材选用、学生英文水平等方面尚有欠缺。因此,应当在明确专业目标为主的前提下,进行充分的研究与实践,以推动医学遗传学双语教学的顺利进行。 吴丹关键词:医学遗传学 双语教学 环状RNA在肿瘤中的表达与功能 被引量:6 2019年 环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类闭合环状的内源RNA分子,广泛存在于不同物种及多种人体细胞中,具有丰富性、稳定性和组织特异性等特点。人体细胞中的circRNA主要可分为外显子circRNA、环状内含子RNA和外显子-内含子circRNA等。与正常组织相比,circRNA在多种肿瘤组织中异常表达,并具有作为微小RNA(microRNA,miRNA)海绵调控miRNA、结合蛋白质、参与翻译等功能。虽然circRNA在肿瘤中异常表达的具体机制尚不明确,但其在食管鳞状细胞癌、胃癌、结直肠癌、肝细胞癌、神经胶质瘤等多种肿瘤发生、发展的分子通路中具有重要作用,并有望成为全新的肿瘤标志物和治疗靶点。circRNA领域的发展日新月异,本文根据最新研究报道,就circRNA的基本特征、异常表达机制、调控肿瘤的机制及其在多种肿瘤中发挥的作用作一综述。 李可 林进 吴丹关键词:肿瘤 生物学标记 血管紧张素Ⅱ促进心脏成纤维细胞periostin的表达 2010年 李丽 凡栋 王程 吴丹 崔晓兵 吴立玲关键词:心脏成纤维细胞 PERIOSTIN CREB 结合活性 蛋白磷酸化 高糖促进成年大鼠心脏成纤维细胞periostin表达及其信号转导机制 被引量:2 2010年 心肌纤维化是糖尿病心肌病时心室舒缩功能障碍的主要机制之一。心脏成纤维细胞分泌的一种细胞外基质蛋白periostin与心肌纤维化及间质重塑密切相关。本研究旨在观察高糖对心脏成纤维细胞periostin表达的影响及其相关信号转导机制。在离体培养的成年大鼠心脏成纤维细胞,采用低糖(5.5mmol/L)和高糖(25mmol/L)干预,RT-PCR检测periostinmRNA表达,免疫印迹法检测periostin蛋白表达,荧光法检测细胞内活性氧(reactive oxygen species,ROS)含量。结果显示,高糖刺激12h可使periostin mRNA表达增加117.26%,刺激24h可使其蛋白表达上调93.12%,高糖刺激30min可显著促进心脏成纤维细胞内ROS的产生,蛋白激酶C(protein kinase C,PKC)抑制剂白屈菜红碱可减少高糖诱导的ROS生成增加。高糖诱导的periostin蛋白表达增加可被白屈菜红碱或ROS清除剂N-乙酰-L-半胱氨酸(N-acetylcysteine,NAC)所抑制。高糖刺激30和60min可显著增加磷酸化c-Jun氨基末端激酶(c-jun N-terminal protein kinase,JNK)的含量,应用白屈菜红碱或NAC可抑制高糖诱导的磷酸化JNK含量增加。JNK抑制剂SP600125预孵育明显抑制了高糖诱导的periostin蛋白表达增加。上述结果提示,高糖刺激可促进periostin的mRNA和蛋白表达,激活PKC/ROS/JNK通路介导高糖诱导的periostin表达增加。 邹平 吴立玲 吴丹 凡栋 崔晓兵 周允 王程 李丽关键词:高糖 心脏成纤维细胞 PERIOSTIN 信号通路 CTRP3通过抑制肌成纤维细胞转化减轻心梗后心肌纤维化 目的:探讨CTRP3在心肌梗死诱导的心肌纤维化中的作用及分子机制.方法:左前冠状动脉结扎法制备心梗大鼠模型,心肌局部注射CTRP3腺病毒(Ad-CTRP3)或对照腺病毒(Ad-GFP),Masson染法检测心肌纤维化程度... 吴丹 李丽 吴立玲医学遗传学课程内容设置的思考 在科技飞速发展的今天,医学基础学科都侧重从分子水平探究人类疾病的致病机理。怎样利用学科交叉的特点,既让学生能将人体医学从微观到宏观,从抽象到具体,融会贯通地理解,又能利用有限的计划学时,尽可能整体优化教学内容,避免知识重... 吴丹 梁红业 杨玉霞关键词:医学遗传学 教学内容优化 血管紧张素Ⅱ促进心脏成纤维细胞periostin的表达 <正>目的:探讨血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)对periostin表达的影响及信号转导通路。方法:AngⅡ缓释泵输入或孵育心脏成纤维细胞,RT-PCR、免疫印记及免疫荧光检测periostin mRNA和蛋白表达及分布;免疫印... 李丽 凡栋 王程 吴丹 崔晓兵 吴立玲文献传递