聂鹏宇
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 供职机构：中国科学技术大学计算机科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术更多>>
- 一种跨平台的并行编程框架设计与实现被引量：1
- 2014年
- 并行程序设计的复杂性及并行计算平台的多样性导致程序可移植性较差。为此,设计并实现一种跨平台、分层次的并行编程框架OpenCH。该框架通过两层并行函数库和层次化的API设计,对上层应用程序隐藏并行化细节,为基于不同计算平台的库函数设计了统一的函数接口,使底层平台的变化对上层应用程序透明。根据底层函数库的开发,给出一种填充式的编程方法和任务调度系统。将OpenCH应用于遥感影像分类,实验结果证明,基于该框架开发的并行程序可运行于多种并行计算平台,并具有较高的并行加速比,编程框架本身造成的时间开销低于15%。
- 李婷徐云聂鹏宇潘玮华
- 关键词：并行计算跨平台MPI编程
- 基因组序列物种聚类问题研究及DNA聚类的云计算实现
- 基因组学是研究生物基因组奥秘的新技术，随着测序技术在过去十几年间的高速发展，目前我们已经进入了千元人类基因组阶段，这极大推动了研究微生物信息和群落的功能的宏基因组学发展。同时基于下一代测序技术的宏基因组项目的发展，也产生...
- 聂鹏宇
- 关键词：生物序列云计算
- 文献传递
- 基于仿射聚类的宏基因组序列物种聚类被引量：1
- 2013年
- 随着下一代测序技术的迅猛发展,宏基因组学已经成为新的研究热点,宏基因组学序列聚类问题使用无参考的方法,对包含多个物种的宏基因组序列进行有效分离.为此,提出一种结合相似度信息和结构信息的宏基因组物种聚类算法,并引入仿射聚类来进行序列物种聚类.实验数据表明该方法聚类精度高、执行速度快.我们也开发了基于该方法的宏基因组序列物种聚类软件.
- 聂鹏宇潘玮华徐云
- 关键词：宏基因组学DNA序列倒排索引
