孙桂芝
- 作品数：25 被引量：34H指数：4
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项基础研究重大项目前期研究专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学轻工技术与工程化学工程更多>>
- 高效液相色谱质谱法测定格尔德霉素基因阻断变株产物被引量：1
- 2008年
- 目的:在研究格尔德霉素(GDM)生物合成的过程中利用基因阻断技术分别阻断 GDM 生物合成的起始基因3-氨基-5-羟基苯甲酸(AHBA)基因、含 AHBA 基因并与之相连的聚酮合酶(PKS)基因簇以及 GDM 生物合成相关的 PKS 和 PKS 后修饰基因簇 CT-PKS 获得3个 GDM 基因阻断变株。为了比较分析他们的次级代谢产物,采用高效液相色谱质谱法测定发酵液组分。方法:发酵液经过乙酸乙酯提取后用反相高效液相色谱分析。分析柱为迪马公司 Diamonsil^(TM)(钻石)C_(18)(4.6 mm×150 mm,5μm);流动相是40%～100%甲醇,30 min 梯度洗脱;流速1 mL·min^(-1);二极管阵列检测器(DAD),检测波长304nm。利用电喷雾质谱(ESI)通过正负离子扫描获得相应化合物的相对分子质量信息;利用质谱的源内裂解技术获得相应化合物的结构信息。结果:检测发现,阻断2个不同的 GDM 生物合成基因以后主要产生2个不同于 GDM 的化合物。结论:该方法可快速、准确地对基因工程变株发酵新产物进行早期鉴别,指引后续的化学分离,并用于其他 GDM 基因阻断变株产物的定性。
- 李京艳赫卫清孙桂芝王以光
- 关键词：发酵产物高效液相色谱电喷雾质谱
- Geldanamycin产生菌生物合成相关基因的克隆与分析被引量：8
- 2002年
- 目的 从 geldanamycin产生菌吸水链霉菌 (S.hygroscopicus)中克隆生物合成基因 ,为阐明生物合成机制及改造其结构奠定基础。方法 以链霉菌 /大肠埃希氏菌穿梭 cosmids p KC5 0 5为载体构建了插入片段为 2 0～ 30 kb的 S.hygroscopicus总 DNA文库。以利福霉素中与 3-氨基 - 5 -羟基苯甲酸 (AHBA)合成相关基因为探针 ,经菌落杂交 ,Southern杂交筛选同源基因片段。测序结果与 Genbank进行同源性比较分析 ,并以attp- 噬菌体载体 KC5 15利用基因阻断实验对克隆的基因片段进行功能鉴定。结果 构建的基因文库含重组基因比率高、基因组覆盖率高 ,稳定性好。经同源基因探针杂交 ,从文库中筛选出 9个阳性 cosmids克隆p CGB2 0、p CGB2 6、p CGB2 8、p CGB2 9、p CGB36、p CGB45、p CGB49、p CGB6 3、p CGB75。测序分析表明 ,cosmidp CGB2 0中 Bam HI- Bam HI 8kb片段两端的不完整 ORF编码蛋白与竹桃霉素 (oleandomycin) PKS Module 5、Module 6 (一致性为 79% )和红霉内酯合成酶 ORF2 (一致性为 75 % )、ORF1(一致性为 73% )、ORF3(一致性为 70 % )高度同源 ;Bam HI- Bam HI3kb片段一端与编码类结核分枝杆菌的磷酸吡哆醛依赖的氨基转移酶家族中半胱氨酸脱硫酶的 DNA有同源性 ,该家族与 AHBA合成酶关系密切。
- 高群杰尚广东杨樱孙桂芝王以光陶佩珍娄志贤姚天爵
- 关键词：GELDANAMYCIN生物合成基因基因文库基因阻断
- 吸水链霉菌17997产生氢醌型格尔德霉素及其生物合成中间产物被引量：1
- 2011年
- 目的了解格尔德霉素生物合成PKS后修饰过程中的一些细节。方法对格尔德霉素产生菌吸水链霉菌17997及其格尔德霉素生物合成聚酮合酶（polyketide synthase，PKS）后修饰基因阻断变株（gdmP和gdmN）在ISPII平板不同时间的培养物进行乙酸乙酯提取，硅胶板TLC和NaOH显色分析，检测GDM及其生物合成中间产物，并利用LC-MS对中间产物进行鉴定。结果吸水链霉菌17997原株、gdmN和gdmP-变株在培养时间72～96h，发现氢醌型格尔德霉素（GQH2）、氢醌型4，5-双氢-7-去氨甲酰基-7-羟基格尔德霉素（H，GQH2-dC）和氢醌型4，5-双氢格尔德霉素（H2GQH2）分别为主要组分，相应的醌型化合物为次要组分；之后，这些氢醌型化合物随培养时间延长逐渐消失，相应的醌型化合物成为主要组分。双向硅胶板TLC分析证实GQH2、H2GQH2-dC和IH2GQH2均可在空气中自发氧化为相应的醌型化合物。结论在吸水链霉菌17997的GDM生物合成PKS后修饰过程中，首次提出GQH2自发氧化为GDM可能是氢醌型向醌型转变的位点，同时它也是GDM生物合成最后一步。
- 贾长虹刘昕赫卫清林灵张侃王红远孙桂芝王以光武临专
- 关键词：格尔德霉素生物合成
- 螺旋链霉菌U-1941中PKSII型基因在淡青链霉菌tcmK变异株中的克隆(I)
- 2005年
- 利用螺旋霉素产生菌螺旋链霉菌(S trep tomy ces sp iramy ceticus U-1941)中发现的PK S II型基因,经测序和同源性比较证明在4174bp片段中含有PK S II型K S(K Sα)基因,该基因(pCG 4-K,aspA)由1229bp组成编码432个氨基酸,与产二素链霉菌A lpA和淡青链霉菌T cmK同源性分别为74.4%和69.7%。将含aspA基因的重组质粒pCG 4在四并菌素(tetracenom yc in C)产生菌(S.g laucescens GLA 4-26)tcmK基因缺陷型变异株中进行克隆,TLC分析表明转化子的发酵产物比对照株多一个明显的黄色斑点,该物质经分离、提纯后分析确定为一个含苯式结构的小分子化合物A S-5。
- 王以光戴剑漉李京艳孙桂芝陈目方
- 关键词：基因表达
- 快速鉴定格尔德霉素产生菌——吸水链霉菌17997中的洋橄榄叶素被引量：3
- 2011年
- 对格尔德霉素产生菌吸水链霉菌17997的发酵液乙酸乙酯提取物进行了硅胶板TLC初步分离和NaOH溶液喷涂显色,对显红色、具有抗革兰阳性菌活性的条带进行了HPLC分析,提示抗革兰阳性菌活性化合物可能为大环二内酯类抗生素洋橄榄叶素;以dTDP-葡萄糖-4,6-脱水酶(Tgd)基因保守区设计PCR引物,扩增了吸水链霉菌17997基因组DNA中的tgd并进行了序列分析,表明吸水链霉菌17997含有洋橄榄叶素生物合成基因簇中的tgd基因;对NaOH溶液喷涂显红色的化合物进行LC-(+)-ESI-MS分析,证实其为洋橄榄叶素。因此,吸水链霉菌17997产生洋橄榄叶素;同时,建立了一种快速鉴定洋橄榄叶素及其产生菌的方法,主要包括TLC硅胶板分离、NaOH溶液显色、HPLC和LC-MS分析,以及tgd的PCR检测与序列分析。
- 李书芬武临专陈菲菲王红远孙桂芝王以光
- 关键词：格尔德霉素
- 一种检测安丝菌素浓度和发酵效价的生物检定板、其制备及应用
- 本发明涉及一种用于检测安丝菌素效价的生物检定板，其特征在于，所述的生物检定板的制备过程如下：(1)木霉培养：取冷冻保藏的木霉CGMCC 16489孢子悬液，均匀涂布于PDA培养基平板，28℃培养5～7天，获得长满绿色孢子...
- 武临专王静孙桂芝张涛余利岩李书芬江冰娅
- 文献传递
- 4,5-双氢-7-去氨甲酰基-7-羟基-19-S-甲基格尔德霉素及其与格尔德霉素生物合成PKS后修饰的关系被引量：1
- 2012年
- 目的在吸水链霉菌17997格尔德霉素生物合成PKS后修饰gdmN-变株发酵产物中寻找新格尔德霉素衍生物。方法 gdmN-变株发酵上清液乙酸乙酯提取后,进行硅胶板TLC分析;对一个红色目标化合物进行了HPLC和高分辨质谱分析,并对其进行了1H-和13C-核磁共振(NMR)分析;对红色目标化合物在吸水链霉菌17997格尔德霉素PKS基因阻断变株中进行了生物转化实验。结果在gdmN-变株发酵产物中发现了1个预期的红色目标化合物(4,5-双氢-7-去氨甲酰基-7-羟基-19-S-甲基格尔德霉素);该目标化合物可被格尔德霉素生物合成PKS后修饰系统7-O-氨甲酰化,生成4,5-双氢-19-S-甲基格尔德霉素。结论在gdmN-变株中发现了4,5-双氢-7-去氨甲酰基-7-羟基-19-S-甲基格尔德霉素;该化合物可被格尔德霉素PKS后修饰系统继续7-O-氨甲酰化,但不能C-4,5氧化。
- 牛沂菲武临专赫卫清李京艳刘昕倪四阳林灵王红远孙桂芝李书芬王以光
- Naphtho-[2,3-b]pyrandiones类抗生素SP-1的分离与结构研究被引量：1
- 2006年
- 在利用化学筛选法获得新染料类抗生素研究中,从产生菌Z-2002中,应用硅胶柱层析、薄层层析、凝胶柱层析及重结晶,分离纯化得到化合物SP-1,该化合物分子式为C_(14)H(12)O_6,分子量为276。SP-1与浓硫酸反应,呈鲜红色,对金黄色葡萄球菌209P有明显的抑制作用。通过UV、IR、EI-MS、HR-MS、~1H-NMR、^(13)C-NMR、DEPT、~1H-~1H COSY、”C一。H COSY、HMBC、比旋光度等光谱学数据分析,确定了SP-1的结构,证明该化合物与(+)-Cryptosporin一致并首次利用2D核磁共振数据明确了(+)-Cryptosporin结构中各个~1H、^(13)C信号的归属。
- 孙承航周建琴沈继虹汪月王振孙桂芝高凌玉金文藻
- 反相高效液相谱型分析检测吸水链霉菌17997变株发酵新产物被引量：5
- 2006年
- 以吸水链霉菌17997为出发菌株,分别阻断格尔德霉素(geldanamycin,GA)生物合成酶基因簇中的I型聚酮合酶(type I polyketide synthase,pks)基因的第6模块,单加氧酶(monooxygenase,gdmM)基因和氨甲酰基转移酶(carbamoyltransferase,ct)基因得到3种变株(pks-)、(gdmM-)和(ct-)。比较变株与原株发酵产物的H PLC谱型,结合紫外吸收图谱分析。检测结果表明各变株的GA生物合成均被阻断,并产生3个不同于原始菌株的新物质。这证明基因操作所涉及的pks,gdm M和ct基因是GA生物合成的必需基因;这些基因的阻断可产生不同于原株的新物质。HPLC谱型比较可以在多样化代谢产物的产生菌中快速、准确地发现基因工程变株发酵产物的变化,指导新化合物的分离鉴定,样品用量甚微,是化学早期鉴别的有力工具。
- 赫卫清李京艳孙桂芝刘玉瑛王以光
- 关键词：反相高效液相色谱基因阻断
- 必特霉素基因工程菌航天育种的研究被引量：3
- 2007年
- 探讨航天技术对必特霉素基因工程菌的育种效果。我国返回式搭载卫星对基因工程必特霉素菌种进行了航天育种，共搭载4个菌株以沙土、甘油、斜面等不同方式，经受航天环境条件处理后计算其孢子存活率、营养缺陷型出现率及菌株的发酵效价。在本实验条件下菌株的存活率均很低，尤其是沙土方式的致死率为100％，甘油及斜面孢子的致死率分别为99．79％～100％和99．81％～100％。营养缺陷型出现率为1．65％。存活菌株的负突变率高于正突变率。经筛选从408株正突变株获得了发酵效价提高11．3％～14．5％的菌株。航天技术有可能应用于基因工程必特霉素的育种，但适于其育种的空间条件必须经过详尽而细致的研究和控制。
- 王红远周红霞戴剑漉孙桂芝王以光
- 关键词：基因工程菌微生物育种营养缺陷型
